Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G273950.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S7V2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G161200 cysteine-rich repeat secretory protein precursor, putative, expressed -
2 Sobic.008G030801 - -
3 Sobic.006G141200 - -
4 Sobic.001G071500 - -
5 Sobic.006G049000 - -
6 Sobic.003G229900 - -
7 Sobic.006G049633 - -
8 Sobic.010G215201 - -
9 Sobic.002G054800 "O2(Ortholog in maize:Hartings et al., 1989)"(PubMedID : 31659852)@bZIP transcription factor domain containing protein, expressed -
10 Sobic.003G253650 - -
11 Sobic.007G007100 expressed protein -
12 Sobic.002G266700 - -
13 Sobic.010G011500 - -
14 Sobic.002G015950 - -
15 Sobic.008G061900 - -
16 Sobic.002G240200 expressed protein K19307: 25S rRNA (uracil2634-N3)-methyltransferase
17 Sobic.002G055000 bZIP transcription factor domain containing protein, expressed -
18 Sobic.001G297900 aminotransferase, classes I and II, domain containing protein, expressed K00652: 8-amino-7-oxononanoate synthase
19 Sobic.002G172300 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
20 Sobic.005G073300 limonoid UDP-glucosyltransferase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G273950 Sobic001G273950 Sobic006G161200 Sobic006G161200 Sobic001G273950--Sobic006G161200 Sobic008G030801 Sobic008G030801 Sobic001G273950--Sobic008G030801 Sobic006G141200 Sobic006G141200 Sobic001G273950--Sobic006G141200 Sobic001G071500 Sobic001G071500 Sobic001G273950--Sobic001G071500 Sobic006G049000 Sobic006G049000 Sobic001G273950--Sobic006G049000 Sobic003G229900 Sobic003G229900 Sobic001G273950--Sobic003G229900 Sobic006G049633 Sobic006G049633 Sobic001G273950--Sobic006G049633 Sobic010G215201 Sobic010G215201 Sobic001G273950--Sobic010G215201 Sobic002G054800 Sobic002G054800 Sobic001G273950--Sobic002G054800 Sobic006G161200--Sobic008G030801 Sobic006G161200--Sobic003G229900 Sobic006G161200--Sobic001G273950 Sobic006G161200--Sobic006G049633 Sobic002G055000 Sobic002G055000 Sobic006G161200--Sobic002G055000 Sobic010G011500 Sobic010G011500 Sobic006G161200--Sobic010G011500 Sobic008G061900 Sobic008G061900 Sobic006G161200--Sobic008G061900 Sobic006G161200--Sobic010G215201 Sobic005G205100 Sobic005G205100 Sobic006G161200--Sobic005G205100 Sobic008G030801--Sobic001G071500 Sobic008G030801--Sobic010G011500 Sobic001G297900 Sobic001G297900 Sobic008G030801--Sobic001G297900 Sobic008G030801--Sobic002G055000 Sobic008G030801--Sobic010G215201 Sobic001G480900 Sobic001G480900 Sobic008G030801--Sobic001G480900 Sobic008G030801--Sobic003G229900 Sobic008G030801--Sobic006G049633 Sobic008G030801--Sobic002G054800 Sobic003G149700 Sobic003G149700 Sobic006G141200--Sobic003G149700 Sobic002G132201 Sobic002G132201 Sobic006G141200--Sobic002G132201 Sobic006G141200--Sobic002G054800 Sobic006G141200--Sobic001G071500 Sobic006G141200--Sobic001G273950 Sobic003G245000 Sobic003G245000 Sobic006G141200--Sobic003G245000 Sobic005G073300 Sobic005G073300 Sobic006G141200--Sobic005G073300 Sobic006G141200--Sobic010G215201 Sobic003G253650 Sobic003G253650 Sobic006G141200--Sobic003G253650 Sobic001G071500--Sobic002G054800 Sobic001G071500--Sobic005G073300 Sobic002G240200 Sobic002G240200 Sobic001G071500--Sobic002G240200 Sobic001G071500--Sobic010G215201 Sobic001G071500--Sobic002G132201 Sobic001G071500--Sobic008G030801 Sobic002G172300 Sobic002G172300 Sobic001G071500--Sobic002G172300 Sobic001G071500--Sobic003G149700 Sobic001G371650 Sobic001G371650 Sobic001G071500--Sobic001G371650 Sobic006G049000--Sobic001G273950 Sobic002G215600 Sobic002G215600 Sobic006G049000--Sobic002G215600 Sobic002G015950 Sobic002G015950 Sobic006G049000--Sobic002G015950 Sobic006G049000--Sobic001G071500 Sobic006G049000--Sobic008G030801 Sobic001G442750 Sobic001G442750 Sobic006G049000--Sobic001G442750 Sobic006G049000--Sobic006G161200 Sobic004G167500 Sobic004G167500 Sobic006G049000--Sobic004G167500 Sobic009G193600 Sobic009G193600 Sobic006G049000--Sobic009G193600 Sobic003G229900--Sobic006G049633 Sobic003G229900--Sobic002G055000 Sobic003G229900--Sobic010G011500 Sobic003G229900--Sobic001G480900 Sobic002G266700 Sobic002G266700 Sobic003G229900--Sobic002G266700 Sobic004G296750 Sobic004G296750 Sobic003G229900--Sobic004G296750 Sobic003G229900--Sobic008G061900 Sobic007G007100 Sobic007G007100 Sobic003G229900--Sobic007G007100 Sobic009G019400 Sobic009G019400 Sobic003G229900--Sobic009G019400 Sobic006G049633--Sobic003G229900 Sobic006G049633--Sobic002G055000 Sobic006G049633--Sobic004G296750 Sobic006G049633--Sobic001G480900 Sobic006G049633--Sobic002G266700 Sobic006G049633--Sobic010G011500 Sobic006G049633--Sobic008G061900 Sobic003G281000 Sobic003G281000 Sobic006G049633--Sobic003G281000 Sobic006G049633--Sobic007G007100 Sobic010G215201--Sobic002G054800 Sobic010G215201--Sobic001G071500 Sobic010G215201--Sobic002G240200 Sobic010G215201--Sobic005G073300 Sobic010G215201--Sobic008G030801 Sobic010G215201--Sobic002G132201 Sobic010G215201--Sobic002G172300 Sobic010G215201--Sobic001G371650 Sobic001G421100 Sobic001G421100 Sobic010G215201--Sobic001G421100 Sobic002G054800--Sobic005G073300 Sobic002G054800--Sobic002G132201 Sobic002G054800--Sobic001G071500 Sobic002G054800--Sobic002G240200 Sobic002G054800--Sobic010G215201 Sobic002G054800--Sobic003G149700 Sobic002G054800--Sobic001G371650 Sobic009G022600 Sobic009G022600 Sobic002G054800--Sobic009G022600 Sobic002G054800--Sobic008G030801
Octagon: transcription factors


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