Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G273550.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RQA3
Pfam -
Panther DB PTHR36724 PTHR36724:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G65032 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g46839.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a048685 , Zm00025a021634
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G015400 pentatricopeptide, putative, expressed -
2 Sobic.007G224700 expressed protein -
3 Sobic.008G153300 RING-H2 finger protein ATL3J, putative, expressed K10663: E3 ubiquitin-protein ligase ATL4
4 Sobic.006G118150 - -
5 Sobic.007G077466 - -
6 Sobic.002G274000 OsSub59 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
7 Sobic.009G079700 C2 domain containing protein, putative, expressed -
8 Sobic.009G183650 - -
9 Sobic.004G007200 - -
10 Sobic.009G018100 - -
11 Sobic.008G016400 - -
12 Sobic.010G187950 - -
13 Sobic.005G205100 expressed protein -
14 Sobic.001G367900 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@annexin, putative, expressed -
15 Sobic.003G278633 - -
16 Sobic.009G066700 - -
17 Sobic.003G050800 Glucose-6-phosphate/phosphate translocator-related(PubMedID : 26465154)@SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@-(PubMedID : 26976818)@phosphate/phosphoenolpyruvate translocator-related protein, putative, expressed K15283: solute carrier family 35, member E1
18 Sobic.008G005800 PMR5, putative, expressed -
19 Sobic.003G438100 expressed protein -
20 Sobic.004G000500 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed K09560: suppressor of tumorigenicity protein 13


Gene co-expression network
sample Sobic004G273550 Sobic004G273550 Sobic010G015400 Sobic010G015400 Sobic004G273550--Sobic010G015400 Sobic007G224700 Sobic007G224700 Sobic004G273550--Sobic007G224700 Sobic008G153300 Sobic008G153300 Sobic004G273550--Sobic008G153300 Sobic006G118150 Sobic006G118150 Sobic004G273550--Sobic006G118150 Sobic007G077466 Sobic007G077466 Sobic004G273550--Sobic007G077466 Sobic002G274000 Sobic002G274000 Sobic004G273550--Sobic002G274000 Sobic009G079700 Sobic009G079700 Sobic004G273550--Sobic009G079700 Sobic009G183650 Sobic009G183650 Sobic004G273550--Sobic009G183650 Sobic004G007200 Sobic004G007200 Sobic004G273550--Sobic004G007200 Sobic010G015400--Sobic007G224700 Sobic010G015400--Sobic004G273550 Sobic010G015400--Sobic008G153300 Sobic003G438100 Sobic003G438100 Sobic010G015400--Sobic003G438100 Sobic010G187950 Sobic010G187950 Sobic010G015400--Sobic010G187950 Sobic010G168100 Sobic010G168100 Sobic010G015400--Sobic010G168100 Sobic005G205100 Sobic005G205100 Sobic010G015400--Sobic005G205100 Sobic002G215600 Sobic002G215600 Sobic010G015400--Sobic002G215600 Sobic009G018100 Sobic009G018100 Sobic010G015400--Sobic009G018100 Sobic007G224700--Sobic010G015400 Sobic007G224700--Sobic008G153300 Sobic007G224700--Sobic004G273550 Sobic007G224700--Sobic010G187950 Sobic007G224700--Sobic006G118150 Sobic007G224700--Sobic003G438100 Sobic004G167500 Sobic004G167500 Sobic007G224700--Sobic004G167500 Sobic007G224700--Sobic002G215600 Sobic007G224700--Sobic002G274000 Sobic008G153300--Sobic002G215600 Sobic008G153300--Sobic007G224700 Sobic008G153300--Sobic010G015400 Sobic008G153300--Sobic010G187950 