Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G300200.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RPX6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G210101 - -
2 Sobic.002G070500 anthocyanidin 3-O-glucosyltransferase, putative, expressed -
3 Sobic.001G209550 - -
4 Sobic.002G059700 Rf1, mitochondrial precursor, putative, expressed -
5 Sobic.002G347850 - -
6 Sobic.004G007166 - -
7 Sobic.004G080901 - -
8 Sobic.001G208166 - -
9 Sobic.005G230900 GRAS family transcription factor domain containing protein, expressed -
10 Sobic.006G147101 - -
11 Sobic.008G176266 - -
12 Sobic.008G109650 - -
13 Sobic.004G272000 - -
14 Sobic.005G134900 chalcone and stilbene synthases, putative, expressed -
15 Sobic.008G187450 - -
16 Sobic.008G026500 - -
17 Sobic.001G234766 - -
18 Sobic.001G230600 histidine kinase, putative, expressed -
19 Sobic.002G321000 - -
20 Sobic.001G387400 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic004G300200 Sobic004G300200 Sobic001G210101 Sobic001G210101 Sobic004G300200--Sobic001G210101 Sobic002G070500 Sobic002G070500 Sobic004G300200--Sobic002G070500 Sobic001G209550 Sobic001G209550 Sobic004G300200--Sobic001G209550 Sobic002G059700 Sobic002G059700 Sobic004G300200--Sobic002G059700 Sobic002G347850 Sobic002G347850 Sobic004G300200--Sobic002G347850 Sobic004G007166 Sobic004G007166 Sobic004G300200--Sobic004G007166 Sobic004G080901 Sobic004G080901 Sobic004G300200--Sobic004G080901 Sobic001G208166 Sobic001G208166 Sobic004G300200--Sobic001G208166 Sobic005G230900 Sobic005G230900 Sobic004G300200--Sobic005G230900 Sobic001G210101--Sobic002G070500 Sobic001G210101--Sobic004G300200 Sobic005G134900 Sobic005G134900 Sobic001G210101--Sobic005G134900 Sobic001G210101--Sobic004G007166 Sobic001G210101--Sobic002G059700 Sobic009G248200 Sobic009G248200 Sobic001G210101--Sobic009G248200 Sobic004G044250 Sobic004G044250 Sobic001G210101--Sobic004G044250 Sobic006G224600 Sobic006G224600 Sobic001G210101--Sobic006G224600 Sobic001G257600 Sobic001G257600 Sobic001G210101--Sobic001G257600 Sobic002G070500--Sobic002G059700 Sobic002G070500--Sobic004G007166 Sobic002G070500--Sobic001G209550 Sobic002G070500--Sobic005G134900 Sobic002G070500--Sobic001G210101 Sobic008G187450 Sobic008G187450 Sobic002G070500--Sobic008G187450 Sobic008G176266 Sobic008G176266 Sobic002G070500--Sobic008G176266 Sobic001G387400 Sobic001G387400 Sobic002G070500--Sobic001G387400 Sobic009G028650 Sobic009G028650 Sobic002G070500--Sobic009G028650 Sobic001G209550--Sobic002G059700 Sobic001G209550--Sobic002G070500 Sobic006G147101 Sobic006G147101 Sobic001G209550--Sobic006G147101 Sobic001G209550--Sobic002G347850 Sobic008G109650 Sobic008G109650 Sobic001G209550--Sobic008G109650 Sobic001G209550--Sobic005G134900 Sobic001G209550--Sobic001G208166 Sobic001G209550--Sobic004G080901 Sobic002G162601 Sobic002G162601 Sobic001G209550--Sobic002G162601 Sobic002G059700--Sobic001G209550 Sobic002G059700--Sobic002G070500 Sobic002G059700--Sobic005G134900 Sobic002G059700--Sobic006G147101 Sobic002G059700--Sobic002G347850 Sobic002G059700--Sobic008G109650 Sobic002G059700--Sobic001G208166 Sobic001G230600 Sobic001G230600 Sobic002G059700--Sobic001G230600 Sobic010G034700 Sobic010G034700 Sobic002G059700--Sobic010G034700 Sobic002G347850--Sobic001G209550 Sobic002G347850--Sobic002G059700 Sobic002G347850--Sobic006G147101 Sobic002G347850--Sobic008G109650 Sobic002G347850--Sobic001G208166 Sobic001G064400 Sobic001G064400 Sobic002G347850--Sobic001G064400 Sobic009G043800 Sobic009G043800 Sobic002G347850--Sobic009G043800 Sobic002G347850--Sobic002G070500 Sobic002G347850--Sobic002G162601 Sobic004G007166--Sobic008G176266 Sobic004G007166--Sobic001G387400 Sobic004G007166--Sobic008G187450 Sobic004G007166--Sobic002G070500 Sobic004G272000 Sobic004G272000 Sobic004G007166--Sobic004G272000 Sobic007G203600 Sobic007G203600 Sobic004G007166--Sobic007G203600 Sobic007G043050 Sobic007G043050 Sobic004G007166--Sobic007G043050 Sobic004G007166--Sobic009G028650 Sobic001G174200 Sobic001G174200 Sobic004G007166--Sobic001G174200 Sobic007G137201 Sobic007G137201 Sobic004G080901--Sobic007G137201 Sobic001G089850 Sobic001G089850 Sobic004G080901--Sobic001G089850 Sobic004G080901--Sobic001G208166 Sobic004G080901--Sobic001G209550 Sobic004G080901--Sobic005G230900 Sobic004G080901--Sobic002G059700 Sobic004G080901--Sobic002G070500 Sobic004G068900 Sobic004G068900 Sobic004G080901--Sobic004G068900 Sobic004G080901--Sobic008G109650 Sobic001G208166--Sobic006G147101 Sobic002G043201 Sobic002G043201 Sobic001G208166--Sobic002G043201 Sobic001G208166--Sobic002G162601 Sobic001G208166--Sobic008G109650 Sobic001G208166--Sobic004G080901 Sobic001G208166--Sobic001G209550 Sobic001G208166--Sobic002G059700 Sobic001G070900 Sobic001G070900 Sobic001G208166--Sobic001G070900 Sobic007G173400 Sobic007G173400 Sobic001G208166--Sobic007G173400 Sobic001G084133 Sobic001G084133 Sobic005G230900--Sobic001G084133 Sobic003G406120 Sobic003G406120 Sobic005G230900--Sobic003G406120 Sobic005G230900--Sobic004G272000 Sobic004G089801 Sobic004G089801 Sobic005G230900--Sobic004G089801 Sobic008G026500 Sobic008G026500 Sobic005G230900--Sobic008G026500 Sobic002G365300 Sobic002G365300 Sobic005G230900--Sobic002G365300 Sobic001G421450 Sobic001G421450 Sobic005G230900--Sobic001G421450 Sobic006G238900 Sobic006G238900 Sobic005G230900--Sobic006G238900 Sobic003G245000 Sobic003G245000 Sobic005G230900--Sobic003G245000
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.