Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G331200.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q6N0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G000500 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed K09560: suppressor of tumorigenicity protein 13
2 Sobic.001G367900 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@annexin, putative, expressed -
3 Sobic.008G119100 - -
4 Sobic.007G210200 Highest expression level in seeds(PubMedID : 27501690)@OsSPL14 - SBP-box gene family member, expressed -
5 Sobic.003G092150 - -
6 Sobic.009G193600 Eukaryotic aspartyl protease domain containing protein, expressed -
7 Sobic.002G347750 - -
8 Sobic.008G065700 RNA recognition motif containing protein, expressed -
9 Sobic.007G226000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@2-aminoethanethiol dioxygenase, putative, expressed K10712: cysteamine dioxygenase
10 Sobic.002G076450 - -
11 Sobic.002G015950 - -
12 Sobic.008G153300 RING-H2 finger protein ATL3J, putative, expressed K10663: E3 ubiquitin-protein ligase ATL4
13 Sobic.005G205100 expressed protein -
14 Sobic.002G215600 BRCA1 C Terminus domain containing protein, expressed -
15 Sobic.006G272100 OsFBX30 - F-box domain containing protein, expressed -
16 Sobic.003G149400 lipase, putative, expressed -
17 Sobic.001G524900 ribosomal protein L5, putative, expressed K02931: RP-L5, MRPL5, large subunit ribosomal protein L5
18 Sobic.006G049000 - -
19 Sobic.005G208425 - -
20 Sobic.007G010400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G331200 Sobic003G331200 Sobic004G000500 Sobic004G000500 Sobic003G331200--Sobic004G000500 Sobic001G367900 Sobic001G367900 Sobic003G331200--Sobic001G367900 Sobic008G119100 Sobic008G119100 Sobic003G331200--Sobic008G119100 Sobic007G210200 Sobic007G210200 Sobic003G331200--Sobic007G210200 Sobic003G092150 Sobic003G092150 Sobic003G331200--Sobic003G092150 Sobic009G193600 Sobic009G193600 Sobic003G331200--Sobic009G193600 Sobic002G347750 Sobic002G347750 Sobic003G331200--Sobic002G347750 Sobic008G065700 Sobic008G065700 Sobic003G331200--Sobic008G065700 Sobic007G226000 Sobic007G226000 Sobic003G331200--Sobic007G226000 Sobic004G000500--Sobic003G331200 Sobic004G000500--Sobic001G367900 Sobic004G000500--Sobic007G210200 Sobic007G010400 Sobic007G010400 Sobic004G000500--Sobic007G010400 Sobic004G000500--Sobic002G347750 Sobic003G149400 Sobic003G149400 Sobic004G000500--Sobic003G149400 Sobic005G205100 Sobic005G205100 Sobic004G000500--Sobic005G205100 Sobic008G153300 Sobic008G153300 Sobic004G000500--Sobic008G153300 Sobic009G122000 Sobic009G122000 Sobic004G000500--Sobic009G122000 Sobic001G367900--Sobic007G010400 Sobic001G367900--Sobic003G149400 Sobic001G367900--Sobic008G065700 Sobic001G367900--Sobic007G210200 Sobic001G367900--Sobic003G331200 Sobic001G367900--Sobic004G000500 Sobic001G367900--Sobic007G226000 Sobic001G367900--Sobic003G092150 Sobic001G367900--Sobic009G122000 Sobic002G076450 Sobic002G076450 Sobic008G119100--Sobic002G076450 Sobic010G051900 Sobic010G051900 Sobic008G119100--Sobic010G051900 Sobic001G524900 Sobic001G524900 Sobic008G119100--Sobic001G524900 Sobic008G119100--Sobic001G367900 Sobic008G119100--Sobic003G331200 Sobic008G119100--Sobic003G092150 Sobic005G040950 Sobic005G040950 Sobic008G119100--Sobic005G040950 Sobic009G047033 Sobic009G047033 Sobic008G119100--Sobic009G047033 Sobic008G119100--Sobic007G226000 Sobic007G210200--Sobic001G367900 Sobic005G110553 Sobic005G110553 Sobic007G210200--Sobic005G110553 Sobic007G210200--Sobic003G149400 Sobic007G210200--Sobic009G122000 Sobic007G210200--Sobic008G065700 Sobic007G210200--Sobic003G092150 Sobic004G224000 Sobic004G224000 Sobic007G210200--Sobic004G224000 Sobic007G210200--Sobic004G000500 Sobic007G210200--Sobic003G331200 Sobic003G092150--Sobic008G065700 Sobic003G092150--Sobic007G210200 Sobic003G092150--Sobic001G367900 Sobic003G092150--Sobic003G149400 Sobic003G092150--Sobic008G119100 Sobic003G092150--Sobic009G047033 Sobic003G092150--Sobic007G226000 Sobic003G092150--Sobic002G076450 Sobic003G092150--Sobic005G110553 Sobic002G015950 Sobic002G015950 Sobic009G193600--Sobic002G015950 Sobic006G037500 Sobic006G037500 Sobic009G193600--Sobic006G037500 Sobic004G071850 Sobic004G071850 Sobic009G193600--Sobic004G071850 Sobic009G193600--Sobic005G205100 Sobic001G273950 Sobic001G273950 Sobic009G193600--Sobic001G273950 Sobic003G260050 Sobic003G260050 Sobic009G193600--Sobic003G260050 Sobic003G111700 Sobic003G111700 Sobic009G193600--Sobic003G111700 Sobic009G043900 Sobic009G043900 Sobic009G193600--Sobic009G043900 Sobic006G049000 Sobic006G049000 Sobic009G193600--Sobic006G049000 Sobic002G375000 Sobic002G375000 Sobic002G347750--Sobic002G375000 Sobic002G347750--Sobic004G071850 Sobic002G347750--Sobic004G000500 Sobic002G347750--Sobic003G331200 Sobic001G432750 Sobic001G432750 Sobic002G347750--Sobic001G432750 Sobic002G347750--Sobic006G037500 Sobic002G347750--Sobic009G193600 Sobic006G118850 Sobic006G118850 Sobic002G347750--Sobic006G118850 Sobic001G311400 Sobic001G311400 Sobic002G347750--Sobic001G311400 Sobic008G065700--Sobic003G149400 Sobic008G065700--Sobic004G224000 Sobic008G065700--Sobic005G110553 Sobic008G065700--Sobic001G367900 Sobic008G065700--Sobic003G092150 Sobic008G065700--Sobic007G226000 Sobic008G065700--Sobic009G122000 Sobic008G065700--Sobic007G210200 Sobic002G377400 Sobic002G377400 Sobic008G065700--Sobic002G377400 Sobic007G226000--Sobic008G065700 Sobic007G185000 Sobic007G185000 Sobic007G226000--Sobic007G185000 Sobic010G249600 Sobic010G249600 Sobic007G226000--Sobic010G249600 Sobic007G226000--Sobic004G224000 Sobic007G226000--Sobic003G149400 Sobic007G226000--Sobic001G367900 Sobic009G240300 Sobic009G240300 Sobic007G226000--Sobic009G240300 Sobic003G440500 Sobic003G440500 Sobic007G226000--Sobic003G440500 Sobic007G226000--Sobic003G092150
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.