Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G118150.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RDK5
Pfam PF02365
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006355; regulation of transcription, DNA-templated GO:0003677DNA binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g01470.1 : no apical meristem protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G016400 - -
2 Sobic.004G224000 - -
3 Sobic.001G424650 - -
4 Sobic.001G492400 male sterility protein, putative, expressed K13356: alcohol-forming fatty acyl-CoA reductase
5 Sobic.009G122000 Annexin arabidopsis 3(PubMedID : 26320239)@annexin, putative, expressed -
6 Sobic.003G149400 lipase, putative, expressed -
7 Sobic.007G077466 - -
8 Sobic.001G503700 DUF677 domain containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.006G165700 - -
10 Sobic.007G224700 expressed protein -
11 Sobic.008G005800 PMR5, putative, expressed -
12 Sobic.002G274000 OsSub59 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
13 Sobic.002G097500 expressed protein -
14 Sobic.004G173200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@ammonium transporter protein, putative, expressed K03320: amt, AMT, ammonium transporter, Amt family
15 Sobic.009G088300 SHR5-receptor-like kinase, putative, expressed -
16 Sobic.004G081300 expressed protein -
17 Sobic.004G273550 - -
18 Sobic.001G466300 Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein, putative, expressed -
19 Sobic.007G010400 - -
20 Sobic.001G370800 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G118150 Sobic006G118150 Sobic008G016400 Sobic008G016400 Sobic006G118150--Sobic008G016400 Sobic004G224000 Sobic004G224000 Sobic006G118150--Sobic004G224000 Sobic001G424650 Sobic001G424650 Sobic006G118150--Sobic001G424650 Sobic001G492400 Sobic001G492400 Sobic006G118150--Sobic001G492400 Sobic009G122000 Sobic009G122000 Sobic006G118150--Sobic009G122000 Sobic003G149400 Sobic003G149400 Sobic006G118150--Sobic003G149400 Sobic007G077466 Sobic007G077466 Sobic006G118150--Sobic007G077466 Sobic001G503700 Sobic001G503700 Sobic006G118150--Sobic001G503700 Sobic006G165700 Sobic006G165700 Sobic006G118150--Sobic006G165700 Sobic008G016400--Sobic001G424650 Sobic008G016400--Sobic007G077466 Sobic008G016400--Sobic006G118150 Sobic009G183650 Sobic009G183650 Sobic008G016400--Sobic009G183650 Sobic001G212900 Sobic001G212900 Sobic008G016400--Sobic001G212900 Sobic009G149600 Sobic009G149600 Sobic008G016400--Sobic009G149600 Sobic001G334400 Sobic001G334400 Sobic008G016400--Sobic001G334400 Sobic008G016400--Sobic004G224000 Sobic008G016400--Sobic001G492400 Sobic004G224000--Sobic003G149400 Sobic008G065700 Sobic008G065700 Sobic004G224000--Sobic008G065700 Sobic004G224000--Sobic009G122000 Sobic004G224000--Sobic001G424650 Sobic005G110553 Sobic005G110553 Sobic004G224000--Sobic005G110553 Sobic010G249600 Sobic010G249600 Sobic004G224000--Sobic010G249600 Sobic004G224000--Sobic001G492400 Sobic004G224000--Sobic001G503700 Sobic004G224000--Sobic006G118150 Sobic009G088300 Sobic009G088300 Sobic001G424650--Sobic009G088300 Sobic001G424650--Sobic001G492400 Sobic001G424650--Sobic005G110553 Sobic001G370800 Sobic001G370800 Sobic001G424650--Sobic001G370800 Sobic001G442000 Sobic001G442000 Sobic001G424650--Sobic001G442000 Sobic001G424650--Sobic009G122000 Sobic001G424650--Sobic001G334400 Sobic001G424650--Sobic004G224000 Sobic006G255200 Sobic006G255200 Sobic001G424650--Sobic006G255200 Sobic001G492400--Sobic001G424650 Sobic002G187900 Sobic002G187900 Sobic001G492400--Sobic002G187900 Sobic001G492400--Sobic009G088300 Sobic004G173200 Sobic004G173200 Sobic001G492400--Sobic004G173200 Sobic001G492400--Sobic001G370800 Sobic001G492400--Sobic006G255200 Sobic003G225200 Sobic003G225200 Sobic001G492400--Sobic003G225200 Sobic002G262850 Sobic002G262850 Sobic001G492400--Sobic002G262850 Sobic008G177100 Sobic008G177100 Sobic001G492400--Sobic008G177100 Sobic009G122000--Sobic005G110553 Sobic009G122000--Sobic003G149400 Sobic009G122000--Sobic001G424650 Sobic009G122000--Sobic004G224000 Sobic007G010400 Sobic007G010400 Sobic009G122000--Sobic007G010400 Sobic009G122000--Sobic008G065700 Sobic007G210200 Sobic007G210200 Sobic009G122000--Sobic007G210200 Sobic010G019500 Sobic010G019500 Sobic009G122000--Sobic010G019500 Sobic001G367900 Sobic001G367900 Sobic009G122000--Sobic001G367900 Sobic003G149400--Sobic004G224000 Sobic003G149400--Sobic007G010400 Sobic003G149400--Sobic008G065700 Sobic003G149400--Sobic009G122000 Sobic003G149400--Sobic005G110553 Sobic003G149400--Sobic001G503700 Sobic003G149400--Sobic001G367900 Sobic002G001500 Sobic002G001500 Sobic003G149400--Sobic002G001500 Sobic003G149400--Sobic001G424650 Sobic001G191300 Sobic001G191300 Sobic007G077466--Sobic001G191300 Sobic007G077466--Sobic002G001500 Sobic007G077466--Sobic001G503700 Sobic003G118500 Sobic003G118500 Sobic007G077466--Sobic003G118500 Sobic004G305300 Sobic004G305300 Sobic007G077466--Sobic004G305300 Sobic003G362800 Sobic003G362800 Sobic007G077466--Sobic003G362800 Sobic002G110600 Sobic002G110600 Sobic007G077466--Sobic002G110600 Sobic010G000200 Sobic010G000200 Sobic007G077466--Sobic010G000200 Sobic007G077466--Sobic004G173200 Sobic009G223900 Sobic009G223900 Sobic001G503700--Sobic009G223900 Sobic001G503700--Sobic003G149400 Sobic001G503700--Sobic003G225200 Sobic001G503700--Sobic002G001500 Sobic001G503700--Sobic007G077466 Sobic001G503700--Sobic004G173200 Sobic001G503700--Sobic007G010400 Sobic001G503700--Sobic010G000200 Sobic001G503700--Sobic002G110600 Sobic006G165700--Sobic006G118150 Sobic006G165700--Sobic008G016400 Sobic006G165700--Sobic004G224000 Sobic006G165700--Sobic001G503700 Sobic006G165700--Sobic009G149600 Sobic006G165700--Sobic003G149400 Sobic007G226000 Sobic007G226000 Sobic006G165700--Sobic007G226000 Sobic006G165700--Sobic007G077466 Sobic009G223000 Sobic009G223000 Sobic006G165700--Sobic009G223000
Octagon: transcription factors


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