Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G529301.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5SBZ6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g50188.1 : retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G135000 OsFBX85 - F-box domain containing protein, expressed -
2 Sobic.006G031866 - -
3 Sobic.007G171300 - -
4 Sobic.001G463700 - -
5 Sobic.003G390000 cytochrome P450, putative, expressed -
6 Sobic.001G486400 - -
7 Sobic.003G108300 expressed protein -
8 Sobic.001G062000 - -
9 Sobic.002G227400 Rf1, mitochondrial precursor, putative, expressed -
10 Sobic.010G054400 leucine-rich repeat family protein, putative, expressed -
11 Sobic.007G182400 - -
12 Sobic.010G213100 RNA-dependent RNA polymerase, putative, expressed K11699: RDR, RNA-dependent RNA polymerase
13 Sobic.004G343733 - -
14 Sobic.001G195866 - -
15 Sobic.003G193400 TKL_IRAK_DUF26-la.4 - DUF26 kinases have homology to DUF26 containing loci, expressed -
16 Sobic.006G075200 Aluminium activated malate transporter("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@aluminum-activated malate transporter, putative, expressed -
17 Sobic.007G149950 - -
18 Sobic.001G174200 GRAS family transcription factor containing protein, expressed -
19 Sobic.003G091900 - -
20 Sobic.002G326300 TKL_IRAK_DUF26-lh.9 - DUF26 kinases have homology to DUF26 containing loci, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G529301 Sobic001G529301 Sobic001G135000 Sobic001G135000 Sobic001G529301--Sobic001G135000 Sobic006G031866 Sobic006G031866 Sobic001G529301--Sobic006G031866 Sobic007G171300 Sobic007G171300 Sobic001G529301--Sobic007G171300 Sobic001G463700 Sobic001G463700 Sobic001G529301--Sobic001G463700 Sobic003G390000 Sobic003G390000 Sobic001G529301--Sobic003G390000 Sobic001G486400 Sobic001G486400 Sobic001G529301--Sobic001G486400 Sobic003G108300 Sobic003G108300 Sobic001G529301--Sobic003G108300 Sobic001G062000 Sobic001G062000 Sobic001G529301--Sobic001G062000 Sobic002G227400 Sobic002G227400 Sobic001G529301--Sobic002G227400 Sobic001G135000--Sobic006G031866 Sobic001G135000--Sobic001G463700 Sobic001G135000--Sobic007G171300 Sobic003G193400 Sobic003G193400 Sobic001G135000--Sobic003G193400 Sobic007G141420 Sobic007G141420 Sobic001G135000--Sobic007G141420 Sobic001G135000--Sobic001G529301 Sobic001G310400 Sobic001G310400 Sobic001G135000--Sobic001G310400 Sobic005G217400 Sobic005G217400 Sobic001G135000--Sobic005G217400 Sobic008G052700 Sobic008G052700 Sobic001G135000--Sobic008G052700 Sobic006G031866--Sobic001G135000 Sobic006G031866--Sobic001G463700 Sobic005G035850 Sobic005G035850 Sobic006G031866--Sobic005G035850 Sobic003G003900 Sobic003G003900 Sobic006G031866--Sobic003G003900 Sobic008G098032 Sobic008G098032 Sobic006G031866--Sobic008G098032 Sobic006G031866--Sobic007G171300 Sobic004G139800 Sobic004G139800 Sobic006G031866--Sobic004G139800 Sobic001G310133 Sobic001G310133 Sobic006G031866--Sobic001G310133 Sobic006G031866--Sobic007G141420 Sobic007G171300--Sobic002G227400 Sobic007G171300--Sobic006G031866 Sobic007G171300--Sobic001G135000 Sobic007G171300--Sobic001G529301 Sobic002G268450 Sobic002G268450 Sobic007G171300--Sobic002G268450 Sobic010G213100 Sobic010G213100 Sobic007G171300--Sobic010G213100 Sobic005G065400 