Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G450200.2,Sobic.001G450200.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QPJ1 , A0A1B6QPJ2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G071850 - -
2 Sobic.001G310000 - -
3 Sobic.003G111700 - -
4 Sobic.002G015950 - -
5 Sobic.010G168100 expressed protein -
6 Sobic.010G194801 - -
7 Sobic.008G088812 - -
8 Sobic.003G260050 - -
9 Sobic.003G071800 - -
10 Sobic.010G011500 - -
11 Sobic.003G281000 - -
12 Sobic.009G019400 - -
13 Sobic.004G296750 - -
14 Sobic.008G061900 - -
15 Sobic.001G480900 glyoxalase family protein, putative, expressed -
16 Sobic.009G152350 - -
17 Sobic.003G438100 expressed protein -
18 Sobic.006G049633 - -
19 Sobic.009G172100 GRF zinc finger family protein, expressed -
20 Sobic.005G156201 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G450200 Sobic001G450200 Sobic004G071850 Sobic004G071850 Sobic001G450200--Sobic004G071850 Sobic001G310000 Sobic001G310000 Sobic001G450200--Sobic001G310000 Sobic003G111700 Sobic003G111700 Sobic001G450200--Sobic003G111700 Sobic002G015950 Sobic002G015950 Sobic001G450200--Sobic002G015950 Sobic010G168100 Sobic010G168100 Sobic001G450200--Sobic010G168100 Sobic010G194801 Sobic010G194801 Sobic001G450200--Sobic010G194801 Sobic008G088812 Sobic008G088812 Sobic001G450200--Sobic008G088812 Sobic003G260050 Sobic003G260050 Sobic001G450200--Sobic003G260050 Sobic003G071800 Sobic003G071800 Sobic001G450200--Sobic003G071800 Sobic004G071850--Sobic003G260050 Sobic004G071850--Sobic003G111700 Sobic004G071850--Sobic010G194801 Sobic003G019500 Sobic003G019500 Sobic004G071850--Sobic003G019500 Sobic004G071850--Sobic002G015950 Sobic009G043900 Sobic009G043900 Sobic004G071850--Sobic009G043900 Sobic006G037500 Sobic006G037500 Sobic004G071850--Sobic006G037500 Sobic009G193600 Sobic009G193600 Sobic004G071850--Sobic009G193600 Sobic002G202050 Sobic002G202050 Sobic004G071850--Sobic002G202050 Sobic010G011500 Sobic010G011500 Sobic001G310000--Sobic010G011500 Sobic004G296750 Sobic004G296750 Sobic001G310000--Sobic004G296750 Sobic006G049633 Sobic006G049633 Sobic001G310000--Sobic006G049633 Sobic001G310000--Sobic003G111700 Sobic002G055000 Sobic002G055000 Sobic001G310000--Sobic002G055000 Sobic002G266700 Sobic002G266700 Sobic001G310000--Sobic002G266700 Sobic001G480900 Sobic001G480900 Sobic001G310000--Sobic001G480900 Sobic003G281000 Sobic003G281000 Sobic001G310000--Sobic003G281000 Sobic001G310000--Sobic010G194801 Sobic003G111700--Sobic003G260050 Sobic003G111700--Sobic010G194801 Sobic003G111700--Sobic002G202050 Sobic006G247200 Sobic006G247200 Sobic003G111700--Sobic006G247200 Sobic003G111700--Sobic003G281000 Sobic010G143666 Sobic010G143666 Sobic003G111700--Sobic010G143666 Sobic002G015950--Sobic003G260050 Sobic002G015950--Sobic003G111700 Sobic002G015950--Sobic009G193600 Sobic002G015950--Sobic001G310000 Sobic002G015950--Sobic010G194801 Sobic002G015950--Sobic010G011500 Sobic002G015950--Sobic004G071850 Sobic002G015950--Sobic002G266700 Sobic002G015950--Sobic009G043900 Sobic003G438100 Sobic003G438100 Sobic010G168100--Sobic003G438100 Sobic005G205100 Sobic005G205100 Sobic010G168100--Sobic005G205100 Sobic010G168100--Sobic001G310000 Sobic003G337900 Sobic003G337900 Sobic010G168100--Sobic003G337900 Sobic006G161200 Sobic006G161200 Sobic010G168100--Sobic006G161200 Sobic010G168100--Sobic003G071800 Sobic008G061900 Sobic008G061900 Sobic010G168100--Sobic008G061900 Sobic005G156201 Sobic005G156201 Sobic010G168100--Sobic005G156201 Sobic010G168100--Sobic003G019500 Sobic010G194801--Sobic003G111700 Sobic010G194801--Sobic003G019500 Sobic010G194801--Sobic003G260050 Sobic010G194801--Sobic008G088812 Sobic010G194801--Sobic002G202050 Sobic010G194801--Sobic006G247200 Sobic008G088812--Sobic010G194801 Sobic008G088812--Sobic003G019500 Sobic008G088812--Sobic005G156201 Sobic008G088812--Sobic003G111700 Sobic008G088812--Sobic003G260050 Sobic008G088812--Sobic001G310000 Sobic005G208425 Sobic005G208425 Sobic008G088812--Sobic005G208425 Sobic008G088812--Sobic009G043900 Sobic008G088812--Sobic002G015950 Sobic003G260050--Sobic003G111700 Sobic003G260050--Sobic010G194801 Sobic003G260050--Sobic002G202050 Sobic003G260050--Sobic006G247200 Sobic003G260050--Sobic002G015950 Sobic003G260050--Sobic003G281000 Sobic003G071800--Sobic010G168100 Sobic003G071800--Sobic006G161200 Sobic003G071800--Sobic003G438100 Sobic003G253650 Sobic003G253650 Sobic003G071800--Sobic003G253650 Sobic008G030801 Sobic008G030801 Sobic003G071800--Sobic008G030801 Sobic001G432750 Sobic001G432750 Sobic003G071800--Sobic001G432750 Sobic003G071800--Sobic008G061900 Sobic003G229900 Sobic003G229900 Sobic003G071800--Sobic003G229900 Sobic003G071800--Sobic006G049633
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.