Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G138200.1
Synonym Sb07g021380
Functional annotation zinc finger A20 and AN1 domain-containing stress-associated protein, putative, expressed
UniProt C5YL95
Pfam PF01428 PF01754
Panther DB PTHR10634 PTHR10634:SF35
NCBI CDD KOG3173; Predicted Zn-finger protein
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008270; zinc ion binding GO:0003677DNA binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G36320 : A20/AN1-like zinc finger family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g33880.1 : zinc finger A20 and AN1 domain-containing stress-associated protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK12793
Barley HORVU5Hr1G104360.1
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G515350 - -
2 Sobic.001G398100 "MYB transcription factor ,phlobaphenes biosynthesis,seed color"(PubMedID : 20083611)@MYB family transcription factor, putative, expressed -
3 Sobic.004G095400 calcium-binding EF hand family protein, putative, expressed -
4 Sobic.003G443601 - -
5 Sobic.002G244901 - -
6 Sobic.004G273550 - -
7 Sobic.002G259900 expressed protein -
8 Sobic.008G068133 - -
9 Sobic.006G151100 oxygen-evolving enhancer protein 3, chloroplast precursor, putative, expressed -
10 Sobic.003G213500 expressed protein -
11 Sobic.003G278633 - -
12 Sobic.004G358150 - -
13 Sobic.004G045900 phytosulfokine receptor precursor, putative, expressed -
14 Sobic.003G375800 receptor-like protein kinase HAIKU2 precursor, putative, expressed -
15 Sobic.010G128200 expressed protein -
16 Sobic.008G016400 - -
17 Sobic.001G334400 protein kinase, putative, expressed -
18 Sobic.008G141700 heparanase-like protein precursor, putative, expressed K07964: heparanase
19 Sobic.001G369550 - -
20 Sobic.005G120101 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G138200 Sobic007G138200 Sobic001G515350 Sobic001G515350 Sobic007G138200--Sobic001G515350 Sobic001G398100 Sobic001G398100 Sobic007G138200--Sobic001G398100 Sobic004G095400 Sobic004G095400 Sobic007G138200--Sobic004G095400 Sobic003G443601 Sobic003G443601 Sobic007G138200--Sobic003G443601 Sobic002G244901 Sobic002G244901 Sobic007G138200--Sobic002G244901 Sobic004G273550 Sobic004G273550 Sobic007G138200--Sobic004G273550 Sobic002G259900 Sobic002G259900 Sobic007G138200--Sobic002G259900 Sobic008G068133 Sobic008G068133 Sobic007G138200--Sobic008G068133 Sobic006G151100 Sobic006G151100 Sobic007G138200--Sobic006G151100 Sobic001G515350--Sobic007G138200 Sobic001G515350--Sobic004G095400 Sobic001G515350--Sobic001G398100 Sobic001G515350--Sobic003G443601 Sobic001G515350--Sobic002G244901 Sobic004G358150 Sobic004G358150 Sobic001G515350--Sobic004G358150 Sobic003G375800 Sobic003G375800 Sobic001G515350--Sobic003G375800 Sobic001G515350--Sobic004G273550 Sobic001G334400 Sobic001G334400 Sobic001G515350--Sobic001G334400 Sobic001G398100--Sobic007G138200 Sobic001G398100--Sobic001G515350 Sobic001G398100--Sobic008G068133 Sobic006G110101 Sobic006G110101 Sobic001G398100--Sobic006G110101 Sobic001G398100--Sobic004G095400 Sobic001G369550 Sobic001G369550 Sobic001G398100--Sobic001G369550 Sobic005G120101 Sobic005G120101 Sobic001G398100--Sobic005G120101 Sobic003G213500 Sobic003G213500 