Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G031866.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RCX7
Pfam PF07714
Panther DB PTHR27003 PTHR27003:SF8
NCBI CDD KOG1187; Serine/threonine protein kinase
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006468; protein phosphorylation GO:0004672protein kinase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G45910 : U-box domain-containing protein kinase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g39650.2 : protein kinase family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G135000 OsFBX85 - F-box domain containing protein, expressed -
2 Sobic.001G463700 - -
3 Sobic.005G035850 - -
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17 Sobic.003G152050 - -
18 Sobic.008G163750 - -
19 Sobic.003G193400 TKL_IRAK_DUF26-la.4 - DUF26 kinases have homology to DUF26 containing loci, expressed -
20 Sobic.004G087750 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G031866 Sobic006G031866 Sobic001G135000 Sobic001G135000 Sobic006G031866--Sobic001G135000 Sobic001G463700 Sobic001G463700 Sobic006G031866--Sobic001G463700 Sobic005G035850 Sobic005G035850 Sobic006G031866--Sobic005G035850 Sobic003G003900 Sobic003G003900 Sobic006G031866--Sobic003G003900 Sobic008G098032 Sobic008G098032 Sobic006G031866--Sobic008G098032 Sobic007G171300 Sobic007G171300 Sobic006G031866--Sobic007G171300 Sobic004G139800 Sobic004G139800 Sobic006G031866--Sobic004G139800 Sobic001G310133 Sobic001G310133 Sobic006G031866--Sobic001G310133 Sobic007G141420 Sobic007G141420 Sobic006G031866--Sobic007G141420 Sobic001G135000--Sobic006G031866 Sobic001G135000--Sobic001G463700 Sobic001G135000--Sobic007G171300 Sobic003G193400 Sobic003G193400 Sobic001G135000--Sobic003G193400 Sobic001G135000--Sobic007G141420 Sobic001G529301 Sobic001G529301 Sobic001G135000--Sobic001G529301 Sobic001G310400 Sobic001G310400 Sobic001G135000--Sobic001G310400 Sobic005G217400 Sobic005G217400 Sobic001G135000--Sobic005G217400 Sobic008G052700 Sobic008G052700 Sobic001G135000--Sobic008G052700 Sobic001G463700--Sobic003G193400 Sobic001G463700--Sobic001G310400 Sobic001G463700--Sobic005G217400 Sobic001G463700--Sobic001G135000 Sobic001G463700--Sobic007G141420 Sobic001G120850 Sobic001G120850 Sobic001G463700--Sobic001G120850 Sobic001G463700--Sobic006G031866 Sobic001G519500 Sobic001G519500 Sobic001G463700--Sobic001G519500 Sobic007G118700 Sobic007G118700 Sobic001G463700--Sobic007G118700 Sobic005G035850--Sobic004G139800 Sobic005G035850--Sobic001G310133 Sobic005G035850--Sobic008G098032 Sobic005G214900 Sobic005G214900 Sobic005G035850--Sobic005G214900 Sobic005G035850--Sobic003G003900 Sobic004G019250 Sobic004G019250 Sobic005G035850--Sobic004G019250 Sobic002G113066 Sobic002G113066 Sobic005G035850--Sobic002G113066 Sobic004G087750 Sobic004G087750 Sobic005G035850--Sobic004G087750 Sobic009G174200 Sobic009G174200 Sobic005G035850--Sobic009G174200 Sobic003G003900--Sobic002G113066 Sobic003G077001 Sobic003G077001 Sobic003G003900--Sobic003G077001 Sobic003G003900--Sobic005G035850 Sobic003G003900--Sobic005G214900 Sobic003G003900--Sobic001G310133 Sobic001G415901 Sobic001G415901 Sobic003G003900--Sobic001G415901 Sobic003G003900--Sobic004G139800 Sobic008G163750 Sobic008G163750 Sobic003G003900--Sobic008G163750 Sobic003G003900--Sobic001G120850 Sobic008G098032--Sobic004G139800 Sobic008G098032--Sobic004G019250 Sobic008G098032--Sobic004G087750 Sobic008G098032--Sobic009G174200 Sobic008G098032--Sobic005G035850 Sobic008G098032--Sobic001G310133 Sobic008G176401 Sobic008G176401 Sobic008G098032--Sobic008G176401 Sobic008G098032--Sobic005G214900 Sobic004G342700 Sobic004G342700 Sobic008G098032--Sobic004G342700 Sobic002G227400 Sobic002G227400 Sobic007G171300--Sobic002G227400 Sobic007G171300--Sobic006G031866 Sobic007G171300--Sobic001G135000 Sobic007G171300--Sobic001G529301 Sobic002G268450 Sobic002G268450 Sobic007G171300--Sobic002G268450 Sobic010G213100 Sobic010G213100 Sobic007G171300--Sobic010G213100 Sobic005G065400 Sobic005G065400 Sobic007G171300--Sobic005G065400 Sobic007G171300--Sobic008G052700 Sobic001G453150 Sobic001G453150 Sobic007G171300--Sobic001G453150 Sobic004G139800--Sobic008G098032 Sobic004G139800--Sobic005G035850 Sobic004G139800--Sobic004G019250 Sobic004G139800--Sobic001G310133 Sobic004G139800--Sobic004G087750 Sobic004G139800--Sobic009G174200 Sobic004G139800--Sobic005G214900 Sobic003G152050 Sobic003G152050 Sobic004G139800--Sobic003G152050 Sobic004G139800--Sobic003G003900 Sobic001G310133--Sobic005G035850 Sobic001G310133--Sobic004G139800 Sobic001G310133--Sobic008G098032 Sobic001G310133--Sobic005G214900 Sobic001G310133--Sobic004G019250 Sobic001G310133--Sobic003G003900 Sobic001G310133--Sobic004G087750 Sobic001G310133--Sobic009G174200 Sobic001G310133--Sobic003G152050 Sobic007G141420--Sobic001G310400 Sobic007G141420--Sobic005G217400 Sobic007G141420--Sobic003G193400 Sobic007G141420--Sobic001G120850 Sobic007G141420--Sobic001G463700 Sobic007G141420--Sobic007G118700 Sobic010G216500 Sobic010G216500 Sobic007G141420--Sobic010G216500 Sobic007G141420--Sobic006G031866 Sobic007G141420--Sobic001G415901
Octagon: transcription factors


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