Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G466300.1
Synonym Sb01g043750
Functional annotation Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein, putative, expressed
UniProt C5WTT7
Pfam PF01300
Panther DB PTHR17490
NCBI CDD KOG3051; RNA binding/translational regulation protein of the SUA5 family
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0003725; double-stranded RNA binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G60590 : DHBP synthase RibB-like alpha/beta domain
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g10450.1 : Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a001163
Brachypodium PNT77964 , KQK23064
Barley HORVU4Hr1G070260.9 , HORVU4Hr1G070260.5 , HORVU4Hr1G070260.4 , HORVU4Hr1G070260.7 , HORVU4Hr1G070260.6 , HORVU4Hr1G070260.1 , HORVU4Hr1G070260.3 , HORVU4Hr1G070260.8 , HORVU4Hr1G070260.2
Wheat TraesCS4A02G045600 , TraesCS4A02G045600 , TraesCS4B02G259200 , TraesCS4D02G259300
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic001G466300 Sobic001G466300 Sobic004G224000 Sobic004G224000 Sobic001G466300--Sobic004G224000 Sobic009G122000 Sobic009G122000 Sobic001G466300--Sobic009G122000 Sobic006G118150 Sobic006G118150 Sobic001G466300--Sobic006G118150 Sobic003G149400 Sobic003G149400 Sobic001G466300--Sobic003G149400 Sobic001G424650 Sobic001G424650 Sobic001G466300--Sobic001G424650 Sobic005G110553 Sobic005G110553 Sobic001G466300--Sobic005G110553 Sobic009G088300 Sobic009G088300 Sobic001G466300--Sobic009G088300 Sobic008G065700 Sobic008G065700 Sobic001G466300--Sobic008G065700 Sobic001G492400 Sobic001G492400 Sobic001G466300--Sobic001G492400 Sobic004G224000--Sobic003G149400 Sobic004G224000--Sobic008G065700 Sobic004G224000--Sobic009G122000 Sobic004G224000--Sobic001G424650 Sobic004G224000--Sobic005G110553 Sobic010G249600 Sobic010G249600 Sobic004G224000--Sobic010G249600 Sobic004G224000--Sobic001G492400 Sobic001G503700 Sobic001G503700 Sobic004G224000--Sobic001G503700 Sobic004G224000--Sobic006G118150 Sobic009G122000--Sobic005G110553 Sobic009G122000--Sobic003G149400 Sobic009G122000--Sobic001G424650 Sobic009G122000--Sobic004G224000 Sobic007G010400 Sobic007G010400 Sobic009G122000--Sobic007G010400 Sobic009G122000--Sobic008G065700 Sobic007G210200 Sobic007G210200 Sobic009G122000--Sobic007G210200 Sobic010G019500 Sobic010G019500 Sobic009G122000--Sobic010G019500 Sobic001G367900 Sobic001G367900 Sobic009G122000--Sobic001G367900 Sobic008G016400 Sobic008G016400 Sobic006G118150--Sobic008G016400 Sobic006G118150--Sobic004G224000 Sobic006G118150--Sobic001G424650 Sobic006G118150--Sobic001G492400 Sobic006G118150--Sobic009G122000 Sobic006G118150--Sobic003G149400 Sobic007G077466 Sobic007G077466 Sobic006G118150--Sobic007G077466 Sobic006G118150--Sobic001G503700 Sobic006G165700 Sobic006G165700 Sobic006G118150--Sobic006G165700 Sobic003G149400--Sobic004G224000 Sobic003G149400--Sobic007G010400 Sobic003G149400--Sobic008G065700 Sobic003G149400--Sobic009G122000 Sobic003G149400--Sobic005G110553 Sobic003G149400--Sobic001G503700 Sobic003G149400--Sobic001G367900 Sobic002G001500 Sobic002G001500 Sobic003G149400--Sobic002G001500 Sobic003G149400--Sobic001G424650 Sobic001G424650--Sobic009G088300 Sobic001G424650--Sobic001G492400 Sobic001G424650--Sobic005G110553 Sobic001G370800 Sobic001G370800 Sobic001G424650--Sobic001G370800 Sobic001G442000 Sobic001G442000 Sobic001G424650--Sobic001G442000 Sobic001G424650--Sobic009G122000 Sobic001G334400 Sobic001G334400 Sobic001G424650--Sobic001G334400 Sobic001G424650--Sobic004G224000 Sobic006G255200 Sobic006G255200 Sobic001G424650--Sobic006G255200 Sobic005G110553--Sobic009G122000 Sobic005G110553--Sobic001G424650 Sobic005G110553--Sobic003G149400 Sobic006G268100 Sobic006G268100 Sobic005G110553--Sobic006G268100 Sobic005G110553--Sobic008G065700 Sobic005G110553--Sobic004G224000 Sobic005G110553--Sobic001G334400 Sobic009G183650 Sobic009G183650 Sobic005G110553--Sobic009G183650 Sobic005G110553--Sobic007G210200 Sobic009G088300--Sobic001G424650 Sobic010G129100 Sobic010G129100 Sobic009G088300--Sobic010G129100 Sobic009G088300--Sobic001G370800 Sobic009G088300--Sobic001G442000 Sobic009G088300--Sobic006G255200 Sobic009G088300--Sobic001G492400 Sobic009G088300--Sobic001G334400 Sobic003G263900 Sobic003G263900 Sobic009G088300--Sobic003G263900 Sobic002G262850 Sobic002G262850 Sobic009G088300--Sobic002G262850 Sobic008G065700--Sobic003G149400 Sobic008G065700--Sobic004G224000 Sobic008G065700--Sobic005G110553 Sobic008G065700--Sobic001G367900 Sobic003G092150 Sobic003G092150 Sobic008G065700--Sobic003G092150 Sobic007G226000 Sobic007G226000 Sobic008G065700--Sobic007G226000 Sobic008G065700--Sobic009G122000 Sobic008G065700--Sobic007G210200 Sobic002G377400 Sobic002G377400 Sobic008G065700--Sobic002G377400 Sobic001G492400--Sobic001G424650 Sobic002G187900 Sobic002G187900 Sobic001G492400--Sobic002G187900 Sobic001G492400--Sobic009G088300 Sobic004G173200 Sobic004G173200 Sobic001G492400--Sobic004G173200 Sobic001G492400--Sobic001G370800 Sobic001G492400--Sobic006G255200 Sobic003G225200 Sobic003G225200 Sobic001G492400--Sobic003G225200 Sobic001G492400--Sobic002G262850 Sobic008G177100 Sobic008G177100 Sobic001G492400--Sobic008G177100
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