Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G078200.1
Synonym Sb06g016510, ATHCHIB, PR3, B-CHI, HCHIB, PR-3, CHI-B
Functional annotation CHIT8 - Chitinase family protein precursor, expressed
UniProt A0A1Z5RCU2
Pfam PF00182
Panther DB PTHR22595 PTHR22595:SF34
NCBI CDD KOG4742; Predicted chitinase
KEGG Orthology K01183; chitinase
Gene Ontology GO:0016998; cell wall macromolecule catabolic process GO:0006032chitin catabolic process GO:0004568chitinase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G12500 : basic chitinase
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g51060.1 : CHIT8 - Chitinase family protein precursor, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a041699 , Zm00025a041698 , Zm00025a018536 , Zm00025a038131
Brachypodium KQK09291
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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19 Sobic.003G092150 - -
20 Sobic.009G018100 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G078200 Sobic006G078200 Sobic001G367900 Sobic001G367900 Sobic006G078200--Sobic001G367900 Sobic009G122000 Sobic009G122000 Sobic006G078200--Sobic009G122000 Sobic003G149400 Sobic003G149400 Sobic006G078200--Sobic003G149400 Sobic007G010400 Sobic007G010400 Sobic006G078200--Sobic007G010400 Sobic004G081300 Sobic004G081300 Sobic006G078200--Sobic004G081300 Sobic006G118150 Sobic006G118150 Sobic006G078200--Sobic006G118150 Sobic004G000500 Sobic004G000500 Sobic006G078200--Sobic004G000500 Sobic004G224000 Sobic004G224000 Sobic006G078200--Sobic004G224000 Sobic003G331200 Sobic003G331200 Sobic006G078200--Sobic003G331200 Sobic001G367900--Sobic007G010400 Sobic001G367900--Sobic003G149400 Sobic008G065700 Sobic008G065700 Sobic001G367900--Sobic008G065700 Sobic007G210200 Sobic007G210200 Sobic001G367900--Sobic007G210200 Sobic001G367900--Sobic003G331200 Sobic001G367900--Sobic004G000500 Sobic007G226000 Sobic007G226000 Sobic001G367900--Sobic007G226000 Sobic003G092150 Sobic003G092150 Sobic001G367900--Sobic003G092150 Sobic001G367900--Sobic009G122000 Sobic005G110553 Sobic005G110553 Sobic009G122000--Sobic005G110553 Sobic009G122000--Sobic003G149400 Sobic001G424650 Sobic001G424650 Sobic009G122000--Sobic001G424650 Sobic009G122000--Sobic004G224000 Sobic009G122000--Sobic007G010400 Sobic009G122000--Sobic008G065700 Sobic009G122000--Sobic007G210200 Sobic010G019500 Sobic010G019500 Sobic009G122000--Sobic010G019500 Sobic009G122000--Sobic001G367900 Sobic003G149400--Sobic004G224000 Sobic003G149400--Sobic007G010400 Sobic003G149400--Sobic008G065700 Sobic003G149400--Sobic009G122000 Sobic003G149400--Sobic005G110553 Sobic001G503700 Sobic001G503700 Sobic003G149400--Sobic001G503700 Sobic003G149400--Sobic001G367900 Sobic002G001500 Sobic002G001500 Sobic003G149400--Sobic002G001500 Sobic003G149400--Sobic001G424650 Sobic007G010400--Sobic003G149400 Sobic007G010400--Sobic001G367900 Sobic007G010400--Sobic001G503700 Sobic003G025300 Sobic003G025300 Sobic007G010400--Sobic003G025300 Sobic007G010400--Sobic002G001500 Sobic007G077466 Sobic007G077466 Sobic007G010400--Sobic007G077466 Sobic008G103400 Sobic008G103400 Sobic007G010400--Sobic008G103400 Sobic007G010400--Sobic009G122000 Sobic009G160100 Sobic009G160100 Sobic007G010400--Sobic009G160100 Sobic002G253300 Sobic002G253300 Sobic004G081300--Sobic002G253300 Sobic004G081300--Sobic007G010400 Sobic005G225901 Sobic005G225901 Sobic004G081300--Sobic005G225901 Sobic004G081300--Sobic006G118150 Sobic004G081300--Sobic003G149400 Sobic008G005800 Sobic008G005800 Sobic004G081300--Sobic008G005800 Sobic002G336500 Sobic002G336500 Sobic004G081300--Sobic002G336500 Sobic004G081300--Sobic001G367900 Sobic004G081300--Sobic004G224000 Sobic008G016400 Sobic008G016400 Sobic006G118150--Sobic008G016400 Sobic006G118150--Sobic004G224000 Sobic006G118150--Sobic001G424650 Sobic001G492400 Sobic001G492400 Sobic006G118150--Sobic001G492400 Sobic006G118150--Sobic009G122000 Sobic006G118150--Sobic003G149400 Sobic006G118150--Sobic007G077466 Sobic006G118150--Sobic001G503700 Sobic006G165700 Sobic006G165700 Sobic006G118150--Sobic006G165700 Sobic004G000500--Sobic003G331200 Sobic004G000500--Sobic001G367900 Sobic004G000500--Sobic007G210200 Sobic004G000500--Sobic007G010400 Sobic002G347750 Sobic002G347750 Sobic004G000500--Sobic002G347750 Sobic004G000500--Sobic003G149400 Sobic005G205100 Sobic005G205100 Sobic004G000500--Sobic005G205100 Sobic008G153300 Sobic008G153300 Sobic004G000500--Sobic008G153300 Sobic004G000500--Sobic009G122000 Sobic004G224000--Sobic003G149400 Sobic004G224000--Sobic008G065700 Sobic004G224000--Sobic009G122000 Sobic004G224000--Sobic001G424650 Sobic004G224000--Sobic005G110553 Sobic010G249600 Sobic010G249600 Sobic004G224000--Sobic010G249600 Sobic004G224000--Sobic001G492400 Sobic004G224000--Sobic001G503700 Sobic004G224000--Sobic006G118150 Sobic003G331200--Sobic004G000500 Sobic003G331200--Sobic001G367900 Sobic008G119100 Sobic008G119100 Sobic003G331200--Sobic008G119100 Sobic003G331200--Sobic007G210200 Sobic003G331200--Sobic003G092150 Sobic009G193600 Sobic009G193600 Sobic003G331200--Sobic009G193600 Sobic003G331200--Sobic002G347750 Sobic003G331200--Sobic008G065700 Sobic003G331200--Sobic007G226000
Octagon: transcription factors


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