Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G230600.1
Synonym CKI1, Sb01g020200
Functional annotation histidine kinase, putative, expressed
UniProt C5WZG5
Pfam PF00512 PF02518 PF00072
Panther DB PTHR24423 PTHR24423:SF486
NCBI CDD KOG0519; Sensory transduction histidine kinase
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0007165; signal transduction GO:0000155phosphorelay sensor kinase activity GO:0000160phosphorelay signal transduction system


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G47430 : Signal transduction histidine kinase
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g08450.1 : histidine kinase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic001G230600 Sobic001G230600 Sobic002G162601 Sobic002G162601 Sobic001G230600--Sobic002G162601 Sobic007G157600 Sobic007G157600 Sobic001G230600--Sobic007G157600 Sobic002G059700 Sobic002G059700 Sobic001G230600--Sobic002G059700 Sobic006G147101 Sobic006G147101 Sobic001G230600--Sobic006G147101 Sobic005G134900 Sobic005G134900 Sobic001G230600--Sobic005G134900 Sobic001G209550 Sobic001G209550 Sobic001G230600--Sobic001G209550 Sobic010G034700 Sobic010G034700 Sobic001G230600--Sobic010G034700 Sobic002G070500 Sobic002G070500 Sobic001G230600--Sobic002G070500 Sobic004G184600 Sobic004G184600 Sobic001G230600--Sobic004G184600 Sobic001G208166 Sobic001G208166 Sobic002G162601--Sobic001G208166 Sobic002G162601--Sobic006G147101 Sobic002G162601--Sobic001G230600 Sobic001G070900 Sobic001G070900 Sobic002G162601--Sobic001G070900 Sobic002G162601--Sobic001G209550 Sobic002G162601--Sobic002G059700 Sobic002G162601--Sobic007G157600 Sobic002G162601--Sobic002G070500 Sobic008G109650 Sobic008G109650 Sobic002G162601--Sobic008G109650 Sobic007G157600--Sobic001G230600 Sobic007G157600--Sobic002G162601 Sobic002G049750 Sobic002G049750 Sobic007G157600--Sobic002G049750 Sobic007G157600--Sobic004G184600 Sobic007G157600--Sobic006G147101 Sobic001G064400 Sobic001G064400 Sobic007G157600--Sobic001G064400 Sobic009G043800 Sobic009G043800 Sobic007G157600--Sobic009G043800 Sobic002G191450 Sobic002G191450 Sobic007G157600--Sobic002G191450 Sobic007G157600--Sobic002G059700 Sobic002G059700--Sobic001G209550 Sobic002G059700--Sobic002G070500 Sobic002G059700--Sobic005G134900 Sobic002G059700--Sobic006G147101 Sobic002G347850 Sobic002G347850 Sobic002G059700--Sobic002G347850 Sobic002G059700--Sobic008G109650 Sobic002G059700--Sobic001G208166 Sobic002G059700--Sobic001G230600 Sobic002G059700--Sobic010G034700 Sobic006G147101--Sobic001G209550 Sobic006G147101--Sobic002G059700 Sobic006G147101--Sobic001G208166 Sobic006G147101--Sobic002G162601 Sobic006G147101--Sobic008G109650 Sobic006G147101--Sobic002G347850 Sobic006G147101--Sobic001G230600 Sobic006G147101--Sobic002G070500 Sobic006G147101--Sobic004G184600 Sobic005G134900--Sobic002G059700 Sobic010G197566 Sobic010G197566 Sobic005G134900--Sobic010G197566 Sobic003G314566 Sobic003G314566 Sobic005G134900--Sobic003G314566 Sobic005G134900--Sobic002G070500 Sobic005G134900--Sobic001G209550 Sobic001G455400 Sobic001G455400 Sobic005G134900--Sobic001G455400 Sobic005G134900--Sobic010G034700 Sobic004G337132 Sobic004G337132 Sobic005G134900--Sobic004G337132 Sobic005G134900--Sobic001G230600 Sobic001G209550--Sobic002G059700 Sobic001G209550--Sobic002G070500 Sobic001G209550--Sobic006G147101 Sobic001G209550--Sobic002G347850 Sobic001G209550--Sobic008G109650 Sobic001G209550--Sobic005G134900 Sobic001G209550--Sobic001G208166 Sobic004G080901 Sobic004G080901 Sobic001G209550--Sobic004G080901 Sobic001G209550--Sobic002G162601 Sobic010G034700--Sobic005G134900 Sobic010G034700--Sobic002G059700 Sobic010G034700--Sobic001G230600 Sobic010G034700--Sobic003G314566 Sobic010G034700--Sobic001G209550 Sobic010G034700--Sobic004G184600 Sobic010G164600 Sobic010G164600 Sobic010G034700--Sobic010G164600 Sobic010G034700--Sobic010G197566 Sobic010G034700--Sobic006G147101 Sobic002G070500--Sobic002G059700 Sobic004G007166 Sobic004G007166 Sobic002G070500--Sobic004G007166 Sobic002G070500--Sobic001G209550 Sobic002G070500--Sobic005G134900 Sobic001G210101 Sobic001G210101 Sobic002G070500--Sobic001G210101 Sobic008G187450 Sobic008G187450 Sobic002G070500--Sobic008G187450 Sobic008G176266 Sobic008G176266 Sobic002G070500--Sobic008G176266 Sobic001G387400 Sobic001G387400 Sobic002G070500--Sobic001G387400 Sobic009G028650 Sobic009G028650 Sobic002G070500--Sobic009G028650 Sobic004G184600--Sobic010G034700 Sobic004G184600--Sobic002G059700 Sobic004G184600--Sobic001G209550 Sobic004G184600--Sobic006G147101 Sobic004G184600--Sobic002G049750 Sobic004G184600--Sobic001G230600 Sobic004G184600--Sobic009G043800 Sobic004G184600--Sobic007G157600 Sobic004G184600--Sobic002G347850
Octagon: transcription factors


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