Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G088812.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R6M3 , C6JRM5
Pfam PF12854 PF13041 PF14432 PF01535
Panther DB PTHR24015 PTHR24015:SF509
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G04780 : Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g06960.1 : pentatricopeptide, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a045079
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G194801 - -
2 Sobic.003G019500 - -
3 Sobic.005G156201 - -
4 Sobic.003G111700 - -
5 Sobic.003G260050 - -
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7 Sobic.005G208425 - -
8 Sobic.009G043900 O-methyltransferase, putative, expressed -
9 Sobic.002G015950 - -
10 Sobic.002G202050 - -
11 Sobic.002G202050 - -
12 Sobic.002G202050 - -
13 Sobic.002G202050 - -
14 Sobic.002G014100 OsFBX212 - F-box domain containing protein, expressed -
15 Sobic.009G172100 GRF zinc finger family protein, expressed -
16 Sobic.006G247200 AMP-binding enzyme, putative, expressed -
17 Sobic.002G344800 - -
18 Sobic.004G071850 - -
19 Sobic.003G281000 - -
20 Sobic.002G382200 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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