Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G043900.1
Synonym
Functional annotation O-methyltransferase, putative, expressed
UniProt A0A1B6P6J3
Pfam PF08100 PF00891
Panther DB PTHR11746 PTHR11746:SF86
NCBI CDD KOG3178; Hydroxyindole-O-methyltransferase and related SAM-dependent methyltransferases
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008171; O-methyltransferase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G35160 : O-methyltransferase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g43930.1 : O-methyltransferase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a002686 , Zm00025a002689 , Zm00025a013023 , Zm00025a002685 , Zm00025a052083
Brachypodium -
Barley HORVU1Hr1G076670.1 , HORVU1Hr1G076670.2
Wheat TraesCS1A02G335300 , TraesCS1D02G337500 , TraesCS1D02G337500
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.009G043900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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14 Sobic.006G037500 triacylglycerol lipase 1 precursor, putative, expressed K01052: lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase
15 Sobic.002G344800 - -
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17 Sobic.010G143666 - -
18 Sobic.002G014100 OsFBX212 - F-box domain containing protein, expressed -
19 Sobic.002G266700 - -
20 Sobic.008G004500 MRH1, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G043900 Sobic009G043900 Sobic003G019500 Sobic003G019500 Sobic009G043900--Sobic003G019500 Sobic003G260050 Sobic003G260050 Sobic009G043900--Sobic003G260050 Sobic003G111700 Sobic003G111700 Sobic009G043900--Sobic003G111700 Sobic010G194801 Sobic010G194801 Sobic009G043900--Sobic010G194801 Sobic004G071850 Sobic004G071850 Sobic009G043900--Sobic004G071850 Sobic002G015950 Sobic002G015950 Sobic009G043900--Sobic002G015950 Sobic008G088812 Sobic008G088812 Sobic009G043900--Sobic008G088812 Sobic002G202050 Sobic002G202050 Sobic009G043900--Sobic002G202050 Sobic003G019500--Sobic010G194801 Sobic003G019500--Sobic003G111700 Sobic005G156201 Sobic005G156201 Sobic003G019500--Sobic005G156201 Sobic003G019500--Sobic008G088812 Sobic003G019500--Sobic003G260050 Sobic003G019500--Sobic009G043900 Sobic003G019500--Sobic002G202050 Sobic003G260050--Sobic003G111700 Sobic003G260050--Sobic010G194801 Sobic003G260050--Sobic002G202050 Sobic006G247200 Sobic006G247200 Sobic003G260050--Sobic006G247200 Sobic003G260050--Sobic002G015950 Sobic003G281000 Sobic003G281000 Sobic003G260050--Sobic003G281000 Sobic003G111700--Sobic003G260050 Sobic003G111700--Sobic010G194801 Sobic003G111700--Sobic002G202050 Sobic003G111700--Sobic006G247200 Sobic003G111700--Sobic003G281000 Sobic010G143666 Sobic010G143666 Sobic003G111700--Sobic010G143666 Sobic010G194801--Sobic003G111700 Sobic010G194801--Sobic003G019500 Sobic010G194801--Sobic003G260050 Sobic010G194801--Sobic008G088812 Sobic010G194801--Sobic002G202050 Sobic010G194801--Sobic006G247200 Sobic004G071850--Sobic003G260050 Sobic004G071850--Sobic003G111700 Sobic004G071850--Sobic010G194801 Sobic004G071850--Sobic003G019500 Sobic004G071850--Sobic002G015950 Sobic004G071850--Sobic009G043900 Sobic006G037500 Sobic006G037500 Sobic004G071850--Sobic006G037500 Sobic009G193600 Sobic009G193600 Sobic004G071850--Sobic009G193600 Sobic004G071850--Sobic002G202050 Sobic002G015950--Sobic003G260050 Sobic002G015950--Sobic003G111700 Sobic002G015950--Sobic009G193600 Sobic001G310000 Sobic001G310000 Sobic002G015950--Sobic001G310000 Sobic002G015950--Sobic010G194801 Sobic010G011500 Sobic010G011500 Sobic002G015950--Sobic010G011500 Sobic002G015950--Sobic004G071850 Sobic002G266700 Sobic002G266700 Sobic002G015950--Sobic002G266700 Sobic002G015950--Sobic009G043900 Sobic008G088812--Sobic010G194801 Sobic008G088812--Sobic003G019500 Sobic008G088812--Sobic005G156201 Sobic008G088812--Sobic003G111700 Sobic008G088812--Sobic003G260050 Sobic008G088812--Sobic001G310000 Sobic005G208425 Sobic005G208425 Sobic008G088812--Sobic005G208425 Sobic008G088812--Sobic009G043900 Sobic008G088812--Sobic002G015950 Sobic002G202050--Sobic002G202050 Sobic002G202050--Sobic006G247200 Sobic002G344800 Sobic002G344800 Sobic002G202050--Sobic002G344800 Sobic002G014100 Sobic002G014100 Sobic002G202050--Sobic002G014100 Sobic002G202050--Sobic010G143666 Sobic002G382200 Sobic002G382200 Sobic002G202050--Sobic002G382200 Sobic005G133750 Sobic005G133750 Sobic002G202050--Sobic005G133750
Octagon: transcription factors


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