Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G402100.1
Synonym Sb02g041700
Functional annotation LTPL60 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, putative, expressed
UniProt C5X464
Pfam PF14368
Panther DB PTHR33044 PTHR33044:SF31
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G22600 : Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g29230.1 : LTPL63 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G207200 OsFBX101 - F-box domain containing protein, expressed -
2 Sobic.001G209500 RIPER9 - Ripening-related family protein precursor, putative, expressed -
3 Sobic.001G246800 MBTB44 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
4 Sobic.005G070000 OsWAK92 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
5 Sobic.007G133766 - -
6 Sobic.008G101850 - -
7 Sobic.004G174600 "domain confirmed by Pfam database, expressed in leaf, flower, stem and root, expression induced by IAA, BR and ABA treatments"(PubMedID : 20528920)@multidrug resistance protein, putative, expressed K05658: ABCB1, ATP-binding cassette, subfamily B (MDR/TAP), member 1
8 Sobic.010G252550 - -
9 Sobic.005G198600 OsFBX422 - F-box domain containing protein, expressed -
10 Sobic.002G275800 glycosyl hydrolases family 17, putative, expressed -
11 Sobic.006G124500 Regulator of chromosome condensation domain containing protein, expressed -
12 Sobic.007G125200 cell division cycle protein 48, putative, expressed K13525: VCP, transitional endoplasmic reticulum ATPase
13 Sobic.007G083500 speckle-type POZ protein, putative, expressed K10523: speckle-type POZ protein
14 Sobic.008G084000 - -
15 Sobic.009G067100 cytochrome P450, putative, expressed -
16 Sobic.010G037701 - -
17 Sobic.002G096700 no apical meristem protein, putative, expressed -
18 Sobic.001G332100 - -
19 Sobic.003G212700 expressed protein -
20 Sobic.006G015700 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic002G402100 Sobic002G402100 Sobic005G207200 Sobic005G207200 Sobic002G402100--Sobic005G207200 Sobic001G209500 Sobic001G209500 Sobic002G402100--Sobic001G209500 Sobic001G246800 Sobic001G246800 Sobic002G402100--Sobic001G246800 Sobic005G070000 Sobic005G070000 Sobic002G402100--Sobic005G070000 Sobic007G133766 Sobic007G133766 Sobic002G402100--Sobic007G133766 Sobic008G101850 Sobic008G101850 Sobic002G402100--Sobic008G101850 Sobic004G174600 Sobic004G174600 Sobic002G402100--Sobic004G174600 Sobic010G252550 Sobic010G252550 Sobic002G402100--Sobic010G252550 Sobic005G198600 Sobic005G198600 Sobic002G402100--Sobic005G198600 Sobic005G207200--Sobic005G070000 Sobic006G124500 Sobic006G124500 Sobic005G207200--Sobic006G124500 Sobic006G015700 Sobic006G015700 Sobic005G207200--Sobic006G015700 Sobic007G083500 Sobic007G083500 Sobic005G207200--Sobic007G083500 Sobic009G067100 Sobic009G067100 Sobic005G207200--Sobic009G067100 Sobic001G332100 Sobic001G332100 Sobic005G207200--Sobic001G332100 Sobic002G096700 Sobic002G096700 Sobic005G207200--Sobic002G096700 Sobic005G207200--Sobic004G174600 Sobic003G212700 Sobic003G212700 Sobic005G207200--Sobic003G212700 Sobic001G209500--Sobic008G101850 Sobic005G208600 Sobic005G208600 Sobic001G209500--Sobic005G208600 Sobic001G209500--Sobic005G207200 Sobic001G209500--Sobic002G402100 Sobic001G215201 Sobic001G215201 Sobic001G209500--Sobic001G215201 Sobic001G209500--Sobic001G246800 Sobic004G294000 Sobic004G294000 Sobic001G209500--Sobic004G294000 Sobic004G289200 Sobic004G289200 Sobic001G209500--Sobic004G289200 Sobic006G067300 Sobic006G067300 