Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G259900.1,Sobic.002G259900.2
Synonym Sb02g029490
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6QDI9 , A0A1B6QDJ5
Pfam PF13915 PF13915 PF13889
Panther DB PTHR13199 PTHR13199:SF15
NCBI CDD KOG2306; Uncharacterized conserved protein
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G26890 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g33520.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a047600
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G259900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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17 Sobic.010G015400 pentatricopeptide, putative, expressed -
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19 Sobic.008G153300 RING-H2 finger protein ATL3J, putative, expressed K10663: E3 ubiquitin-protein ligase ATL4
20 Sobic.001G334400 protein kinase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G259900 Sobic002G259900 Sobic003G278633 Sobic003G278633 Sobic002G259900--Sobic003G278633 Sobic003G443601 Sobic003G443601 Sobic002G259900--Sobic003G443601 Sobic008G016400 Sobic008G016400 Sobic002G259900--Sobic008G016400 Sobic009G216200 Sobic009G216200 Sobic002G259900--Sobic009G216200 Sobic006G118150 Sobic006G118150 Sobic002G259900--Sobic006G118150 Sobic008G141700 Sobic008G141700 Sobic002G259900--Sobic008G141700 Sobic007G138200 Sobic007G138200 Sobic002G259900--Sobic007G138200 Sobic006G151100 Sobic006G151100 Sobic002G259900--Sobic006G151100 Sobic007G224700 Sobic007G224700 Sobic002G259900--Sobic007G224700 Sobic009G018100 Sobic009G018100 Sobic003G278633--Sobic009G018100 Sobic003G278633--Sobic002G259900 Sobic009G066700 Sobic009G066700 Sobic003G278633--Sobic009G066700 Sobic004G273550 Sobic004G273550 Sobic003G278633--Sobic004G273550 Sobic003G278633--Sobic006G118150 Sobic002G097500 Sobic002G097500 Sobic003G278633--Sobic002G097500 Sobic003G278633--Sobic008G016400 Sobic010G015400 Sobic010G015400 Sobic003G278633--Sobic010G015400 Sobic003G278633--Sobic007G224700 Sobic003G443601--Sobic008G141700 Sobic002G244901 Sobic002G244901 Sobic003G443601--Sobic002G244901 Sobic002G377501 Sobic002G377501 Sobic003G443601--Sobic002G377501 Sobic003G443601--Sobic009G216200 Sobic003G443601--Sobic002G259900 Sobic003G443601--Sobic006G151100 Sobic010G105900 Sobic010G105900 Sobic003G443601--Sobic010G105900 Sobic003G443601--Sobic008G016400 Sobic003G069601 Sobic003G069601 Sobic003G443601--Sobic003G069601 Sobic001G424650 Sobic001G424650 Sobic008G016400--Sobic001G424650 Sobic007G077466 Sobic007G077466 Sobic008G016400--Sobic007G077466 Sobic008G016400--Sobic006G118150 Sobic009G183650 Sobic009G183650 Sobic008G016400--Sobic009G183650 Sobic001G212900 Sobic001G212900 Sobic008G016400--Sobic001G212900 Sobic009G149600 Sobic009G149600 Sobic008G016400--Sobic009G149600 Sobic001G334400 Sobic001G334400 Sobic008G016400--Sobic001G334400 Sobic004G224000 Sobic004G224000 Sobic008G016400--Sobic004G224000 Sobic001G492400 Sobic001G492400 Sobic008G016400--Sobic001G492400 Sobic009G216200--Sobic003G443601 Sobic005G131500 Sobic005G131500 Sobic009G216200--Sobic005G131500 Sobic009G216200--Sobic002G377501 Sobic009G204700 Sobic009G204700 Sobic009G216200--Sobic009G204700 Sobic009G216200--Sobic002G259900 Sobic006G089266 Sobic006G089266 Sobic009G216200--Sobic006G089266 Sobic006G085601 Sobic006G085601 Sobic009G216200--Sobic006G085601 Sobic004G267400 Sobic004G267400 Sobic009G216200--Sobic004G267400 Sobic003G433000 Sobic003G433000 Sobic009G216200--Sobic003G433000 Sobic006G118150--Sobic008G016400 Sobic006G118150--Sobic004G224000 Sobic006G118150--Sobic001G424650 Sobic006G118150--Sobic001G492400 Sobic009G122000 Sobic009G122000 Sobic006G118150--Sobic009G122000 Sobic003G149400 Sobic003G149400 Sobic006G118150--Sobic003G149400 Sobic006G118150--Sobic007G077466 Sobic001G503700 Sobic001G503700 Sobic006G118150--Sobic001G503700 Sobic006G165700 Sobic006G165700 Sobic006G118150--Sobic006G165700 Sobic008G141700--Sobic003G443601 Sobic008G141700--Sobic003G069601 Sobic009G088300 Sobic009G088300 Sobic008G141700--Sobic009G088300 Sobic008G141700--Sobic001G334400 Sobic008G141700--Sobic001G424650 Sobic006G255200 Sobic006G255200 Sobic008G141700--Sobic006G255200 Sobic010G129100 Sobic010G129100 Sobic008G141700--Sobic010G129100 Sobic008G141700--Sobic001G212900 Sobic004G127600 Sobic004G127600 Sobic008G141700--Sobic004G127600 Sobic001G515350 Sobic001G515350 Sobic007G138200--Sobic001G515350 Sobic001G398100 Sobic001G398100 Sobic007G138200--Sobic001G398100 Sobic004G095400 Sobic004G095400 Sobic007G138200--Sobic004G095400 Sobic007G138200--Sobic003G443601 Sobic007G138200--Sobic002G244901 Sobic007G138200--Sobic004G273550 Sobic007G138200--Sobic002G259900 Sobic008G068133 Sobic008G068133 Sobic007G138200--Sobic008G068133 Sobic007G138200--Sobic006G151100 Sobic006G141400 Sobic006G141400 Sobic006G151100--Sobic006G141400 Sobic004G358150 Sobic004G358150 Sobic006G151100--Sobic004G358150 Sobic007G007600 Sobic007G007600 Sobic006G151100--Sobic007G007600 Sobic007G064000 Sobic007G064000 Sobic006G151100--Sobic007G064000 Sobic002G086700 Sobic002G086700 Sobic006G151100--Sobic002G086700 Sobic006G151100--Sobic002G244901 Sobic002G036500 Sobic002G036500 Sobic006G151100--Sobic002G036500 Sobic005G031901 Sobic005G031901 Sobic006G151100--Sobic005G031901 Sobic002G175700 Sobic002G175700 Sobic006G151100--Sobic002G175700 Sobic007G224700--Sobic010G015400 Sobic008G153300 Sobic008G153300 Sobic007G224700--Sobic008G153300 Sobic007G224700--Sobic004G273550 Sobic010G187950 Sobic010G187950 Sobic007G224700--Sobic010G187950 Sobic007G224700--Sobic006G118150 Sobic003G438100 Sobic003G438100 Sobic007G224700--Sobic003G438100 Sobic004G167500 Sobic004G167500 Sobic007G224700--Sobic004G167500 Sobic002G215600 Sobic002G215600 Sobic007G224700--Sobic002G215600 Sobic002G274000 Sobic002G274000 Sobic007G224700--Sobic002G274000
Octagon: transcription factors


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