Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G048933.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VRG9
Pfam PF00646
Panther DB PTHR32212 PTHR32212:SF96
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G18150 : RNI-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g06360.1 : transposon protein, putative, unclassified, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G294000 thioesterase family protein, putative, expressed -
2 Sobic.007G044000 - -
3 Sobic.002G071700 resistance protein, putative, expressed -
4 Sobic.010G141700 FAR1 family protein, expressed -
5 Sobic.003G408700 expressed protein -
6 Sobic.004G254200 sphingolipid C4-hydroxylase SUR2, putative, expressed K04713: sphinganine C4-monooxygenase
7 Sobic.005G208801 - K11968: ariadne-1
8 Sobic.008G148900 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
9 Sobic.001G507933 - -
10 Sobic.008G177700 strictosidine synthase, putative, expressed -
11 Sobic.001G517000 - -
12 Sobic.005G094332 - -
13 Sobic.001G209500 RIPER9 - Ripening-related family protein precursor, putative, expressed -
14 Sobic.002G039301 - -
15 Sobic.005G208600 expressed protein K11968: ariadne-1
16 Sobic.006G037050 - -
17 Sobic.003G242500 expressed protein -
18 Sobic.003G314566 - -
19 Sobic.007G069900 expressed protein -
20 Sobic.003G154600 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic010G048933 Sobic010G048933 Sobic004G294000 Sobic004G294000 Sobic010G048933--Sobic004G294000 Sobic007G044000 Sobic007G044000 Sobic010G048933--Sobic007G044000 Sobic002G071700 Sobic002G071700 Sobic010G048933--Sobic002G071700 Sobic010G141700 Sobic010G141700 Sobic010G048933--Sobic010G141700 Sobic003G408700 Sobic003G408700 Sobic010G048933--Sobic003G408700 Sobic004G254200 Sobic004G254200 Sobic010G048933--Sobic004G254200 Sobic005G208801 Sobic005G208801 Sobic010G048933--Sobic005G208801 Sobic008G148900 Sobic008G148900 Sobic010G048933--Sobic008G148900 Sobic001G507933 Sobic001G507933 Sobic010G048933--Sobic001G507933 Sobic004G294000--Sobic010G048933 Sobic004G294000--Sobic005G208801 Sobic001G303750 Sobic001G303750 Sobic004G294000--Sobic001G303750 Sobic001G116300 Sobic001G116300 Sobic004G294000--Sobic001G116300 Sobic001G209500 Sobic001G209500 Sobic004G294000--Sobic001G209500 Sobic005G208600 Sobic005G208600 Sobic004G294000--Sobic005G208600 Sobic004G289200 Sobic004G289200 Sobic004G294000--Sobic004G289200 Sobic004G294000--Sobic007G044000 Sobic004G294000--Sobic002G071700 Sobic007G044000--Sobic010G141700 Sobic007G044000--Sobic003G408700 Sobic007G044000--Sobic004G254200 Sobic007G044000--Sobic001G507933 Sobic007G044000--Sobic002G071700 Sobic008G177700 Sobic008G177700 Sobic007G044000--Sobic008G177700 Sobic007G044000--Sobic010G048933 Sobic003G242500 Sobic003G242500 Sobic007G044000--Sobic003G242500 Sobic002G039301 Sobic002G039301 Sobic007G044000--Sobic002G039301 Sobic002G071700--Sobic007G044000 Sobic002G071700--Sobic008G148900 Sobic002G071700--Sobic010G048933 Sobic002G071700--Sobic010G141700 Sobic002G071700--Sobic003G408700 Sobic002G071700--Sobic004G254200 Sobic002G071700--Sobic001G507933 Sobic002G071700--Sobic008G177700 Sobic002G071700--Sobic004G294000 Sobic010G141700--Sobic003G408700 Sobic010G141700--Sobic004G254200 Sobic010G141700--Sobic001G507933 Sobic010G141700--Sobic008G177700 Sobic010G141700--Sobic003G242500 Sobic002G430601 Sobic002G430601 Sobic010G141700--Sobic002G430601 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic010G141700--Sobic001G018700 Sobic003G408700--Sobic004G254200 Sobic003G408700--Sobic010G141700 Sobic003G408700--Sobic001G507933 Sobic003G408700--Sobic008G177700 Sobic003G408700--Sobic003G242500 Sobic003G408700--Sobic002G430601 Sobic003G408700--Sobic001G018700 Sobic004G254200--Sobic003G408700 Sobic004G254200--Sobic010G141700 Sobic004G254200--Sobic001G507933 Sobic004G254200--Sobic008G177700 Sobic004G254200--Sobic003G242500 Sobic004G254200--Sobic002G430601 Sobic004G254200--Sobic001G018700 Sobic005G208801--Sobic004G294000 Sobic005G208801--Sobic001G303750 Sobic005G208801--Sobic001G116300 Sobic002G129500 Sobic002G129500 Sobic005G208801--Sobic002G129500 Sobic010G124600 Sobic010G124600 Sobic005G208801--Sobic010G124600 Sobic005G208801--Sobic004G289200 Sobic008G008200 Sobic008G008200 Sobic005G208801--Sobic008G008200 Sobic009G239800 Sobic009G239800 Sobic005G208801--Sobic009G239800 Sobic002G129700 Sobic002G129700 Sobic005G208801--Sobic002G129700 Sobic008G148900--Sobic002G071700 Sobic008G148900--Sobic007G044000 Sobic008G148900--Sobic010G048933 Sobic008G148900--Sobic004G294000 Sobic008G148900--Sobic010G141700 Sobic008G148900--Sobic003G408700 Sobic008G148900--Sobic004G254200 Sobic002G367500 Sobic002G367500 Sobic008G148900--Sobic002G367500 Sobic001G369600 Sobic001G369600 Sobic008G148900--Sobic001G369600 Sobic001G507933--Sobic004G254200 Sobic001G507933--Sobic003G408700 Sobic001G507933--Sobic010G141700 Sobic001G507933--Sobic008G177700 Sobic001G507933--Sobic003G242500 Sobic001G507933--Sobic002G430601 Sobic001G507933--Sobic001G018700
Octagon: transcription factors


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