Sobic001G398100--Sobic003G213500 Sobic001G230600 Sobic001G230600 Sobic001G398100--Sobic001G230600 Sobic004G095400--Sobic007G138200 Sobic004G095400--Sobic001G515350 Sobic010G128200 Sobic010G128200 Sobic004G095400--Sobic010G128200 Sobic004G095400--Sobic001G398100 Sobic004G095400--Sobic006G151100 Sobic004G095400--Sobic008G068133 Sobic004G095400--Sobic004G358150 Sobic004G095400--Sobic003G443601 Sobic004G095400--Sobic002G244901 Sobic008G141700 Sobic008G141700 Sobic003G443601--Sobic008G141700 Sobic003G443601--Sobic002G244901 Sobic002G377501 Sobic002G377501 Sobic003G443601--Sobic002G377501 Sobic009G216200 Sobic009G216200 Sobic003G443601--Sobic009G216200 Sobic003G443601--Sobic002G259900 Sobic003G443601--Sobic006G151100 Sobic010G105900 Sobic010G105900 Sobic003G443601--Sobic010G105900 Sobic008G016400 Sobic008G016400 Sobic003G443601--Sobic008G016400 Sobic003G069601 Sobic003G069601 Sobic003G443601--Sobic003G069601 Sobic002G244901--Sobic003G375800 Sobic002G244901--Sobic004G358150 Sobic002G086700 Sobic002G086700 Sobic002G244901--Sobic002G086700 Sobic002G244901--Sobic003G443601 Sobic002G244901--Sobic006G151100 Sobic003G078700 Sobic003G078700 Sobic002G244901--Sobic003G078700 Sobic002G244901--Sobic002G377501 Sobic010G210050 Sobic010G210050 Sobic002G244901--Sobic010G210050 Sobic009G223000 Sobic009G223000 Sobic002G244901--Sobic009G223000 Sobic010G015400 Sobic010G015400 Sobic004G273550--Sobic010G015400 Sobic007G224700 Sobic007G224700 Sobic004G273550--Sobic007G224700 Sobic008G153300 Sobic008G153300 Sobic004G273550--Sobic008G153300 Sobic006G118150 Sobic006G118150 Sobic004G273550--Sobic006G118150 Sobic007G077466 Sobic007G077466 Sobic004G273550--Sobic007G077466 Sobic002G274000 Sobic002G274000 Sobic004G273550--Sobic002G274000 Sobic009G079700 Sobic009G079700 Sobic004G273550--Sobic009G079700 Sobic009G183650 Sobic009G183650 Sobic004G273550--Sobic009G183650 Sobic004G007200 Sobic004G007200 Sobic004G273550--Sobic004G007200 Sobic003G278633 Sobic003G278633 Sobic002G259900--Sobic003G278633 Sobic002G259900--Sobic003G443601 Sobic002G259900--Sobic008G016400 Sobic002G259900--Sobic009G216200 Sobic002G259900--Sobic006G118150 Sobic002G259900--Sobic008G141700 Sobic002G259900--Sobic007G138200 Sobic002G259900--Sobic006G151100 Sobic002G259900--Sobic007G224700 Sobic008G068133--Sobic006G110101 Sobic008G068133--Sobic001G398100 Sobic008G068133--Sobic010G128200 Sobic008G068133--Sobic004G095400 Sobic008G068133--Sobic003G213500 Sobic008G068133--Sobic001G369550 Sobic005G048100 Sobic005G048100 Sobic008G068133--Sobic005G048100 Sobic002G345900 Sobic002G345900 Sobic008G068133--Sobic002G345900 Sobic008G139250 Sobic008G139250 Sobic008G068133--Sobic008G139250 Sobic006G141400 Sobic006G141400 Sobic006G151100--Sobic006G141400 Sobic006G151100--Sobic004G358150 Sobic007G007600 Sobic007G007600 Sobic006G151100--Sobic007G007600 Sobic007G064000 Sobic007G064000 Sobic006G151100--Sobic007G064000 Sobic006G151100--Sobic002G086700 Sobic006G151100--Sobic002G244901 Sobic002G036500 Sobic002G036500 Sobic006G151100--Sobic002G036500 Sobic005G031901 Sobic005G031901 Sobic006G151100--Sobic005G031901 Sobic002G175700 Sobic002G175700 Sobic006G151100--Sobic002G175700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.