Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G128200.1
Synonym Sb10g011270
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1W0VSP8
Pfam PF04578 PF13968
Panther DB PTHR31325 PTHR31325:SF39
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G45540 : Protein of unknown function (DUF594)
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g05410.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a033860
Brachypodium PNT78203
Barley HORVU0Hr1G000230.1 , HORVU1Hr1G006980.1 , HORVU0Hr1G017850.1
Wheat TraesCS6A02G414800
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G345900 - -
2 Sobic.008G068133 - -
3 Sobic.004G095400 calcium-binding EF hand family protein, putative, expressed -
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5 Sobic.003G268500 - -
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7 Sobic.005G048100 - -
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9 Sobic.003G213500 expressed protein -
10 Sobic.001G369550 - -
11 Sobic.004G358150 - -
12 Sobic.007G138200 zinc finger A20 and AN1 domain-containing stress-associated protein, putative, expressed -
13 Sobic.006G110101 - -
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15 Sobic.005G031901 - -
16 Sobic.004G358200 RING-H2 finger protein, putative, expressed -
17 Sobic.010G147300 CAF1 family ribonuclease containing protein, putative, expressed K12581: CNOT7_8, CAF1, CCR4-NOT transcription complex subunit 7/8
18 Sobic.008G079733 - -
19 Sobic.003G126750 - -
20 Sobic.006G109600 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G128200 Sobic010G128200 Sobic002G345900 Sobic002G345900 Sobic010G128200--Sobic002G345900 Sobic008G068133 Sobic008G068133 Sobic010G128200--Sobic008G068133 Sobic004G095400 Sobic004G095400 Sobic010G128200--Sobic004G095400 Sobic008G139250 Sobic008G139250 Sobic010G128200--Sobic008G139250 Sobic003G268500 Sobic003G268500 Sobic010G128200--Sobic003G268500 Sobic001G419300 Sobic001G419300 Sobic010G128200--Sobic001G419300 Sobic005G048100 Sobic005G048100 Sobic010G128200--Sobic005G048100 Sobic003G443601 Sobic003G443601 Sobic010G128200--Sobic003G443601 Sobic003G213500 Sobic003G213500 Sobic010G128200--Sobic003G213500 Sobic002G345900--Sobic010G128200 Sobic002G345900--Sobic003G268500 Sobic001G369550 Sobic001G369550 Sobic002G345900--Sobic001G369550 Sobic002G345900--Sobic008G068133 Sobic002G345900--Sobic001G419300 Sobic002G345900--Sobic008G139250 Sobic002G345900--Sobic004G095400 Sobic009G045500 Sobic009G045500 Sobic002G345900--Sobic009G045500 Sobic002G345900--Sobic003G443601 Sobic006G110101 Sobic006G110101 Sobic008G068133--Sobic006G110101 Sobic001G398100 Sobic001G398100 Sobic008G068133--Sobic001G398100 Sobic008G068133--Sobic010G128200 Sobic008G068133--Sobic004G095400 Sobic008G068133--Sobic003G213500 Sobic008G068133--Sobic001G369550 Sobic008G068133--Sobic005G048100 Sobic008G068133--Sobic002G345900 Sobic008G068133--Sobic008G139250 Sobic007G138200 Sobic007G138200 Sobic004G095400--Sobic007G138200 Sobic001G515350 Sobic001G515350 Sobic004G095400--Sobic001G515350 Sobic004G095400--Sobic010G128200 Sobic004G095400--Sobic001G398100 Sobic006G151100 Sobic006G151100 Sobic004G095400--Sobic006G151100 Sobic004G095400--Sobic008G068133 Sobic004G358150 Sobic004G358150 Sobic004G095400--Sobic004G358150 Sobic004G095400--Sobic003G443601 Sobic002G244901 Sobic002G244901 Sobic004G095400--Sobic002G244901 Sobic005G031901 Sobic005G031901 Sobic008G139250--Sobic005G031901 Sobic001G261464 Sobic001G261464 Sobic008G139250--Sobic001G261464 Sobic003G126750 Sobic003G126750 Sobic008G139250--Sobic003G126750 Sobic006G109600 Sobic006G109600 Sobic008G139250--Sobic006G109600 Sobic004G358200 Sobic004G358200 Sobic008G139250--Sobic004G358200 Sobic010G147300 Sobic010G147300 Sobic008G139250--Sobic010G147300 Sobic002G100100 Sobic002G100100 Sobic008G139250--Sobic002G100100 Sobic008G079733 Sobic008G079733 Sobic008G139250--Sobic008G079733 Sobic002G026150 Sobic002G026150 Sobic008G139250--Sobic002G026150 Sobic003G268500--Sobic002G345900 Sobic003G268500--Sobic010G128200 Sobic003G268500--Sobic001G369550 Sobic003G268500--Sobic004G095400 Sobic003G268500--Sobic008G139250 Sobic003G268500--Sobic008G079733 Sobic010G196433 Sobic010G196433 Sobic003G268500--Sobic010G196433 Sobic003G268500--Sobic008G068133 Sobic008G094900 Sobic008G094900 Sobic003G268500--Sobic008G094900 Sobic001G419300--Sobic010G128200 Sobic001G419300--Sobic002G345900 Sobic001G419300--Sobic008G068133 Sobic001G419300--Sobic006G110101 Sobic003G125801 Sobic003G125801 Sobic001G419300--Sobic003G125801 Sobic001G419300--Sobic001G369550 Sobic001G244650 Sobic001G244650 Sobic001G419300--Sobic001G244650 Sobic002G363433 Sobic002G363433 Sobic001G419300--Sobic002G363433 Sobic008G035300 Sobic008G035300 Sobic001G419300--Sobic008G035300 Sobic005G048100--Sobic004G358200 Sobic005G048100--Sobic003G126750 Sobic005G048100--Sobic001G261464 Sobic005G048100--Sobic008G139250 Sobic005G048100--Sobic002G026150 Sobic004G243700 Sobic004G243700 Sobic005G048100--Sobic004G243700 Sobic006G026300 Sobic006G026300 Sobic005G048100--Sobic006G026300 Sobic005G048100--Sobic006G109600 Sobic002G153900 Sobic002G153900 Sobic005G048100--Sobic002G153900 Sobic008G141700 Sobic008G141700 Sobic003G443601--Sobic008G141700 Sobic003G443601--Sobic002G244901 Sobic002G377501 Sobic002G377501 Sobic003G443601--Sobic002G377501 Sobic009G216200 Sobic009G216200 Sobic003G443601--Sobic009G216200 Sobic002G259900 Sobic002G259900 Sobic003G443601--Sobic002G259900 Sobic003G443601--Sobic006G151100 Sobic010G105900 Sobic010G105900 Sobic003G443601--Sobic010G105900 Sobic008G016400 Sobic008G016400 Sobic003G443601--Sobic008G016400 Sobic003G069601 Sobic003G069601 Sobic003G443601--Sobic003G069601 Sobic003G213500--Sobic008G068133 Sobic004G045900 Sobic004G045900 Sobic003G213500--Sobic004G045900 Sobic003G213500--Sobic006G110101 Sobic003G213500--Sobic004G095400 Sobic003G213500--Sobic010G128200 Sobic003G213500--Sobic007G138200 Sobic003G213500--Sobic001G398100 Sobic003G213500--Sobic001G515350 Sobic003G213500--Sobic001G369550
Octagon: transcription factors


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