Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G052700.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PBN9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
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Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G031866 - -
2 Sobic.001G120850 - -
3 Sobic.003G003900 - -
4 Sobic.002G113066 - -
5 Sobic.003G152050 - -
6 Sobic.003G077001 - -
7 Sobic.005G035850 - -
8 Sobic.001G463700 - -
9 Sobic.005G214900 cytochrome P450, putative, expressed -
10 Sobic.001G135000 OsFBX85 - F-box domain containing protein, expressed -
11 Sobic.001G310133 - -
12 Sobic.008G098032 - -
13 Sobic.004G139800 - -
14 Sobic.007G141420 - -
15 Sobic.010G079150 - -
16 Sobic.001G415901 - -
17 Sobic.008G163750 - -
18 Sobic.010G216500 OsFBDUF34 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
19 Sobic.008G145700 expressed protein -
20 Sobic.006G221900 MBTB7 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein


Gene co-expression network
sample Sobic008G052700 Sobic008G052700 Sobic006G031866 Sobic006G031866 Sobic008G052700--Sobic006G031866 Sobic001G120850 Sobic001G120850 Sobic008G052700--Sobic001G120850 Sobic003G003900 Sobic003G003900 Sobic008G052700--Sobic003G003900 Sobic002G113066 Sobic002G113066 Sobic008G052700--Sobic002G113066 Sobic003G152050 Sobic003G152050 Sobic008G052700--Sobic003G152050 Sobic003G077001 Sobic003G077001 Sobic008G052700--Sobic003G077001 Sobic005G035850 Sobic005G035850 Sobic008G052700--Sobic005G035850 Sobic001G463700 Sobic001G463700 Sobic008G052700--Sobic001G463700 Sobic005G214900 Sobic005G214900 Sobic008G052700--Sobic005G214900 Sobic001G135000 Sobic001G135000 Sobic006G031866--Sobic001G135000 Sobic006G031866--Sobic001G463700 Sobic006G031866--Sobic005G035850 Sobic006G031866--Sobic003G003900 Sobic008G098032 Sobic008G098032 Sobic006G031866--Sobic008G098032 Sobic007G171300 Sobic007G171300 Sobic006G031866--Sobic007G171300 Sobic004G139800 Sobic004G139800 Sobic006G031866--Sobic004G139800 Sobic001G310133 Sobic001G310133 Sobic006G031866--Sobic001G310133 Sobic007G141420 Sobic007G141420 Sobic006G031866--Sobic007G141420 Sobic001G415901 Sobic001G415901 Sobic001G120850--Sobic001G415901 Sobic010G172600 Sobic010G172600 Sobic001G120850--Sobic010G172600 Sobic006G221900 Sobic006G221900 Sobic001G120850--Sobic006G221900 Sobic001G120850--Sobic003G077001 Sobic010G216500 Sobic010G216500 Sobic001G120850--Sobic010G216500 Sobic001G120850--Sobic002G113066 Sobic005G159100 Sobic005G159100 Sobic001G120850--Sobic005G159100 Sobic007G118700 Sobic007G118700 Sobic001G120850--Sobic007G118700 Sobic005G217400 Sobic005G217400 Sobic001G120850--Sobic005G217400 Sobic003G003900--Sobic002G113066 Sobic003G003900--Sobic003G077001 Sobic003G003900--Sobic005G035850 Sobic003G003900--Sobic005G214900 Sobic003G003900--Sobic001G310133 Sobic003G003900--Sobic001G415901 Sobic003G003900--Sobic004G139800 Sobic008G163750 Sobic008G163750 Sobic003G003900--Sobic008G163750 Sobic003G003900--Sobic001G120850 Sobic002G113066--Sobic003G077001 Sobic002G113066--Sobic003G003900 Sobic002G113066--Sobic001G415901 Sobic002G113066--Sobic005G214900 Sobic002G113066--Sobic001G120850 Sobic002G113066--Sobic005G159100 Sobic002G113066--Sobic006G221900 Sobic002G113066--Sobic005G035850 Sobic008G145700 Sobic008G145700 Sobic002G113066--Sobic008G145700 Sobic003G152050--Sobic005G035850 Sobic003G152050--Sobic004G139800 Sobic003G152050--Sobic008G098032 Sobic003G152050--Sobic001G310133 Sobic003G152050--Sobic005G214900 Sobic004G019250 Sobic004G019250 Sobic003G152050--Sobic004G019250 Sobic004G087750 Sobic004G087750 Sobic003G152050--Sobic004G087750 Sobic009G174200 Sobic009G174200 Sobic003G152050--Sobic009G174200 Sobic003G152050--Sobic003G003900 Sobic003G077001--Sobic002G113066 Sobic003G077001--Sobic003G003900 Sobic003G077001--Sobic001G415901 Sobic003G077001--Sobic005G159100 Sobic003G077001--Sobic006G221900 Sobic003G077001--Sobic001G120850 Sobic003G077001--Sobic008G145700 Sobic003G077001--Sobic005G214900 Sobic003G077001--Sobic010G172600 Sobic005G035850--Sobic004G139800 Sobic005G035850--Sobic001G310133 Sobic005G035850--Sobic008G098032 Sobic005G035850--Sobic005G214900 Sobic005G035850--Sobic003G003900 Sobic005G035850--Sobic004G019250 Sobic005G035850--Sobic002G113066 Sobic005G035850--Sobic004G087750 Sobic005G035850--Sobic009G174200 Sobic003G193400 Sobic003G193400 Sobic001G463700--Sobic003G193400 Sobic001G310400 Sobic001G310400 Sobic001G463700--Sobic001G310400 Sobic001G463700--Sobic005G217400 Sobic001G463700--Sobic001G135000 Sobic001G463700--Sobic007G141420 Sobic001G463700--Sobic001G120850 Sobic001G463700--Sobic006G031866 Sobic001G519500 Sobic001G519500 Sobic001G463700--Sobic001G519500 Sobic001G463700--Sobic007G118700 Sobic005G214900--Sobic005G035850 Sobic005G214900--Sobic003G003900 Sobic005G214900--Sobic002G113066 Sobic005G214900--Sobic001G310133 Sobic005G214900--Sobic004G139800 Sobic005G214900--Sobic003G077001 Sobic005G214900--Sobic008G098032 Sobic005G214900--Sobic008G163750 Sobic005G214900--Sobic003G152050
Octagon: transcription factors


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