Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G081300.1
Synonym Sb04g006700
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XXI5
Pfam -
Panther DB PTHR33065 PTHR33065:SF17
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g39000.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G253300 expressed protein -
2 Sobic.007G010400 - -
3 Sobic.005G225901 - -
4 Sobic.006G118150 - -
5 Sobic.003G149400 lipase, putative, expressed -
6 Sobic.008G005800 PMR5, putative, expressed -
7 Sobic.002G336500 OsFBLD5 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
8 Sobic.001G367900 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@annexin, putative, expressed -
9 Sobic.004G224000 - -
10 Sobic.010G168100 expressed protein -
11 Sobic.001G503700 DUF677 domain containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.009G122000 Annexin arabidopsis 3(PubMedID : 26320239)@annexin, putative, expressed -
13 Sobic.006G078200 CHIT8 - Chitinase family protein precursor, expressed K01183: chitinase
14 Sobic.003G025300 lectin protein kinase family protein, putative, expressed -
15 Sobic.001G466300 Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein, putative, expressed -
16 Sobic.004G071850 - -
17 Sobic.006G165700 - -
18 Sobic.001G450200 - -
19 Sobic.010G187950 - -
20 Sobic.008G065700 RNA recognition motif containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G081300 Sobic004G081300 Sobic002G253300 Sobic002G253300 Sobic004G081300--Sobic002G253300 Sobic007G010400 Sobic007G010400 Sobic004G081300--Sobic007G010400 Sobic005G225901 Sobic005G225901 Sobic004G081300--Sobic005G225901 Sobic006G118150 Sobic006G118150 Sobic004G081300--Sobic006G118150 Sobic003G149400 Sobic003G149400 Sobic004G081300--Sobic003G149400 Sobic008G005800 Sobic008G005800 Sobic004G081300--Sobic008G005800 Sobic002G336500 Sobic002G336500 Sobic004G081300--Sobic002G336500 Sobic001G367900 Sobic001G367900 Sobic004G081300--Sobic001G367900 Sobic004G224000 Sobic004G224000 Sobic004G081300--Sobic004G224000 Sobic002G253300--Sobic004G081300 Sobic007G114401 Sobic007G114401 Sobic002G253300--Sobic007G114401 Sobic003G231400 Sobic003G231400 Sobic002G253300--Sobic003G231400 Sobic009G046300 Sobic009G046300 Sobic002G253300--Sobic009G046300 Sobic007G135301 Sobic007G135301 Sobic002G253300--Sobic007G135301 Sobic002G253300--Sobic005G225901 Sobic001G028301 Sobic001G028301 Sobic002G253300--Sobic001G028301 Sobic005G035800 Sobic005G035800 Sobic002G253300--Sobic005G035800 Sobic002G097500 Sobic002G097500 Sobic002G253300--Sobic002G097500 Sobic007G010400--Sobic003G149400 Sobic007G010400--Sobic001G367900 Sobic001G503700 Sobic001G503700 Sobic007G010400--Sobic001G503700 Sobic003G025300 Sobic003G025300 Sobic007G010400--Sobic003G025300 Sobic002G001500 Sobic002G001500 Sobic007G010400--Sobic002G001500 Sobic007G077466 Sobic007G077466 Sobic007G010400--Sobic007G077466 Sobic008G103400 Sobic008G103400 Sobic007G010400--Sobic008G103400 Sobic009G122000 Sobic009G122000 Sobic007G010400--Sobic009G122000 Sobic009G160100 Sobic009G160100 Sobic007G010400--Sobic009G160100 Sobic010G168100 Sobic010G168100 Sobic005G225901--Sobic010G168100 Sobic005G225901--Sobic004G081300 Sobic005G225901--Sobic005G035800 Sobic003G438100 Sobic003G438100 Sobic005G225901--Sobic003G438100 Sobic008G061900 Sobic008G061900 Sobic005G225901--Sobic008G061900 Sobic009G152350 Sobic009G152350 Sobic005G225901--Sobic009G152350 Sobic007G116700 Sobic007G116700 Sobic005G225901--Sobic007G116700 Sobic004G296750 Sobic004G296750 Sobic005G225901--Sobic004G296750 Sobic003G337900 Sobic003G337900 Sobic005G225901--Sobic003G337900 Sobic008G016400 Sobic008G016400 Sobic006G118150--Sobic008G016400 Sobic006G118150--Sobic004G224000 Sobic001G424650 Sobic001G424650 Sobic006G118150--Sobic001G424650 Sobic001G492400 Sobic001G492400 Sobic006G118150--Sobic001G492400 Sobic006G118150--Sobic009G122000 Sobic006G118150--Sobic003G149400 Sobic006G118150--Sobic007G077466 Sobic006G118150--Sobic001G503700 Sobic006G165700 Sobic006G165700 Sobic006G118150--Sobic006G165700 Sobic003G149400--Sobic004G224000 Sobic003G149400--Sobic007G010400 Sobic008G065700 Sobic008G065700 Sobic003G149400--Sobic008G065700 Sobic003G149400--Sobic009G122000 Sobic005G110553 Sobic005G110553 Sobic003G149400--Sobic005G110553 Sobic003G149400--Sobic001G503700 Sobic003G149400--Sobic001G367900 Sobic003G149400--Sobic002G001500 Sobic003G149400--Sobic001G424650 Sobic008G005800--Sobic007G010400 Sobic008G005800--Sobic007G077466 Sobic008G005800--Sobic001G503700 Sobic008G005800--Sobic006G118150 Sobic008G005800--Sobic009G160100 Sobic008G005800--Sobic002G001500 Sobic008G005800--Sobic003G025300 Sobic009G192933 Sobic009G192933 Sobic008G005800--Sobic009G192933 Sobic001G113400 Sobic001G113400 Sobic008G005800--Sobic001G113400 Sobic002G336500--Sobic010G168100 Sobic002G336500--Sobic007G010400 Sobic002G043201 Sobic002G043201 Sobic002G336500--Sobic002G043201 Sobic010G187950 Sobic010G187950 Sobic002G336500--Sobic010G187950 Sobic002G336500--Sobic009G122000 Sobic002G336500--Sobic004G081300 Sobic002G336500--Sobic003G025300 Sobic002G336500--Sobic003G438100 Sobic002G336500--Sobic003G149400 Sobic001G367900--Sobic007G010400 Sobic001G367900--Sobic003G149400 Sobic001G367900--Sobic008G065700 Sobic007G210200 Sobic007G210200 Sobic001G367900--Sobic007G210200 Sobic003G331200 Sobic003G331200 Sobic001G367900--Sobic003G331200 Sobic004G000500 Sobic004G000500 Sobic001G367900--Sobic004G000500 Sobic007G226000 Sobic007G226000 Sobic001G367900--Sobic007G226000 Sobic003G092150 Sobic003G092150 Sobic001G367900--Sobic003G092150 Sobic001G367900--Sobic009G122000 Sobic004G224000--Sobic003G149400 Sobic004G224000--Sobic008G065700 Sobic004G224000--Sobic009G122000 Sobic004G224000--Sobic001G424650 Sobic004G224000--Sobic005G110553 Sobic010G249600 Sobic010G249600 Sobic004G224000--Sobic010G249600 Sobic004G224000--Sobic001G492400 Sobic004G224000--Sobic001G503700 Sobic004G224000--Sobic006G118150
Octagon: transcription factors


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