Sobic001G209500--Sobic006G067300 Sobic008G084000 Sobic008G084000 Sobic001G246800--Sobic008G084000 Sobic001G246800--Sobic005G070000 Sobic007G139850 Sobic007G139850 Sobic001G246800--Sobic007G139850 Sobic009G021050 Sobic009G021050 Sobic001G246800--Sobic009G021050 Sobic004G150901 Sobic004G150901 Sobic001G246800--Sobic004G150901 Sobic010G138600 Sobic010G138600 Sobic001G246800--Sobic010G138600 Sobic009G253600 Sobic009G253600 Sobic001G246800--Sobic009G253600 Sobic005G152550 Sobic005G152550 Sobic001G246800--Sobic005G152550 Sobic001G135650 Sobic001G135650 Sobic001G246800--Sobic001G135650 Sobic005G070000--Sobic005G207200 Sobic008G164000 Sobic008G164000 Sobic005G070000--Sobic008G164000 Sobic005G070000--Sobic001G332100 Sobic005G070000--Sobic005G198600 Sobic005G191200 Sobic005G191200 Sobic005G070000--Sobic005G191200 Sobic010G012700 Sobic010G012700 Sobic005G070000--Sobic010G012700 Sobic005G070000--Sobic002G096700 Sobic005G070000--Sobic001G135650 Sobic005G070000--Sobic001G246800 Sobic007G133766--Sobic007G083500 Sobic007G133766--Sobic009G067100 Sobic007G133766--Sobic006G124500 Sobic007G133766--Sobic005G207200 Sobic001G355300 Sobic001G355300 Sobic007G133766--Sobic001G355300 Sobic003G180700 Sobic003G180700 Sobic007G133766--Sobic003G180700 Sobic007G219300 Sobic007G219300 Sobic007G133766--Sobic007G219300 Sobic002G121100 Sobic002G121100 Sobic007G133766--Sobic002G121100 Sobic001G092650 Sobic001G092650 Sobic007G133766--Sobic001G092650 Sobic008G101850--Sobic001G215201 Sobic004G089400 Sobic004G089400 Sobic008G101850--Sobic004G089400 Sobic005G006701 Sobic005G006701 Sobic008G101850--Sobic005G006701 Sobic002G260100 Sobic002G260100 Sobic008G101850--Sobic002G260100 Sobic008G101850--Sobic001G209500 Sobic004G149200 Sobic004G149200 Sobic008G101850--Sobic004G149200 Sobic008G101850--Sobic006G067300 Sobic003G062900 Sobic003G062900 Sobic008G101850--Sobic003G062900 Sobic006G059400 Sobic006G059400 Sobic008G101850--Sobic006G059400 Sobic006G276600 Sobic006G276600 Sobic004G174600--Sobic006G276600 Sobic004G254700 Sobic004G254700 Sobic004G174600--Sobic004G254700 Sobic005G041500 Sobic005G041500 Sobic004G174600--Sobic005G041500 Sobic002G019300 Sobic002G019300 Sobic004G174600--Sobic002G019300 Sobic009G149100 Sobic009G149100 Sobic004G174600--Sobic009G149100 Sobic004G335400 Sobic004G335400 Sobic004G174600--Sobic004G335400 Sobic008G071700 Sobic008G071700 Sobic004G174600--Sobic008G071700 Sobic002G014300 Sobic002G014300 Sobic004G174600--Sobic002G014300 Sobic002G298600 Sobic002G298600 Sobic004G174600--Sobic002G298600 Sobic010G252550--Sobic005G198600 Sobic007G136000 Sobic007G136000 Sobic010G252550--Sobic007G136000 Sobic003G078000 Sobic003G078000 Sobic010G252550--Sobic003G078000 Sobic009G170900 Sobic009G170900 Sobic010G252550--Sobic009G170900 Sobic006G189600 Sobic006G189600 Sobic010G252550--Sobic006G189600 Sobic010G252550--Sobic008G084000 Sobic010G252550--Sobic004G150901 Sobic001G287700 Sobic001G287700 Sobic010G252550--Sobic001G287700 Sobic010G252550--Sobic010G138600 Sobic005G198600--Sobic006G189600 Sobic005G198600--Sobic003G078000 Sobic003G406060 Sobic003G406060 Sobic005G198600--Sobic003G406060 Sobic002G106700 Sobic002G106700 Sobic005G198600--Sobic002G106700 Sobic008G091785 Sobic008G091785 Sobic005G198600--Sobic008G091785 Sobic005G198600--Sobic008G164000 Sobic007G007400 Sobic007G007400 Sobic005G198600--Sobic007G007400 Sobic005G198600--Sobic001G135650 Sobic005G198600--Sobic005G191200
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.