Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G097500.1
Synonym Sb02g008053
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1W0W367
Pfam PF08224
Panther DB PTHR33377 PTHR33377:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g02970.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G118150 - -
2 Sobic.003G278633 - -
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10 Sobic.008G016400 - -
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13 Sobic.004G224000 - -
14 Sobic.002G259900 expressed protein -
15 Sobic.002G253300 expressed protein -
16 Sobic.009G036366 - -
17 Sobic.009G223000 - -
18 Sobic.009G240300 chloroplast unusual positioning protein, putative, expressed -
19 Sobic.004G273550 - -
20 Sobic.006G078200 CHIT8 - Chitinase family protein precursor, expressed K01183: chitinase


Gene co-expression network
sample Sobic002G097500 Sobic002G097500 Sobic006G118150 Sobic006G118150 Sobic002G097500--Sobic006G118150 Sobic003G278633 Sobic003G278633 Sobic002G097500--Sobic003G278633 Sobic006G165700 Sobic006G165700 Sobic002G097500--Sobic006G165700 Sobic008G005800 Sobic008G005800 Sobic002G097500--Sobic008G005800 Sobic010G256866 Sobic010G256866 Sobic002G097500--Sobic010G256866 Sobic008G067700 Sobic008G067700 Sobic002G097500--Sobic008G067700 Sobic004G081300 Sobic004G081300 Sobic002G097500--Sobic004G081300 Sobic001G503700 Sobic001G503700 Sobic002G097500--Sobic001G503700 Sobic009G018100 Sobic009G018100 Sobic002G097500--Sobic009G018100 Sobic008G016400 Sobic008G016400 Sobic006G118150--Sobic008G016400 Sobic004G224000 Sobic004G224000 Sobic006G118150--Sobic004G224000 Sobic001G424650 Sobic001G424650 Sobic006G118150--Sobic001G424650 Sobic001G492400 Sobic001G492400 Sobic006G118150--Sobic001G492400 Sobic009G122000 Sobic009G122000 Sobic006G118150--Sobic009G122000 Sobic003G149400 Sobic003G149400 Sobic006G118150--Sobic003G149400 Sobic007G077466 Sobic007G077466 Sobic006G118150--Sobic007G077466 Sobic006G118150--Sobic001G503700 Sobic006G118150--Sobic006G165700 Sobic003G278633--Sobic009G018100 Sobic002G259900 Sobic002G259900 Sobic003G278633--Sobic002G259900 Sobic009G066700 Sobic009G066700 Sobic003G278633--Sobic009G066700 Sobic004G273550 Sobic004G273550 Sobic003G278633--Sobic004G273550 Sobic003G278633--Sobic006G118150 Sobic003G278633--Sobic002G097500 Sobic003G278633--Sobic008G016400 Sobic010G015400 Sobic010G015400 Sobic003G278633--Sobic010G015400 Sobic007G224700 Sobic007G224700 Sobic003G278633--Sobic007G224700 Sobic006G165700--Sobic006G118150 Sobic006G165700--Sobic008G016400 Sobic006G165700--Sobic004G224000 Sobic006G165700--Sobic001G503700 Sobic009G149600 Sobic009G149600 Sobic006G165700--Sobic009G149600 Sobic006G165700--Sobic003G149400 Sobic007G226000 Sobic007G226000 Sobic006G165700--Sobic007G226000 Sobic006G165700--Sobic007G077466 Sobic009G223000 Sobic009G223000 Sobic006G165700--Sobic009G223000 Sobic007G010400 Sobic007G010400 Sobic008G005800--Sobic007G010400 Sobic008G005800--Sobic007G077466 Sobic008G005800--Sobic001G503700 Sobic008G005800--Sobic006G118150 Sobic009G160100 Sobic009G160100 Sobic008G005800--Sobic009G160100 Sobic002G001500 Sobic002G001500 Sobic008G005800--Sobic002G001500 Sobic003G025300 Sobic003G025300 Sobic008G005800--Sobic003G025300 Sobic009G192933 Sobic009G192933 Sobic008G005800--Sobic009G192933 Sobic001G113400 Sobic001G113400 Sobic008G005800--Sobic001G113400 Sobic009G036366 Sobic009G036366 Sobic010G256866--Sobic009G036366 Sobic006G151100 Sobic006G151100 Sobic010G256866--Sobic006G151100 Sobic006G141400 Sobic006G141400 Sobic010G256866--Sobic006G141400 Sobic006G246400 Sobic006G246400 Sobic010G256866--Sobic006G246400 Sobic002G208850 Sobic002G208850 Sobic010G256866--Sobic002G208850 Sobic002G036500 Sobic002G036500 Sobic010G256866--Sobic002G036500 Sobic010G256866--Sobic009G223000 Sobic001G329001 Sobic001G329001 Sobic010G256866--Sobic001G329001 Sobic002G086700 Sobic002G086700 Sobic010G256866--Sobic002G086700 Sobic001G541232 Sobic001G541232 Sobic008G067700--Sobic001G541232 Sobic001G019601 Sobic001G019601 Sobic008G067700--Sobic001G019601 Sobic006G152100 Sobic006G152100 Sobic008G067700--Sobic006G152100 Sobic008G067700--Sobic009G036366 Sobic010G249600 Sobic010G249600 Sobic008G067700--Sobic010G249600 Sobic008G067700--Sobic001G503700 Sobic002G288500 Sobic002G288500 Sobic008G067700--Sobic002G288500 Sobic008G067700--Sobic009G149600 Sobic001G350300 Sobic001G350300 Sobic008G067700--Sobic001G350300 Sobic002G253300 Sobic002G253300 Sobic004G081300--Sobic002G253300 Sobic004G081300--Sobic007G010400 Sobic005G225901 Sobic005G225901 Sobic004G081300--Sobic005G225901 Sobic004G081300--Sobic006G118150 Sobic004G081300--Sobic003G149400 Sobic004G081300--Sobic008G005800 Sobic002G336500 Sobic002G336500 Sobic004G081300--Sobic002G336500 Sobic001G367900 Sobic001G367900 Sobic004G081300--Sobic001G367900 Sobic004G081300--Sobic004G224000 Sobic009G223900 Sobic009G223900 Sobic001G503700--Sobic009G223900 Sobic001G503700--Sobic003G149400 Sobic003G225200 Sobic003G225200 Sobic001G503700--Sobic003G225200 Sobic001G503700--Sobic002G001500 Sobic001G503700--Sobic007G077466 Sobic004G173200 Sobic004G173200 Sobic001G503700--Sobic004G173200 Sobic001G503700--Sobic007G010400 Sobic010G000200 Sobic010G000200 Sobic001G503700--Sobic010G000200 Sobic002G110600 Sobic002G110600 Sobic001G503700--Sobic002G110600 Sobic005G156201 Sobic005G156201 Sobic009G018100--Sobic005G156201 Sobic009G018100--Sobic009G066700 Sobic009G172100 Sobic009G172100 Sobic009G018100--Sobic009G172100 Sobic008G088812 Sobic008G088812 Sobic009G018100--Sobic008G088812 Sobic003G019500 Sobic003G019500 Sobic009G018100--Sobic003G019500 Sobic005G208425 Sobic005G208425 Sobic009G018100--Sobic005G208425 Sobic009G018100--Sobic003G278633 Sobic010G194801 Sobic010G194801 Sobic009G018100--Sobic010G194801 Sobic003G438100 Sobic003G438100 Sobic009G018100--Sobic003G438100
Octagon: transcription factors


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