Sobic005G065400 Sobic007G171300--Sobic005G065400 Sobic007G171300--Sobic008G052700 Sobic001G453150 Sobic001G453150 Sobic007G171300--Sobic001G453150 Sobic001G463700--Sobic003G193400 Sobic001G463700--Sobic001G310400 Sobic001G463700--Sobic005G217400 Sobic001G463700--Sobic001G135000 Sobic001G463700--Sobic007G141420 Sobic001G120850 Sobic001G120850 Sobic001G463700--Sobic001G120850 Sobic001G463700--Sobic006G031866 Sobic001G519500 Sobic001G519500 Sobic001G463700--Sobic001G519500 Sobic007G118700 Sobic007G118700 Sobic001G463700--Sobic007G118700 Sobic002G221000 Sobic002G221000 Sobic003G390000--Sobic002G221000 Sobic001G070900 Sobic001G070900 Sobic003G390000--Sobic001G070900 Sobic004G007166 Sobic004G007166 Sobic003G390000--Sobic004G007166 Sobic001G195866 Sobic001G195866 Sobic003G390000--Sobic001G195866 Sobic001G477500 Sobic001G477500 Sobic003G390000--Sobic001G477500 Sobic008G176266 Sobic008G176266 Sobic003G390000--Sobic008G176266 Sobic003G390000--Sobic001G529301 Sobic002G070500 Sobic002G070500 Sobic003G390000--Sobic002G070500 Sobic004G272000 Sobic004G272000 Sobic003G390000--Sobic004G272000 Sobic002G262250 Sobic002G262250 Sobic001G486400--Sobic002G262250 Sobic010G228800 Sobic010G228800 Sobic001G486400--Sobic010G228800 Sobic002G326300 Sobic002G326300 Sobic001G486400--Sobic002G326300 Sobic001G174200 Sobic001G174200 Sobic001G486400--Sobic001G174200 Sobic005G198150 Sobic005G198150 Sobic001G486400--Sobic005G198150 Sobic010G274700 Sobic010G274700 Sobic001G486400--Sobic010G274700 Sobic001G221700 Sobic001G221700 Sobic001G486400--Sobic001G221700 Sobic008G187450 Sobic008G187450 Sobic001G486400--Sobic008G187450 Sobic008G060800 Sobic008G060800 Sobic001G486400--Sobic008G060800 Sobic002G428301 Sobic002G428301 Sobic003G108300--Sobic002G428301 Sobic004G039000 Sobic004G039000 Sobic003G108300--Sobic004G039000 Sobic003G108300--Sobic001G519500 Sobic007G043050 Sobic007G043050 Sobic003G108300--Sobic007G043050 Sobic007G203600 Sobic007G203600 Sobic003G108300--Sobic007G203600 Sobic006G007700 Sobic006G007700 Sobic003G108300--Sobic006G007700 Sobic005G148300 Sobic005G148300 Sobic003G108300--Sobic005G148300 Sobic001G208133 Sobic001G208133 Sobic003G108300--Sobic001G208133 Sobic008G157400 Sobic008G157400 Sobic003G108300--Sobic008G157400 Sobic007G182400 Sobic007G182400 Sobic001G062000--Sobic007G182400 Sobic010G054400 Sobic010G054400 Sobic001G062000--Sobic010G054400 Sobic003G091900 Sobic003G091900 Sobic001G062000--Sobic003G091900 Sobic001G062000--Sobic010G213100 Sobic004G343733 Sobic004G343733 Sobic001G062000--Sobic004G343733 Sobic009G079700 Sobic009G079700 Sobic001G062000--Sobic009G079700 Sobic002G377400 Sobic002G377400 Sobic001G062000--Sobic002G377400 Sobic001G062000--Sobic001G529301 Sobic003G056900 Sobic003G056900 Sobic001G062000--Sobic003G056900 Sobic002G227400--Sobic007G171300 Sobic002G227400--Sobic005G065400 Sobic002G227400--Sobic001G453150 Sobic001G439850 Sobic001G439850 Sobic002G227400--Sobic001G439850 Sobic002G227400--Sobic001G135000 Sobic008G091500 Sobic008G091500 Sobic002G227400--Sobic008G091500 Sobic002G227400--Sobic001G529301 Sobic002G227400--Sobic006G031866 Sobic002G227400--Sobic010G213100
Octagon: transcription factors


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