Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G224700.1
Synonym Sb07g028980, SOB5
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5RB84
Pfam -
Panther DB PTHR33347 PTHR33347:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G38790 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g37990.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a033717
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G015400 pentatricopeptide, putative, expressed -
2 Sobic.008G153300 RING-H2 finger protein ATL3J, putative, expressed K10663: E3 ubiquitin-protein ligase ATL4
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11 Sobic.002G426201 - -
12 Sobic.001G442750 - -
13 Sobic.009G018100 - -
14 Sobic.010G210400 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@- -
15 Sobic.010G168100 expressed protein -
16 Sobic.009G183650 - -
17 Sobic.008G016400 - -
18 Sobic.005G205100 expressed protein -
19 Sobic.008G005800 PMR5, putative, expressed -
20 Sobic.007G077466 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G224700 Sobic007G224700 Sobic010G015400 Sobic010G015400 Sobic007G224700--Sobic010G015400 Sobic008G153300 Sobic008G153300 Sobic007G224700--Sobic008G153300 Sobic004G273550 Sobic004G273550 Sobic007G224700--Sobic004G273550 Sobic010G187950 Sobic010G187950 Sobic007G224700--Sobic010G187950 Sobic006G118150 Sobic006G118150 Sobic007G224700--Sobic006G118150 Sobic003G438100 Sobic003G438100 Sobic007G224700--Sobic003G438100 Sobic004G167500 Sobic004G167500 Sobic007G224700--Sobic004G167500 Sobic002G215600 Sobic002G215600 Sobic007G224700--Sobic002G215600 Sobic002G274000 Sobic002G274000 Sobic007G224700--Sobic002G274000 Sobic010G015400--Sobic007G224700 Sobic010G015400--Sobic004G273550 Sobic010G015400--Sobic008G153300 Sobic010G015400--Sobic003G438100 Sobic010G015400--Sobic010G187950 Sobic010G168100 Sobic010G168100 Sobic010G015400--Sobic010G168100 Sobic005G205100 Sobic005G205100 Sobic010G015400--Sobic005G205100 Sobic010G015400--Sobic002G215600 Sobic009G018100 Sobic009G018100 Sobic010G015400--Sobic009G018100 Sobic008G153300--Sobic002G215600 Sobic008G153300--Sobic007G224700 Sobic008G153300--Sobic010G015400 Sobic008G153300--Sobic010G187950 Sobic008G153300--Sobic004G273550 Sobic008G153300--Sobic004G167500 Sobic008G153300--Sobic003G438100 Sobic009G079700 Sobic009G079700 Sobic008G153300--Sobic009G079700 Sobic007G210200 Sobic007G210200 Sobic008G153300--Sobic007G210200 Sobic004G273550--Sobic010G015400 Sobic004G273550--Sobic007G224700 Sobic004G273550--Sobic008G153300 Sobic004G273550--Sobic006G118150 Sobic007G077466 Sobic007G077466 Sobic004G273550--Sobic007G077466 Sobic004G273550--Sobic002G274000 Sobic004G273550--Sobic009G079700 Sobic009G183650 Sobic009G183650 Sobic004G273550--Sobic009G183650 Sobic004G007200 Sobic004G007200 Sobic004G273550--Sobic004G007200 Sobic001G228500 Sobic001G228500 Sobic010G187950--Sobic001G228500 Sobic010G187950--Sobic007G224700 Sobic002G043201 Sobic002G043201 Sobic010G187950--Sobic002G043201 Sobic010G187950--Sobic010G015400 Sobic010G187950--Sobic008G153300 Sobic010G187950--Sobic004G167500 Sobic002G426201 Sobic002G426201 Sobic010G187950--Sobic002G426201 Sobic010G187950--Sobic002G215600 Sobic010G187950--Sobic002G274000 Sobic008G016400 Sobic008G016400 Sobic006G118150--Sobic008G016400 Sobic004G224000 Sobic004G224000 Sobic006G118150--Sobic004G224000 Sobic001G424650 Sobic001G424650 Sobic006G118150--Sobic001G424650 Sobic001G492400 Sobic001G492400 Sobic006G118150--Sobic001G492400 Sobic009G122000 Sobic009G122000 Sobic006G118150--Sobic009G122000 Sobic003G149400 Sobic003G149400 Sobic006G118150--Sobic003G149400 Sobic006G118150--Sobic007G077466 Sobic001G503700 Sobic001G503700 Sobic006G118150--Sobic001G503700 Sobic006G165700 Sobic006G165700 Sobic006G118150--Sobic006G165700 Sobic003G438100--Sobic010G168100 Sobic003G438100--Sobic005G205100 Sobic001G442750 Sobic001G442750 Sobic003G438100--Sobic001G442750 Sobic006G161200 Sobic006G161200 Sobic003G438100--Sobic006G161200 Sobic001G310000 Sobic001G310000 Sobic003G438100--Sobic001G310000 Sobic003G337900 Sobic003G337900 Sobic003G438100--Sobic003G337900 Sobic008G030801 Sobic008G030801 Sobic003G438100--Sobic008G030801 Sobic003G438100--Sobic010G015400 Sobic003G071800 Sobic003G071800 Sobic003G438100--Sobic003G071800 Sobic003G059500 Sobic003G059500 Sobic004G167500--Sobic003G059500 Sobic004G167500--Sobic002G215600 Sobic006G049000 Sobic006G049000 Sobic004G167500--Sobic006G049000 Sobic004G167500--Sobic010G187950 Sobic003G356500 Sobic003G356500 Sobic004G167500--Sobic003G356500 Sobic004G167500--Sobic008G153300 Sobic001G071500 Sobic001G071500 Sobic004G167500--Sobic001G071500 Sobic004G167500--Sobic003G438100 Sobic001G468900 Sobic001G468900 Sobic004G167500--Sobic001G468900 Sobic002G215600--Sobic006G049000 Sobic002G215600--Sobic008G153300 Sobic002G215600--Sobic003G059500 Sobic002G215600--Sobic004G167500 Sobic004G045000 Sobic004G045000 Sobic002G215600--Sobic004G045000 Sobic002G215600--Sobic003G356500 Sobic002G215600--Sobic003G438100 Sobic002G215600--Sobic001G468900 Sobic001G367900 Sobic001G367900 Sobic002G215600--Sobic001G367900 Sobic004G218400 Sobic004G218400 Sobic002G274000--Sobic004G218400 Sobic001G334400 Sobic001G334400 Sobic002G274000--Sobic001G334400 Sobic006G268100 Sobic006G268100 Sobic002G274000--Sobic006G268100 Sobic003G067600 Sobic003G067600 Sobic002G274000--Sobic003G067600 Sobic003G001650 Sobic003G001650 Sobic002G274000--Sobic003G001650 Sobic004G173200 Sobic004G173200 Sobic002G274000--Sobic004G173200 Sobic005G110553 Sobic005G110553 Sobic002G274000--Sobic005G110553 Sobic002G309300 Sobic002G309300 Sobic002G274000--Sobic002G309300 Sobic001G370800 Sobic001G370800 Sobic002G274000--Sobic001G370800
Octagon: transcription factors


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