Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G152550.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RJM3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g32570.2 : OsAPRL1 adenosine 5\'-phosphosulfate reductase-like OsAPRL1, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a048188 , Zm00025a014759
Brachypodium KQK16065
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G139850 - -
2 Sobic.009G021050 - -
3 Sobic.004G150901 - -
4 Sobic.008G084000 - -
5 Sobic.010G138600 expressed protein -
6 Sobic.009G253600 Rf1, mitochondrial precursor, putative, expressed -
7 Sobic.008G181701 - -
8 Sobic.003G403000 "major aluminum tolerance, s a plasma membrane anion efflux transporter responsible for citrate release into the rhizosphere"(PubMedID : 17721535)@Aluminum tolerance(PubMedID : 17721535)@MATE efflux protein, putative, expressed -
9 Sobic.008G074200 "Belonging to the Sdw3 locus, Sbi_sdw3"(PubMedID : 20464438)@expressed protein -
10 Sobic.008G091785 - -
11 Sobic.004G218200 "domain confirmed by Pfam database, expression supported by NCBI EST database"(PubMedID : 20499123)@SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@CPuORF40 - conserved peptide uORF-containing transcript, expressed -
12 Sobic.007G007400 OsFBL38 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
13 Sobic.001G135650 - -
14 Sobic.001G246800 MBTB44 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
15 Sobic.010G200600 nitrate-induced NOI protein, expressed -
16 Sobic.K044420 - -
17 Sobic.002G106700 OsWAK75 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
18 Sobic.003G078000 - -
19 Sobic.005G067200 expressed protein -
20 Sobic.010G037701 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G152550 Sobic005G152550 Sobic007G139850 Sobic007G139850 Sobic005G152550--Sobic007G139850 Sobic009G021050 Sobic009G021050 Sobic005G152550--Sobic009G021050 Sobic004G150901 Sobic004G150901 Sobic005G152550--Sobic004G150901 Sobic008G084000 Sobic008G084000 Sobic005G152550--Sobic008G084000 Sobic010G138600 Sobic010G138600 Sobic005G152550--Sobic010G138600 Sobic009G253600 Sobic009G253600 Sobic005G152550--Sobic009G253600 Sobic008G181701 Sobic008G181701 Sobic005G152550--Sobic008G181701 Sobic003G403000 Sobic003G403000 Sobic005G152550--Sobic003G403000 Sobic008G074200 Sobic008G074200 Sobic005G152550--Sobic008G074200 Sobic007G139850--Sobic009G021050 Sobic007G139850--Sobic004G150901 Sobic007G139850--Sobic008G084000 Sobic007G139850--Sobic010G138600 Sobic007G139850--Sobic009G253600 Sobic007G139850--Sobic008G074200 SobicK044420 SobicK044420 Sobic007G139850--SobicK044420 Sobic007G139850--Sobic005G152550 Sobic007G139850--Sobic008G181701 Sobic009G021050--Sobic007G139850 Sobic009G021050--Sobic004G150901 Sobic009G021050--Sobic008G084000 Sobic009G021050--Sobic010G138600 Sobic009G021050--Sobic009G253600 Sobic009G021050--SobicK044420 Sobic009G021050--Sobic008G074200 Sobic009G021050--Sobic005G152550 Sobic009G021050--Sobic008G181701 Sobic004G150901--Sobic010G138600 Sobic004G150901--Sobic009G253600 Sobic004G150901--Sobic008G084000 Sobic004G150901--Sobic007G139850 Sobic004G150901--Sobic009G021050 Sobic008G091785 Sobic008G091785 Sobic004G150901--Sobic008G091785 Sobic007G007400 Sobic007G007400 Sobic004G150901--Sobic007G007400 Sobic001G135650 Sobic001G135650 Sobic004G150901--Sobic001G135650 Sobic002G106700 Sobic002G106700 Sobic004G150901--Sobic002G106700 Sobic008G084000--Sobic004G150901 Sobic008G084000--Sobic010G138600 Sobic008G084000--Sobic009G253600 Sobic008G084000--Sobic007G139850 Sobic008G084000--Sobic009G021050 Sobic001G246800 Sobic001G246800 Sobic008G084000--Sobic001G246800 Sobic008G084000--Sobic008G091785 Sobic008G084000--Sobic007G007400 Sobic008G084000--Sobic001G135650 Sobic010G138600--Sobic009G253600 Sobic010G138600--Sobic004G150901 Sobic010G138600--Sobic008G091785 Sobic010G138600--Sobic008G084000 Sobic010G138600--Sobic007G007400 Sobic010G138600--Sobic002G106700 Sobic010G138600--Sobic001G135650 Sobic010G138600--Sobic007G139850 Sobic010G138600--Sobic009G021050 Sobic009G253600--Sobic010G138600 Sobic009G253600--Sobic004G150901 Sobic009G253600--Sobic008G091785 Sobic009G253600--Sobic008G084000 Sobic009G253600--Sobic007G007400 Sobic009G253600--Sobic002G106700 Sobic009G253600--Sobic001G135650 Sobic009G253600--Sobic007G139850 Sobic009G253600--Sobic009G021050 Sobic008G181701--SobicK044420 Sobic001G258500 Sobic001G258500 Sobic008G181701--Sobic001G258500 Sobic008G181701--Sobic009G021050 Sobic008G181701--Sobic007G139850 Sobic008G181701--Sobic005G152550 Sobic008G181701--Sobic008G074200 Sobic009G220400 Sobic009G220400 Sobic008G181701--Sobic009G220400 Sobic010G122900 Sobic010G122900 Sobic008G181701--Sobic010G122900 Sobic001G021100 Sobic001G021100 Sobic008G181701--Sobic001G021100 Sobic005G067200 Sobic005G067200 Sobic003G403000--Sobic005G067200 Sobic009G044200 Sobic009G044200 Sobic003G403000--Sobic009G044200 Sobic002G068701 Sobic002G068701 Sobic003G403000--Sobic002G068701 Sobic010G200600 Sobic010G200600 Sobic003G403000--Sobic010G200600 Sobic004G289100 Sobic004G289100 Sobic003G403000--Sobic004G289100 Sobic005G027250 Sobic005G027250 Sobic003G403000--Sobic005G027250 Sobic009G030001 Sobic009G030001 Sobic003G403000--Sobic009G030001 Sobic004G218200 Sobic004G218200 Sobic003G403000--Sobic004G218200 Sobic004G281500 Sobic004G281500 Sobic003G403000--Sobic004G281500 Sobic008G074200--Sobic009G021050 Sobic008G074200--Sobic007G139850 Sobic008G074200--Sobic004G150901 Sobic008G074200--Sobic008G084000 Sobic008G074200--Sobic010G138600 Sobic008G074200--Sobic009G253600 Sobic008G074200--SobicK044420 Sobic008G074200--Sobic005G152550 Sobic008G074200--Sobic008G181701
Octagon: transcription factors


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