Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G044000.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PFI7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G45400 : Replication factor-A protein 1-related
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a055171
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G141700 FAR1 family protein, expressed -
2 Sobic.003G408700 expressed protein -
3 Sobic.004G254200 sphingolipid C4-hydroxylase SUR2, putative, expressed K04713: sphinganine C4-monooxygenase
4 Sobic.001G507933 - -
5 Sobic.002G071700 resistance protein, putative, expressed -
6 Sobic.008G177700 strictosidine synthase, putative, expressed -
7 Sobic.010G048933 - -
8 Sobic.003G242500 expressed protein -
9 Sobic.002G039301 - -
10 Sobic.002G430601 - -
11 Sobic.002G032033 - -
12 Sobic.005G094332 - -
13 Sobic.001G183900 expressed protein -
14 Sobic.005G216866 - -
15 Sobic.001G110150 - -
16 Sobic.004G217400 expressed protein -
17 Sobic.007G069900 expressed protein -
18 Sobic.004G224350 - -
19 Sobic.001G120700 - -
20 Sobic.004G246950 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G044000 Sobic007G044000 Sobic010G141700 Sobic010G141700 Sobic007G044000--Sobic010G141700 Sobic003G408700 Sobic003G408700 Sobic007G044000--Sobic003G408700 Sobic004G254200 Sobic004G254200 Sobic007G044000--Sobic004G254200 Sobic001G507933 Sobic001G507933 Sobic007G044000--Sobic001G507933 Sobic002G071700 Sobic002G071700 Sobic007G044000--Sobic002G071700 Sobic008G177700 Sobic008G177700 Sobic007G044000--Sobic008G177700 Sobic010G048933 Sobic010G048933 Sobic007G044000--Sobic010G048933 Sobic003G242500 Sobic003G242500 Sobic007G044000--Sobic003G242500 Sobic002G039301 Sobic002G039301 Sobic007G044000--Sobic002G039301 Sobic010G141700--Sobic003G408700 Sobic010G141700--Sobic004G254200 Sobic010G141700--Sobic001G507933 Sobic010G141700--Sobic008G177700 Sobic010G141700--Sobic003G242500 Sobic002G430601 Sobic002G430601 Sobic010G141700--Sobic002G430601 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic010G141700--Sobic001G018700 Sobic003G408700--Sobic004G254200 Sobic003G408700--Sobic010G141700 Sobic003G408700--Sobic001G507933 Sobic003G408700--Sobic008G177700 Sobic003G408700--Sobic003G242500 Sobic003G408700--Sobic002G430601 Sobic003G408700--Sobic001G018700 Sobic004G254200--Sobic003G408700 Sobic004G254200--Sobic010G141700 Sobic004G254200--Sobic001G507933 Sobic004G254200--Sobic008G177700 Sobic004G254200--Sobic003G242500 Sobic004G254200--Sobic002G430601 Sobic004G254200--Sobic001G018700 Sobic001G507933--Sobic004G254200 Sobic001G507933--Sobic003G408700 Sobic001G507933--Sobic010G141700 Sobic001G507933--Sobic008G177700 Sobic001G507933--Sobic003G242500 Sobic001G507933--Sobic002G430601 Sobic001G507933--Sobic001G018700 Sobic002G071700--Sobic007G044000 Sobic008G148900 Sobic008G148900 Sobic002G071700--Sobic008G148900 Sobic002G071700--Sobic010G048933 Sobic002G071700--Sobic010G141700 Sobic002G071700--Sobic003G408700 Sobic002G071700--Sobic004G254200 Sobic002G071700--Sobic001G507933 Sobic002G071700--Sobic008G177700 Sobic004G294000 Sobic004G294000 Sobic002G071700--Sobic004G294000 Sobic008G177700--Sobic003G242500 Sobic008G177700--Sobic001G507933 Sobic008G177700--Sobic004G254200 Sobic008G177700--Sobic003G408700 Sobic008G177700--Sobic010G141700 Sobic001G030800 Sobic001G030800 Sobic008G177700--Sobic001G030800 Sobic008G177700--Sobic001G018700 Sobic010G048933--Sobic004G294000 Sobic010G048933--Sobic007G044000 Sobic010G048933--Sobic002G071700 Sobic010G048933--Sobic010G141700 Sobic010G048933--Sobic003G408700 Sobic010G048933--Sobic004G254200 Sobic005G208801 Sobic005G208801 Sobic010G048933--Sobic005G208801 Sobic010G048933--Sobic008G148900 Sobic010G048933--Sobic001G507933 Sobic003G242500--Sobic008G177700 Sobic003G242500--Sobic001G507933 Sobic003G242500--Sobic001G030800 Sobic003G242500--Sobic001G018700 Sobic002G039301--Sobic001G507933 Sobic002G039301--Sobic004G254200 Sobic002G039301--Sobic003G408700 Sobic002G039301--Sobic010G141700 Sobic002G039301--Sobic008G177700 Sobic002G039301--Sobic003G242500 Sobic001G236950 Sobic001G236950 Sobic002G039301--Sobic001G236950 Sobic007G146800 Sobic007G146800 Sobic002G039301--Sobic007G146800 Sobic002G397001 Sobic002G397001 Sobic002G039301--Sobic002G397001
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.