Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G193600.1
Synonym Sb09g025220
Functional annotation Eukaryotic aspartyl protease domain containing protein, expressed
UniProt A0A1Z5R4B7
Pfam PF14543
Panther DB PTHR13683 PTHR13683:SF264
NCBI CDD KOG1339; Aspartyl protease
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006508; proteolysis GO:0004190aspartic-type endopeptidase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G45120 : Eukaryotic aspartyl protease family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g43550.1 : Eukaryotic aspartyl protease domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a037916
Brachypodium KQK05459
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G015950 - -
2 Sobic.006G037500 triacylglycerol lipase 1 precursor, putative, expressed K01052: lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase
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16 Sobic.003G229900 - -
17 Sobic.006G049633 - -
18 Sobic.010G011500 - -
19 Sobic.006G118850 - -
20 Sobic.001G442750 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G193600 Sobic009G193600 Sobic002G015950 Sobic002G015950 Sobic009G193600--Sobic002G015950 Sobic006G037500 Sobic006G037500 Sobic009G193600--Sobic006G037500 Sobic004G071850 Sobic004G071850 Sobic009G193600--Sobic004G071850 Sobic005G205100 Sobic005G205100 Sobic009G193600--Sobic005G205100 Sobic001G273950 Sobic001G273950 Sobic009G193600--Sobic001G273950 Sobic003G260050 Sobic003G260050 Sobic009G193600--Sobic003G260050 Sobic003G111700 Sobic003G111700 Sobic009G193600--Sobic003G111700 Sobic009G043900 Sobic009G043900 Sobic009G193600--Sobic009G043900 Sobic006G049000 Sobic006G049000 Sobic009G193600--Sobic006G049000 Sobic002G015950--Sobic003G260050 Sobic002G015950--Sobic003G111700 Sobic002G015950--Sobic009G193600 Sobic001G310000 Sobic001G310000 Sobic002G015950--Sobic001G310000 Sobic010G194801 Sobic010G194801 Sobic002G015950--Sobic010G194801 Sobic010G011500 Sobic010G011500 Sobic002G015950--Sobic010G011500 Sobic002G015950--Sobic004G071850 Sobic002G266700 Sobic002G266700 Sobic002G015950--Sobic002G266700 Sobic002G015950--Sobic009G043900 Sobic009G043800 Sobic009G043800 Sobic006G037500--Sobic009G043800 Sobic002G191450 Sobic002G191450 Sobic006G037500--Sobic002G191450 Sobic001G064400 Sobic001G064400 Sobic006G037500--Sobic001G064400 Sobic002G114200 Sobic002G114200 Sobic006G037500--Sobic002G114200 Sobic006G037500--Sobic004G071850 Sobic006G037500--Sobic009G193600 Sobic009G019400 Sobic009G019400 Sobic006G037500--Sobic009G019400 Sobic004G221800 Sobic004G221800 Sobic006G037500--Sobic004G221800 Sobic006G037500--Sobic003G260050 Sobic004G071850--Sobic003G260050 Sobic004G071850--Sobic003G111700 Sobic004G071850--Sobic010G194801 Sobic003G019500 Sobic003G019500 Sobic004G071850--Sobic003G019500 Sobic004G071850--Sobic002G015950 Sobic004G071850--Sobic009G043900 Sobic004G071850--Sobic006G037500 Sobic004G071850--Sobic009G193600 Sobic002G202050 Sobic002G202050 Sobic004G071850--Sobic002G202050 Sobic003G438100 Sobic003G438100 Sobic005G205100--Sobic003G438100 Sobic006G161200 Sobic006G161200 Sobic005G205100--Sobic006G161200 Sobic010G168100 Sobic010G168100 Sobic005G205100--Sobic010G168100 Sobic005G205100--Sobic001G310000 Sobic005G205100--Sobic002G015950 Sobic003G337900 Sobic003G337900 Sobic005G205100--Sobic003G337900 Sobic005G156201 Sobic005G156201 Sobic005G205100--Sobic005G156201 Sobic005G205100--Sobic009G193600 Sobic005G205100--Sobic010G194801 Sobic001G273950--Sobic006G161200 Sobic008G030801 Sobic008G030801 Sobic001G273950--Sobic008G030801 Sobic006G141200 Sobic006G141200 Sobic001G273950--Sobic006G141200 Sobic001G071500 Sobic001G071500 Sobic001G273950--Sobic001G071500 Sobic001G273950--Sobic006G049000 Sobic003G229900 Sobic003G229900 Sobic001G273950--Sobic003G229900 Sobic006G049633 Sobic006G049633 Sobic001G273950--Sobic006G049633 Sobic010G215201 Sobic010G215201 Sobic001G273950--Sobic010G215201 Sobic002G054800 Sobic002G054800 Sobic001G273950--Sobic002G054800 Sobic003G260050--Sobic003G111700 Sobic003G260050--Sobic010G194801 Sobic003G260050--Sobic002G202050 Sobic006G247200 Sobic006G247200 Sobic003G260050--Sobic006G247200 Sobic003G260050--Sobic002G015950 Sobic003G281000 Sobic003G281000 Sobic003G260050--Sobic003G281000 Sobic003G111700--Sobic003G260050 Sobic003G111700--Sobic010G194801 Sobic003G111700--Sobic002G202050 Sobic003G111700--Sobic006G247200 Sobic003G111700--Sobic003G281000 Sobic010G143666 Sobic010G143666 Sobic003G111700--Sobic010G143666 Sobic009G043900--Sobic003G019500 Sobic009G043900--Sobic003G260050 Sobic009G043900--Sobic003G111700 Sobic009G043900--Sobic010G194801 Sobic009G043900--Sobic004G071850 Sobic009G043900--Sobic002G015950 Sobic008G088812 Sobic008G088812 Sobic009G043900--Sobic008G088812 Sobic009G043900--Sobic002G202050 Sobic006G049000--Sobic001G273950 Sobic002G215600 Sobic002G215600 Sobic006G049000--Sobic002G215600 Sobic006G049000--Sobic002G015950 Sobic006G049000--Sobic001G071500 Sobic006G049000--Sobic008G030801 Sobic001G442750 Sobic001G442750 Sobic006G049000--Sobic001G442750 Sobic006G049000--Sobic006G161200 Sobic004G167500 Sobic004G167500 Sobic006G049000--Sobic004G167500 Sobic006G049000--Sobic009G193600
Octagon: transcription factors


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