Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G061900.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt C5YT70
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G049633 - -
2 Sobic.003G229900 - -
3 Sobic.004G296750 - -
4 Sobic.002G055000 bZIP transcription factor domain containing protein, expressed -
5 Sobic.001G480900 glyoxalase family protein, putative, expressed -
6 Sobic.010G011500 - -
7 Sobic.002G266700 - -
8 Sobic.008G030801 - -
9 Sobic.001G297900 aminotransferase, classes I and II, domain containing protein, expressed K00652: 8-amino-7-oxononanoate synthase
10 Sobic.003G281000 - -
11 Sobic.007G007100 expressed protein -
12 Sobic.009G152350 - -
13 Sobic.006G161200 cysteine-rich repeat secretory protein precursor, putative, expressed -
14 Sobic.009G019400 - -
15 Sobic.002G202050 - -
16 Sobic.002G202050 - -
17 Sobic.002G202050 - -
18 Sobic.002G202050 - -
19 Sobic.006G247200 AMP-binding enzyme, putative, expressed -
20 Sobic.002G344800 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G061900 Sobic008G061900 Sobic006G049633 Sobic006G049633 Sobic008G061900--Sobic006G049633 Sobic003G229900 Sobic003G229900 Sobic008G061900--Sobic003G229900 Sobic004G296750 Sobic004G296750 Sobic008G061900--Sobic004G296750 Sobic002G055000 Sobic002G055000 Sobic008G061900--Sobic002G055000 Sobic001G480900 Sobic001G480900 Sobic008G061900--Sobic001G480900 Sobic010G011500 Sobic010G011500 Sobic008G061900--Sobic010G011500 Sobic002G266700 Sobic002G266700 Sobic008G061900--Sobic002G266700 Sobic008G030801 Sobic008G030801 Sobic008G061900--Sobic008G030801 Sobic001G297900 Sobic001G297900 Sobic008G061900--Sobic001G297900 Sobic006G049633--Sobic003G229900 Sobic006G049633--Sobic002G055000 Sobic006G049633--Sobic004G296750 Sobic006G049633--Sobic001G480900 Sobic006G049633--Sobic002G266700 Sobic006G049633--Sobic010G011500 Sobic006G049633--Sobic008G061900 Sobic003G281000 Sobic003G281000 Sobic006G049633--Sobic003G281000 Sobic007G007100 Sobic007G007100 Sobic006G049633--Sobic007G007100 Sobic003G229900--Sobic006G049633 Sobic003G229900--Sobic002G055000 Sobic003G229900--Sobic010G011500 Sobic003G229900--Sobic001G480900 Sobic003G229900--Sobic002G266700 Sobic003G229900--Sobic004G296750 Sobic003G229900--Sobic008G061900 Sobic003G229900--Sobic007G007100 Sobic009G019400 Sobic009G019400 Sobic003G229900--Sobic009G019400 Sobic004G296750--Sobic001G480900 Sobic004G296750--Sobic002G055000 Sobic004G296750--Sobic003G281000 Sobic004G296750--Sobic006G049633 Sobic004G296750--Sobic010G011500 Sobic004G296750--Sobic002G266700 Sobic002G202050 Sobic002G202050 Sobic004G296750--Sobic002G202050 Sobic002G055000--Sobic001G480900 Sobic002G055000--Sobic010G011500 Sobic002G055000--Sobic004G296750 Sobic002G055000--Sobic006G049633 Sobic002G055000--Sobic003G281000 Sobic002G055000--Sobic001G297900 Sobic002G055000--Sobic002G266700 Sobic002G055000--Sobic003G229900 Sobic002G055000--Sobic008G030801 Sobic001G480900--Sobic002G055000 Sobic001G480900--Sobic004G296750 Sobic001G480900--Sobic010G011500 Sobic001G480900--Sobic003G281000 Sobic001G480900--Sobic006G049633 Sobic001G480900--Sobic002G266700 Sobic001G480900--Sobic001G297900 Sobic001G480900--Sobic003G229900 Sobic001G480900--Sobic008G061900 Sobic010G011500--Sobic002G055000 Sobic010G011500--Sobic001G480900 Sobic010G011500--Sobic004G296750 Sobic010G011500--Sobic003G281000 Sobic010G011500--Sobic006G049633 Sobic010G011500--Sobic002G266700 Sobic010G011500--Sobic001G297900 Sobic010G011500--Sobic003G229900 Sobic010G011500--Sobic008G030801 Sobic002G266700--Sobic001G480900 Sobic002G266700--Sobic002G055000 Sobic002G266700--Sobic004G296750 Sobic002G266700--Sobic006G049633 Sobic002G266700--Sobic010G011500 Sobic002G266700--Sobic003G281000 Sobic002G266700--Sobic003G229900 Sobic002G266700--Sobic001G297900 Sobic002G266700--Sobic008G061900 Sobic001G071500 Sobic001G071500 Sobic008G030801--Sobic001G071500 Sobic008G030801--Sobic010G011500 Sobic008G030801--Sobic001G297900 Sobic008G030801--Sobic002G055000 Sobic010G215201 Sobic010G215201 Sobic008G030801--Sobic010G215201 Sobic008G030801--Sobic001G480900 Sobic008G030801--Sobic003G229900 Sobic008G030801--Sobic006G049633 Sobic002G054800 Sobic002G054800 Sobic008G030801--Sobic002G054800 Sobic001G297900--Sobic002G055000 Sobic001G297900--Sobic010G011500 Sobic001G297900--Sobic001G480900 Sobic001G297900--Sobic008G030801 Sobic001G297900--Sobic006G049633 Sobic001G297900--Sobic004G296750 Sobic001G297900--Sobic002G266700 Sobic001G297900--Sobic003G229900 Sobic001G297900--Sobic003G281000
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.