Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G208600.1
Synonym Sb05g026210, ATARI7, ARI7
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5RKI6
Pfam PF01485
Panther DB PTHR11685 PTHR11685:SF131
NCBI CDD KOG1815; Predicted E3 ubiquitin ligase
KEGG Orthology K11968; ariadne-1
Gene Ontology GO:0016567; protein ubiquitination GO:0004842ubiquitin-protein transferase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G31510 : IBR domain-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g38630.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a029172 , Zm00025a015947
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.003G436400 plasma membrane ATPase, putative, expressed K01535: PMA1, H+-transporting ATPase


Gene co-expression network
sample Sobic005G208600 Sobic005G208600 Sobic001G209500 Sobic001G209500 Sobic005G208600--Sobic001G209500 Sobic004G294000 Sobic004G294000 Sobic005G208600--Sobic004G294000 Sobic008G101850 Sobic008G101850 Sobic005G208600--Sobic008G101850 Sobic005G208801 Sobic005G208801 Sobic005G208600--Sobic005G208801 Sobic004G289200 Sobic004G289200 Sobic005G208600--Sobic004G289200 Sobic010G048933 Sobic010G048933 Sobic005G208600--Sobic010G048933 Sobic001G215201 Sobic001G215201 Sobic005G208600--Sobic001G215201 Sobic001G303750 Sobic001G303750 Sobic005G208600--Sobic001G303750 Sobic001G116300 Sobic001G116300 Sobic005G208600--Sobic001G116300 Sobic001G209500--Sobic008G101850 Sobic001G209500--Sobic005G208600 Sobic005G207200 Sobic005G207200 Sobic001G209500--Sobic005G207200 Sobic002G402100 Sobic002G402100 Sobic001G209500--Sobic002G402100 Sobic001G209500--Sobic001G215201 Sobic001G246800 Sobic001G246800 Sobic001G209500--Sobic001G246800 Sobic001G209500--Sobic004G294000 Sobic001G209500--Sobic004G289200 Sobic006G067300 Sobic006G067300 Sobic001G209500--Sobic006G067300 Sobic004G294000--Sobic010G048933 Sobic004G294000--Sobic005G208801 Sobic004G294000--Sobic001G303750 Sobic004G294000--Sobic001G116300 Sobic004G294000--Sobic001G209500 Sobic004G294000--Sobic005G208600 Sobic004G294000--Sobic004G289200 Sobic007G044000 Sobic007G044000 Sobic004G294000--Sobic007G044000 Sobic002G071700 Sobic002G071700 Sobic004G294000--Sobic002G071700 Sobic008G101850--Sobic001G215201 Sobic004G089400 Sobic004G089400 Sobic008G101850--Sobic004G089400 Sobic005G006701 Sobic005G006701 Sobic008G101850--Sobic005G006701 Sobic002G260100 Sobic002G260100 Sobic008G101850--Sobic002G260100 Sobic008G101850--Sobic001G209500 Sobic004G149200 Sobic004G149200 Sobic008G101850--Sobic004G149200 Sobic008G101850--Sobic006G067300 Sobic003G062900 Sobic003G062900 Sobic008G101850--Sobic003G062900 Sobic006G059400 Sobic006G059400 Sobic008G101850--Sobic006G059400 Sobic005G208801--Sobic004G294000 Sobic005G208801--Sobic001G303750 Sobic005G208801--Sobic001G116300 Sobic002G129500 Sobic002G129500 Sobic005G208801--Sobic002G129500 Sobic010G124600 Sobic010G124600 Sobic005G208801--Sobic010G124600 Sobic005G208801--Sobic004G289200 Sobic008G008200 Sobic008G008200 Sobic005G208801--Sobic008G008200 Sobic009G239800 Sobic009G239800 Sobic005G208801--Sobic009G239800 Sobic002G129700 Sobic002G129700 Sobic005G208801--Sobic002G129700 Sobic004G289200--Sobic001G116300 Sobic002G007400 Sobic002G007400 Sobic004G289200--Sobic002G007400 Sobic004G289200--Sobic001G303750 Sobic004G289200--Sobic002G129500 Sobic004G289200--Sobic005G208801 Sobic006G251301 Sobic006G251301 Sobic004G289200--Sobic006G251301 Sobic004G289200--Sobic008G101850 Sobic003G162500 Sobic003G162500 Sobic004G289200--Sobic003G162500 Sobic003G206100 Sobic003G206100 Sobic004G289200--Sobic003G206100 Sobic010G048933--Sobic004G294000 Sobic010G048933--Sobic007G044000 Sobic010G048933--Sobic002G071700 Sobic010G141700 Sobic010G141700 Sobic010G048933--Sobic010G141700 Sobic003G408700 Sobic003G408700 Sobic010G048933--Sobic003G408700 Sobic004G254200 Sobic004G254200 Sobic010G048933--Sobic004G254200 Sobic010G048933--Sobic005G208801 Sobic008G148900 Sobic008G148900 Sobic010G048933--Sobic008G148900 Sobic001G507933 Sobic001G507933 Sobic010G048933--Sobic001G507933 Sobic001G215201--Sobic004G089400 Sobic001G215201--Sobic008G101850 Sobic001G215201--Sobic002G260100 Sobic001G215201--Sobic006G059400 Sobic001G215201--Sobic004G149200 Sobic001G215201--Sobic003G062900 Sobic003G070200 Sobic003G070200 Sobic001G215201--Sobic003G070200 Sobic001G359100 Sobic001G359100 Sobic001G215201--Sobic001G359100 Sobic001G153800 Sobic001G153800 Sobic001G215201--Sobic001G153800 Sobic001G303750--Sobic009G239800 Sobic001G303750--Sobic008G008200 Sobic008G087300 Sobic008G087300 Sobic001G303750--Sobic008G087300 Sobic004G167000 Sobic004G167000 Sobic001G303750--Sobic004G167000 Sobic001G266900 Sobic001G266900 Sobic001G303750--Sobic001G266900 Sobic001G303750--Sobic002G129500 Sobic001G303750--Sobic002G129700 Sobic007G064600 Sobic007G064600 Sobic001G303750--Sobic007G064600 Sobic010G180000 Sobic010G180000 Sobic001G303750--Sobic010G180000 Sobic001G116300--Sobic001G303750 Sobic001G116300--Sobic002G007400 Sobic001G116300--Sobic004G289200 Sobic001G116300--Sobic002G129500 Sobic001G116300--Sobic002G129700 Sobic006G034200 Sobic006G034200 Sobic001G116300--Sobic006G034200 Sobic001G116300--Sobic005G208801 Sobic001G116300--Sobic007G064600 Sobic001G266500 Sobic001G266500 Sobic001G116300--Sobic001G266500
Octagon: transcription factors


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