Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G314566.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VZW1
Pfam -
Panther DB PTHR33994 PTHR33994:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g56500.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G134900 chalcone and stilbene synthases, putative, expressed -
2 Sobic.010G197566 - -
3 Sobic.002G059700 Rf1, mitochondrial precursor, putative, expressed -
4 Sobic.010G034700 transferase family protein, putative, expressed -
5 Sobic.001G209550 - -
6 Sobic.010G141700 FAR1 family protein, expressed -
7 Sobic.003G408700 expressed protein -
8 Sobic.004G254200 sphingolipid C4-hydroxylase SUR2, putative, expressed K04713: sphinganine C4-monooxygenase
9 Sobic.001G507933 - -
10 Sobic.001G455400 - -
11 Sobic.004G337132 - -
12 Sobic.002G070500 anthocyanidin 3-O-glucosyltransferase, putative, expressed -
13 Sobic.008G177700 strictosidine synthase, putative, expressed -
14 Sobic.001G230600 histidine kinase, putative, expressed -
15 Sobic.003G242500 expressed protein -
16 Sobic.007G044000 - -
17 Sobic.004G217400 expressed protein -
18 Sobic.002G430601 - -
19 Sobic.004G184600 - -
20 Sobic.006G244900 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic003G314566 Sobic003G314566 Sobic005G134900 Sobic005G134900 Sobic003G314566--Sobic005G134900 Sobic010G197566 Sobic010G197566 Sobic003G314566--Sobic010G197566 Sobic002G059700 Sobic002G059700 Sobic003G314566--Sobic002G059700 Sobic010G034700 Sobic010G034700 Sobic003G314566--Sobic010G034700 Sobic001G209550 Sobic001G209550 Sobic003G314566--Sobic001G209550 Sobic010G141700 Sobic010G141700 Sobic003G314566--Sobic010G141700 Sobic003G408700 Sobic003G408700 Sobic003G314566--Sobic003G408700 Sobic004G254200 Sobic004G254200 Sobic003G314566--Sobic004G254200 Sobic001G507933 Sobic001G507933 Sobic003G314566--Sobic001G507933 Sobic005G134900--Sobic002G059700 Sobic005G134900--Sobic010G197566 Sobic005G134900--Sobic003G314566 Sobic002G070500 Sobic002G070500 Sobic005G134900--Sobic002G070500 Sobic005G134900--Sobic001G209550 Sobic001G455400 Sobic001G455400 Sobic005G134900--Sobic001G455400 Sobic005G134900--Sobic010G034700 Sobic004G337132 Sobic004G337132 Sobic005G134900--Sobic004G337132 Sobic001G230600 Sobic001G230600 Sobic005G134900--Sobic001G230600 Sobic010G230100 Sobic010G230100 Sobic010G197566--Sobic010G230100 Sobic010G197566--Sobic004G337132 Sobic009G230300 Sobic009G230300 Sobic010G197566--Sobic009G230300 Sobic001G369101 Sobic001G369101 Sobic010G197566--Sobic001G369101 Sobic004G007550 Sobic004G007550 Sobic010G197566--Sobic004G007550 Sobic006G244900 Sobic006G244900 Sobic010G197566--Sobic006G244900 Sobic004G342800 Sobic004G342800 Sobic010G197566--Sobic004G342800 Sobic010G197566--Sobic001G455400 Sobic003G108050 Sobic003G108050 Sobic010G197566--Sobic003G108050 Sobic002G059700--Sobic001G209550 Sobic002G059700--Sobic002G070500 Sobic002G059700--Sobic005G134900 Sobic006G147101 Sobic006G147101 Sobic002G059700--Sobic006G147101 Sobic002G347850 Sobic002G347850 Sobic002G059700--Sobic002G347850 Sobic008G109650 Sobic008G109650 Sobic002G059700--Sobic008G109650 Sobic001G208166 Sobic001G208166 Sobic002G059700--Sobic001G208166 Sobic002G059700--Sobic001G230600 Sobic002G059700--Sobic010G034700 Sobic010G034700--Sobic005G134900 Sobic010G034700--Sobic002G059700 Sobic010G034700--Sobic001G230600 Sobic010G034700--Sobic003G314566 Sobic010G034700--Sobic001G209550 Sobic004G184600 Sobic004G184600 Sobic010G034700--Sobic004G184600 Sobic010G164600 Sobic010G164600 Sobic010G034700--Sobic010G164600 Sobic010G034700--Sobic010G197566 Sobic010G034700--Sobic006G147101 Sobic001G209550--Sobic002G059700 Sobic001G209550--Sobic002G070500 Sobic001G209550--Sobic006G147101 Sobic001G209550--Sobic002G347850 Sobic001G209550--Sobic008G109650 Sobic001G209550--Sobic005G134900 Sobic001G209550--Sobic001G208166 Sobic004G080901 Sobic004G080901 Sobic001G209550--Sobic004G080901 Sobic002G162601 Sobic002G162601 Sobic001G209550--Sobic002G162601 Sobic010G141700--Sobic003G408700 Sobic010G141700--Sobic004G254200 Sobic010G141700--Sobic001G507933 Sobic008G177700 Sobic008G177700 Sobic010G141700--Sobic008G177700 Sobic003G242500 Sobic003G242500 Sobic010G141700--Sobic003G242500 Sobic002G430601 Sobic002G430601 Sobic010G141700--Sobic002G430601 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic010G141700--Sobic001G018700 Sobic003G408700--Sobic004G254200 Sobic003G408700--Sobic010G141700 Sobic003G408700--Sobic001G507933 Sobic003G408700--Sobic008G177700 Sobic003G408700--Sobic003G242500 Sobic003G408700--Sobic002G430601 Sobic003G408700--Sobic001G018700 Sobic004G254200--Sobic003G408700 Sobic004G254200--Sobic010G141700 Sobic004G254200--Sobic001G507933 Sobic004G254200--Sobic008G177700 Sobic004G254200--Sobic003G242500 Sobic004G254200--Sobic002G430601 Sobic004G254200--Sobic001G018700 Sobic001G507933--Sobic004G254200 Sobic001G507933--Sobic003G408700 Sobic001G507933--Sobic010G141700 Sobic001G507933--Sobic008G177700 Sobic001G507933--Sobic003G242500 Sobic001G507933--Sobic002G430601 Sobic001G507933--Sobic001G018700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.