Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G037701.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VRC0
Pfam PF03195
Panther DB PTHR31301 PTHR31301:SF21
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G13850 : LOB domain-containing protein 22
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g31080.1 : DUF260 domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G195900 expressed protein -
2 Sobic.004G218200 "domain confirmed by Pfam database, expression supported by NCBI EST database"(PubMedID : 20499123)@SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@CPuORF40 - conserved peptide uORF-containing transcript, expressed -
3 Sobic.007G136000 - -
4 Sobic.007G139850 - -
5 Sobic.009G021050 - -
6 Sobic.004G150901 - -
7 Sobic.005G152550 - -
8 Sobic.010G138600 expressed protein -
9 Sobic.009G253600 Rf1, mitochondrial precursor, putative, expressed -
10 Sobic.008G084000 - -
11 Sobic.010G252550 - -
12 Sobic.007G048000 - -
13 Sobic.003G078000 - -
14 Sobic.006G230000 - -
15 Sobic.003G106800 3-beta-hydroxysteroid-Delta-isomerase, putative, expressed K01824: cholestenol Delta-isomerase
16 Sobic.005G067200 expressed protein -
17 Sobic.005G198600 OsFBX422 - F-box domain containing protein, expressed -
18 Sobic.008G091785 - -
19 Sobic.003G144100 - -
20 Sobic.007G007400 OsFBL38 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G037701 Sobic010G037701 Sobic007G195900 Sobic007G195900 Sobic010G037701--Sobic007G195900 Sobic004G218200 Sobic004G218200 Sobic010G037701--Sobic004G218200 Sobic007G136000 Sobic007G136000 Sobic010G037701--Sobic007G136000 Sobic007G139850 Sobic007G139850 Sobic010G037701--Sobic007G139850 Sobic009G021050 Sobic009G021050 Sobic010G037701--Sobic009G021050 Sobic004G150901 Sobic004G150901 Sobic010G037701--Sobic004G150901 Sobic005G152550 Sobic005G152550 Sobic010G037701--Sobic005G152550 Sobic010G138600 Sobic010G138600 Sobic010G037701--Sobic010G138600 Sobic009G253600 Sobic009G253600 Sobic010G037701--Sobic009G253600 Sobic007G195900--Sobic010G037701 Sobic007G195900--Sobic004G218200 Sobic003G074300 Sobic003G074300 Sobic007G195900--Sobic003G074300 Sobic003G144100 Sobic003G144100 Sobic007G195900--Sobic003G144100 Sobic001G407300 Sobic001G407300 Sobic007G195900--Sobic001G407300 Sobic005G067200 Sobic005G067200 Sobic007G195900--Sobic005G067200 Sobic003G106800 Sobic003G106800 Sobic007G195900--Sobic003G106800 Sobic001G330775 Sobic001G330775 Sobic007G195900--Sobic001G330775 Sobic001G057900 Sobic001G057900 Sobic007G195900--Sobic001G057900 Sobic010G200600 Sobic010G200600 Sobic004G218200--Sobic010G200600 Sobic004G218200--Sobic005G067200 Sobic003G403000 Sobic003G403000 Sobic004G218200--Sobic003G403000 Sobic004G218200--Sobic007G195900 Sobic004G218200--Sobic005G152550 Sobic004G218200--Sobic010G037701 Sobic003G154900 Sobic003G154900 Sobic004G218200--Sobic003G154900 Sobic004G218200--Sobic007G136000 Sobic002G084200 Sobic002G084200 Sobic004G218200--Sobic002G084200 Sobic009G170900 Sobic009G170900 Sobic007G136000--Sobic009G170900 Sobic005G160801 Sobic005G160801 Sobic007G136000--Sobic005G160801 Sobic004G200100 Sobic004G200100 Sobic007G136000--Sobic004G200100 Sobic007G136000--Sobic005G067200 Sobic003G078000 Sobic003G078000 Sobic007G136000--Sobic003G078000 Sobic006G189600 Sobic006G189600 Sobic007G136000--Sobic006G189600 Sobic003G406060 Sobic003G406060 Sobic007G136000--Sobic003G406060 Sobic005G198600 Sobic005G198600 Sobic007G136000--Sobic005G198600 Sobic003G394000 Sobic003G394000 Sobic007G136000--Sobic003G394000 Sobic007G139850--Sobic009G021050 Sobic007G139850--Sobic004G150901 Sobic008G084000 Sobic008G084000 Sobic007G139850--Sobic008G084000 Sobic007G139850--Sobic010G138600 Sobic007G139850--Sobic009G253600 Sobic008G074200 Sobic008G074200 Sobic007G139850--Sobic008G074200 SobicK044420 SobicK044420 Sobic007G139850--SobicK044420 Sobic007G139850--Sobic005G152550 Sobic008G181701 Sobic008G181701 Sobic007G139850--Sobic008G181701 Sobic009G021050--Sobic007G139850 Sobic009G021050--Sobic004G150901 Sobic009G021050--Sobic008G084000 Sobic009G021050--Sobic010G138600 Sobic009G021050--Sobic009G253600 Sobic009G021050--SobicK044420 Sobic009G021050--Sobic008G074200 Sobic009G021050--Sobic005G152550 Sobic009G021050--Sobic008G181701 Sobic004G150901--Sobic010G138600 Sobic004G150901--Sobic009G253600 Sobic004G150901--Sobic008G084000 Sobic004G150901--Sobic007G139850 Sobic004G150901--Sobic009G021050 Sobic008G091785 Sobic008G091785 Sobic004G150901--Sobic008G091785 Sobic007G007400 Sobic007G007400 Sobic004G150901--Sobic007G007400 Sobic001G135650 Sobic001G135650 Sobic004G150901--Sobic001G135650 Sobic002G106700 Sobic002G106700 Sobic004G150901--Sobic002G106700 Sobic005G152550--Sobic007G139850 Sobic005G152550--Sobic009G021050 Sobic005G152550--Sobic004G150901 Sobic005G152550--Sobic008G084000 Sobic005G152550--Sobic010G138600 Sobic005G152550--Sobic009G253600 Sobic005G152550--Sobic008G181701 Sobic005G152550--Sobic003G403000 Sobic005G152550--Sobic008G074200 Sobic010G138600--Sobic009G253600 Sobic010G138600--Sobic004G150901 Sobic010G138600--Sobic008G091785 Sobic010G138600--Sobic008G084000 Sobic010G138600--Sobic007G007400 Sobic010G138600--Sobic002G106700 Sobic010G138600--Sobic001G135650 Sobic010G138600--Sobic007G139850 Sobic010G138600--Sobic009G021050 Sobic009G253600--Sobic010G138600 Sobic009G253600--Sobic004G150901 Sobic009G253600--Sobic008G091785 Sobic009G253600--Sobic008G084000 Sobic009G253600--Sobic007G007400 Sobic009G253600--Sobic002G106700 Sobic009G253600--Sobic001G135650 Sobic009G253600--Sobic007G139850 Sobic009G253600--Sobic009G021050
Octagon: transcription factors


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