Sobic008G153300--Sobic004G273550 Sobic008G153300--Sobic004G167500 Sobic008G153300--Sobic003G438100 Sobic008G153300--Sobic009G079700 Sobic007G210200 Sobic007G210200 Sobic008G153300--Sobic007G210200 Sobic008G016400 Sobic008G016400 Sobic006G118150--Sobic008G016400 Sobic004G224000 Sobic004G224000 Sobic006G118150--Sobic004G224000 Sobic001G424650 Sobic001G424650 Sobic006G118150--Sobic001G424650 Sobic001G492400 Sobic001G492400 Sobic006G118150--Sobic001G492400 Sobic009G122000 Sobic009G122000 Sobic006G118150--Sobic009G122000 Sobic003G149400 Sobic003G149400 Sobic006G118150--Sobic003G149400 Sobic006G118150--Sobic007G077466 Sobic001G503700 Sobic001G503700 Sobic006G118150--Sobic001G503700 Sobic006G165700 Sobic006G165700 Sobic006G118150--Sobic006G165700 Sobic001G191300 Sobic001G191300 Sobic007G077466--Sobic001G191300 Sobic002G001500 Sobic002G001500 Sobic007G077466--Sobic002G001500 Sobic007G077466--Sobic001G503700 Sobic003G118500 Sobic003G118500 Sobic007G077466--Sobic003G118500 Sobic004G305300 Sobic004G305300 Sobic007G077466--Sobic004G305300 Sobic003G362800 Sobic003G362800 Sobic007G077466--Sobic003G362800 Sobic002G110600 Sobic002G110600 Sobic007G077466--Sobic002G110600 Sobic010G000200 Sobic010G000200 Sobic007G077466--Sobic010G000200 Sobic004G173200 Sobic004G173200 Sobic007G077466--Sobic004G173200 Sobic004G218400 Sobic004G218400 Sobic002G274000--Sobic004G218400 Sobic001G334400 Sobic001G334400 Sobic002G274000--Sobic001G334400 Sobic006G268100 Sobic006G268100 Sobic002G274000--Sobic006G268100 Sobic003G067600 Sobic003G067600 Sobic002G274000--Sobic003G067600 Sobic003G001650 Sobic003G001650 Sobic002G274000--Sobic003G001650 Sobic002G274000--Sobic004G173200 Sobic005G110553 Sobic005G110553 Sobic002G274000--Sobic005G110553 Sobic002G309300 Sobic002G309300 Sobic002G274000--Sobic002G309300 Sobic001G370800 Sobic001G370800 Sobic002G274000--Sobic001G370800 Sobic010G210400 Sobic010G210400 Sobic009G079700--Sobic010G210400 Sobic009G079700--Sobic005G110553 Sobic009G079700--Sobic001G334400 Sobic009G079700--Sobic006G268100 Sobic009G079700--Sobic002G274000 Sobic009G079700--Sobic004G007200 Sobic009G079700--Sobic009G183650 Sobic004G343733 Sobic004G343733 Sobic009G079700--Sobic004G343733 Sobic009G079700--Sobic008G153300 Sobic009G183650--Sobic001G334400 Sobic009G183650--Sobic001G424650 Sobic009G183650--Sobic002G110600 Sobic009G183650--Sobic005G110553 Sobic010G019500 Sobic010G019500 Sobic009G183650--Sobic010G019500 Sobic004G072201 Sobic004G072201 Sobic009G183650--Sobic004G072201 Sobic004G068600 Sobic004G068600 Sobic009G183650--Sobic004G068600 Sobic009G088300 Sobic009G088300 Sobic009G183650--Sobic009G088300 Sobic009G183650--Sobic002G274000 Sobic006G024400 Sobic006G024400 Sobic004G007200--Sobic006G024400 Sobic003G234300 Sobic003G234300 Sobic004G007200--Sobic003G234300 Sobic004G007200--Sobic009G079700 Sobic002G037700 Sobic002G037700 Sobic004G007200--Sobic002G037700 Sobic004G007200--Sobic010G210400 Sobic004G007200--Sobic002G215600 Sobic006G111400 Sobic006G111400 Sobic004G007200--Sobic006G111400 Sobic001G367900 Sobic001G367900 Sobic004G007200--Sobic001G367900 Sobic008G159800 Sobic008G159800 Sobic004G007200--Sobic008G159800
Octagon: transcription factors


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