Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G045900.2
Synonym Sb04g003940
Functional annotation phytosulfokine receptor precursor, putative, expressed
UniProt A0A194YMR0
Pfam PF00560 PF08263
Panther DB PTHR27000 PTHR27000:SF209
NCBI CDD KOG0472; Leucine-rich repeat protein
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G72300 : Leucine-rich receptor-like protein kinase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g05930.1 : phytosulfokine receptor precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQJ93382 , KQJ93384
Barley HORVU6Hr1G023090.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G069400 - -
2 Sobic.004G343733 - -
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14 Sobic.009G163000 - -
15 Sobic.001G369550 - -
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17 Sobic.007G107900 expressed protein -
18 Sobic.009G028700 OsFBX115 - F-box domain containing protein, expressed -
19 Sobic.003G308900 expressed protein -
20 Sobic.008G137200 Mur ligase family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G045900 Sobic004G045900 Sobic009G069400 Sobic009G069400 Sobic004G045900--Sobic009G069400 Sobic004G343733 Sobic004G343733 Sobic004G045900--Sobic004G343733 Sobic008G052700 Sobic008G052700 Sobic004G045900--Sobic008G052700 Sobic003G213500 Sobic003G213500 Sobic004G045900--Sobic003G213500 Sobic003G375800 Sobic003G375800 Sobic004G045900--Sobic003G375800 Sobic001G062000 Sobic001G062000 Sobic004G045900--Sobic001G062000 Sobic001G515350 Sobic001G515350 Sobic004G045900--Sobic001G515350 Sobic005G221800 Sobic005G221800 Sobic004G045900--Sobic005G221800 Sobic002G244901 Sobic002G244901 Sobic004G045900--Sobic002G244901 Sobic003G308900 Sobic003G308900 Sobic009G069400--Sobic003G308900 Sobic005G135300 Sobic005G135300 Sobic009G069400--Sobic005G135300 Sobic002G296800 Sobic002G296800 Sobic009G069400--Sobic002G296800 Sobic009G069400--Sobic004G045900 Sobic002G091500 Sobic002G091500 Sobic009G069400--Sobic002G091500 Sobic009G253500 Sobic009G253500 Sobic009G069400--Sobic009G253500 Sobic004G304900 Sobic004G304900 Sobic009G069400--Sobic004G304900 Sobic008G131601 Sobic008G131601 Sobic009G069400--Sobic008G131601 Sobic010G265100 Sobic010G265100 Sobic009G069400--Sobic010G265100 Sobic010G054400 Sobic010G054400 Sobic004G343733--Sobic010G054400 Sobic002G180200 Sobic002G180200 Sobic004G343733--Sobic002G180200 Sobic009G047033 Sobic009G047033 Sobic004G343733--Sobic009G047033 Sobic001G070900 Sobic001G070900 Sobic004G343733--Sobic001G070900 Sobic007G182400 Sobic007G182400 Sobic004G343733--Sobic007G182400 Sobic010G213100 Sobic010G213100 Sobic004G343733--Sobic010G213100 Sobic004G343733--Sobic001G062000 Sobic009G079700 Sobic009G079700 Sobic004G343733--Sobic009G079700 Sobic003G091900 Sobic003G091900 Sobic004G343733--Sobic003G091900 Sobic006G031866 Sobic006G031866 Sobic008G052700--Sobic006G031866 Sobic001G120850 Sobic001G120850 Sobic008G052700--Sobic001G120850 Sobic003G003900 Sobic003G003900 Sobic008G052700--Sobic003G003900 Sobic002G113066 Sobic002G113066 Sobic008G052700--Sobic002G113066 Sobic003G152050 Sobic003G152050 