Gene annotation
Transcriptome id Sobic.K044420.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VQR3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G220400 glyoxal oxidase-related, putative, expressed -
2 Sobic.005G071000 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
3 Sobic.001G056000 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
4 Sobic.004G236901 - -
5 Sobic.007G069900 expressed protein -
6 Sobic.010G123750 - -
7 Sobic.009G021050 - -
8 Sobic.007G139850 - -
9 Sobic.001G258500 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
10 Sobic.005G107200 FEN1A - Putative flap endonuclease protein, expressed -
11 Sobic.006G062466 - -
12 Sobic.008G031800 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
13 Sobic.008G181701 - -
14 Sobic.008G074200 "Belonging to the Sdw3 locus, Sbi_sdw3"(PubMedID : 20464438)@expressed protein -
15 Sobic.006G218950 - -
16 Sobic.007G084900 - -
17 Sobic.001G021100 mTERF family protein, expressed K15032: mTERF domain-containing protein, mitochondrial
18 Sobic.010G180500 ATP binding protein, putative, expressed -
19 Sobic.007G191000 DAG protein, chloroplast precursor, putative, expressed -
20 Sobic.005G186000 speckle-type POZ protein, putative, expressed K10523: speckle-type POZ protein


Gene co-expression network
sample SobicK044420 SobicK044420 Sobic009G220400 Sobic009G220400 SobicK044420--Sobic009G220400 Sobic005G071000 Sobic005G071000 SobicK044420--Sobic005G071000 Sobic001G056000 Sobic001G056000 SobicK044420--Sobic001G056000 Sobic004G236901 Sobic004G236901 SobicK044420--Sobic004G236901 Sobic007G069900 Sobic007G069900 SobicK044420--Sobic007G069900 Sobic010G123750 Sobic010G123750 SobicK044420--Sobic010G123750 Sobic009G021050 Sobic009G021050 SobicK044420--Sobic009G021050 Sobic007G139850 Sobic007G139850 SobicK044420--Sobic007G139850 Sobic001G258500 Sobic001G258500 SobicK044420--Sobic001G258500 Sobic009G220400--Sobic005G071000 Sobic009G220400--Sobic001G056000 Sobic009G220400--Sobic004G236901 Sobic009G220400--Sobic010G123750 Sobic009G220400--SobicK044420 Sobic009G220400--Sobic007G069900 Sobic009G220400--Sobic001G258500 Sobic008G031800 Sobic008G031800 Sobic009G220400--Sobic008G031800 Sobic007G084900 Sobic007G084900 Sobic009G220400--Sobic007G084900 Sobic005G071000--Sobic009G220400 Sobic005G071000--Sobic001G056000 Sobic005G071000--Sobic004G236901 Sobic005G071000--Sobic010G123750 Sobic005G071000--SobicK044420 Sobic005G071000--Sobic007G069900 Sobic005G071000--Sobic001G258500 Sobic003G384650 Sobic003G384650 Sobic005G071000--Sobic003G384650 Sobic005G071000--Sobic007G084900 Sobic001G056000--Sobic009G220400 Sobic001G056000--Sobic005G071000 Sobic001G056000--Sobic004G236901 Sobic001G056000--Sobic010G123750 Sobic001G056000--SobicK044420 Sobic001G056000--Sobic007G069900 Sobic001G056000--Sobic001G258500 Sobic001G056000--Sobic007G084900 Sobic001G056000--Sobic008G031800 Sobic004G236901--Sobic009G220400 Sobic004G236901--Sobic005G071000 Sobic004G236901--Sobic001G056000 Sobic004G236901--Sobic010G123750 Sobic004G236901--Sobic007G069900 Sobic004G236901--SobicK044420 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic004G236901--Sobic001G018700 Sobic007G069900--Sobic010G123750 Sobic007G069900--Sobic009G220400 Sobic007G069900--Sobic005G071000 Sobic007G069900--Sobic001G056000 Sobic007G069900--Sobic004G236901 Sobic007G069900--SobicK044420 Sobic001G507933 Sobic001G507933 Sobic007G069900--Sobic001G507933 Sobic008G177700 Sobic008G177700 Sobic007G069900--Sobic008G177700 Sobic003G242500 Sobic003G242500 Sobic007G069900--Sobic003G242500 Sobic010G123750--Sobic009G220400 Sobic010G123750--Sobic004G236901 Sobic010G123750--Sobic005G071000 Sobic010G123750--Sobic001G056000 Sobic010G123750--Sobic007G069900 Sobic004G075301 Sobic004G075301 Sobic010G123750--Sobic004G075301 Sobic010G123750--Sobic003G242500 Sobic010G123750--Sobic001G018700 Sobic009G021050--Sobic007G139850 Sobic004G150901 Sobic004G150901 Sobic009G021050--Sobic004G150901 Sobic008G084000 Sobic008G084000 Sobic009G021050--Sobic008G084000 Sobic010G138600 Sobic010G138600 Sobic009G021050--Sobic010G138600 Sobic009G253600 Sobic009G253600 Sobic009G021050--Sobic009G253600 Sobic009G021050--SobicK044420 Sobic008G074200 Sobic008G074200 Sobic009G021050--Sobic008G074200 Sobic005G152550 Sobic005G152550 Sobic009G021050--Sobic005G152550 Sobic008G181701 Sobic008G181701 Sobic009G021050--Sobic008G181701 Sobic007G139850--Sobic009G021050 Sobic007G139850--Sobic004G150901 Sobic007G139850--Sobic008G084000 Sobic007G139850--Sobic010G138600 Sobic007G139850--Sobic009G253600 Sobic007G139850--Sobic008G074200 Sobic007G139850--SobicK044420 Sobic007G139850--Sobic005G152550 Sobic007G139850--Sobic008G181701 Sobic006G062466 Sobic006G062466 Sobic001G258500--Sobic006G062466 Sobic001G258500--Sobic009G220400 Sobic001G258500--Sobic005G071000 Sobic001G258500--Sobic001G056000 Sobic001G258500--Sobic004G236901 Sobic001G258500--Sobic010G123750 Sobic001G258500--SobicK044420 Sobic009G024166 Sobic009G024166 Sobic001G258500--Sobic009G024166 Sobic006G257250 Sobic006G257250 Sobic001G258500--Sobic006G257250
Octagon: transcription factors


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