Sobic008G052700--Sobic003G152050 Sobic003G077001 Sobic003G077001 Sobic008G052700--Sobic003G077001 Sobic005G035850 Sobic005G035850 Sobic008G052700--Sobic005G035850 Sobic001G463700 Sobic001G463700 Sobic008G052700--Sobic001G463700 Sobic005G214900 Sobic005G214900 Sobic008G052700--Sobic005G214900 Sobic008G068133 Sobic008G068133 Sobic003G213500--Sobic008G068133 Sobic003G213500--Sobic004G045900 Sobic006G110101 Sobic006G110101 Sobic003G213500--Sobic006G110101 Sobic004G095400 Sobic004G095400 Sobic003G213500--Sobic004G095400 Sobic010G128200 Sobic010G128200 Sobic003G213500--Sobic010G128200 Sobic007G138200 Sobic007G138200 Sobic003G213500--Sobic007G138200 Sobic001G398100 Sobic001G398100 Sobic003G213500--Sobic001G398100 Sobic003G213500--Sobic001G515350 Sobic001G369550 Sobic001G369550 Sobic003G213500--Sobic001G369550 Sobic003G375800--Sobic002G244901 Sobic004G358150 Sobic004G358150 Sobic003G375800--Sobic004G358150 Sobic002G086700 Sobic002G086700 Sobic003G375800--Sobic002G086700 Sobic009G223000 Sobic009G223000 Sobic003G375800--Sobic009G223000 Sobic006G151100 Sobic006G151100 Sobic003G375800--Sobic006G151100 Sobic010G133450 Sobic010G133450 Sobic003G375800--Sobic010G133450 Sobic010G129100 Sobic010G129100 Sobic003G375800--Sobic010G129100 Sobic003G262500 Sobic003G262500 Sobic003G375800--Sobic003G262500 Sobic005G196533 Sobic005G196533 Sobic003G375800--Sobic005G196533 Sobic001G062000--Sobic007G182400 Sobic001G062000--Sobic010G054400 Sobic001G062000--Sobic003G091900 Sobic001G062000--Sobic010G213100 Sobic001G062000--Sobic004G343733 Sobic001G062000--Sobic009G079700 Sobic002G377400 Sobic002G377400 Sobic001G062000--Sobic002G377400 Sobic001G529301 Sobic001G529301 Sobic001G062000--Sobic001G529301 Sobic003G056900 Sobic003G056900 Sobic001G062000--Sobic003G056900 Sobic001G515350--Sobic007G138200 Sobic001G515350--Sobic004G095400 Sobic001G515350--Sobic001G398100 Sobic003G443601 Sobic003G443601 Sobic001G515350--Sobic003G443601 Sobic001G515350--Sobic002G244901 Sobic001G515350--Sobic004G358150 Sobic001G515350--Sobic003G375800 Sobic004G273550 Sobic004G273550 Sobic001G515350--Sobic004G273550 Sobic001G334400 Sobic001G334400 Sobic001G515350--Sobic001G334400 Sobic005G221800--Sobic004G045900 Sobic005G221800--Sobic002G244901 Sobic005G221800--Sobic003G375800 Sobic010G196433 Sobic010G196433 Sobic005G221800--Sobic010G196433 Sobic005G221800--Sobic003G213500 Sobic003G236501 Sobic003G236501 Sobic005G221800--Sobic003G236501 Sobic007G107900 Sobic007G107900 Sobic005G221800--Sobic007G107900 Sobic005G221800--Sobic009G069400 Sobic009G162550 Sobic009G162550 Sobic005G221800--Sobic009G162550 Sobic002G244901--Sobic003G375800 Sobic002G244901--Sobic004G358150 Sobic002G244901--Sobic002G086700 Sobic002G244901--Sobic003G443601 Sobic002G244901--Sobic006G151100 Sobic003G078700 Sobic003G078700 Sobic002G244901--Sobic003G078700 Sobic002G377501 Sobic002G377501 Sobic002G244901--Sobic002G377501 Sobic010G210050 Sobic010G210050 Sobic002G244901--Sobic010G210050 Sobic002G244901--Sobic009G223000
Octagon: transcription factors


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