Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G186000.2
Synonym BPM1, Sb05g024370, ATBPM1
Functional annotation speckle-type POZ protein, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RK51 , Q9XE73
Pfam PF00917
Panther DB PTHR26379
NCBI CDD -
KEGG Orthology K10523; speckle-type POZ protein
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G39760 : BTB/POZ/MATH-domains containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g35310.1 : MBTB4 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic005G186000 Sobic005G186000 Sobic005G107200 Sobic005G107200 Sobic005G186000--Sobic005G107200 SobicK044420 SobicK044420 Sobic005G186000--SobicK044420 Sobic009G220400 Sobic009G220400 Sobic005G186000--Sobic009G220400 Sobic005G071000 Sobic005G071000 Sobic005G186000--Sobic005G071000 Sobic001G056000 Sobic001G056000 Sobic005G186000--Sobic001G056000 Sobic004G236901 Sobic004G236901 Sobic005G186000--Sobic004G236901 Sobic010G123750 Sobic010G123750 Sobic005G186000--Sobic010G123750 Sobic007G069900 Sobic007G069900 Sobic005G186000--Sobic007G069900 Sobic008G031800 Sobic008G031800 Sobic005G186000--Sobic008G031800 Sobic005G107200--SobicK044420 Sobic005G107200--Sobic009G220400 Sobic005G107200--Sobic005G071000 Sobic005G107200--Sobic001G056000 Sobic005G107200--Sobic004G236901 Sobic005G107200--Sobic010G123750 Sobic005G107200--Sobic007G069900 Sobic005G107200--Sobic005G186000 Sobic001G258500 Sobic001G258500 Sobic005G107200--Sobic001G258500 SobicK044420--Sobic009G220400 SobicK044420--Sobic005G071000 SobicK044420--Sobic001G056000 SobicK044420--Sobic004G236901 SobicK044420--Sobic007G069900 SobicK044420--Sobic010G123750 Sobic009G021050 Sobic009G021050 SobicK044420--Sobic009G021050 Sobic007G139850 Sobic007G139850 SobicK044420--Sobic007G139850 SobicK044420--Sobic001G258500 Sobic009G220400--Sobic005G071000 Sobic009G220400--Sobic001G056000 Sobic009G220400--Sobic004G236901 Sobic009G220400--Sobic010G123750 Sobic009G220400--SobicK044420 Sobic009G220400--Sobic007G069900 Sobic009G220400--Sobic001G258500 Sobic009G220400--Sobic008G031800 Sobic007G084900 Sobic007G084900 Sobic009G220400--Sobic007G084900 Sobic005G071000--Sobic009G220400 Sobic005G071000--Sobic001G056000 Sobic005G071000--Sobic004G236901 Sobic005G071000--Sobic010G123750 Sobic005G071000--SobicK044420 Sobic005G071000--Sobic007G069900 Sobic005G071000--Sobic001G258500 Sobic003G384650 Sobic003G384650 Sobic005G071000--Sobic003G384650 Sobic005G071000--Sobic007G084900 Sobic001G056000--Sobic009G220400 Sobic001G056000--Sobic005G071000 Sobic001G056000--Sobic004G236901 Sobic001G056000--Sobic010G123750 Sobic001G056000--SobicK044420 Sobic001G056000--Sobic007G069900 Sobic001G056000--Sobic001G258500 Sobic001G056000--Sobic007G084900 Sobic001G056000--Sobic008G031800 Sobic004G236901--Sobic009G220400 Sobic004G236901--Sobic005G071000 Sobic004G236901--Sobic001G056000 Sobic004G236901--Sobic010G123750 Sobic004G236901--Sobic007G069900 Sobic004G236901--SobicK044420 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic004G236901--Sobic001G018700 Sobic010G123750--Sobic009G220400 Sobic010G123750--Sobic004G236901 Sobic010G123750--Sobic005G071000 Sobic010G123750--Sobic001G056000 Sobic010G123750--Sobic007G069900 Sobic004G075301 Sobic004G075301 Sobic010G123750--Sobic004G075301 Sobic003G242500 Sobic003G242500 Sobic010G123750--Sobic003G242500 Sobic010G123750--Sobic001G018700 Sobic007G069900--Sobic010G123750 Sobic007G069900--Sobic009G220400 Sobic007G069900--Sobic005G071000 Sobic007G069900--Sobic001G056000 Sobic007G069900--Sobic004G236901 Sobic007G069900--SobicK044420 Sobic001G507933 Sobic001G507933 Sobic007G069900--Sobic001G507933 Sobic008G177700 Sobic008G177700 Sobic007G069900--Sobic008G177700 Sobic007G069900--Sobic003G242500 Sobic001G185700 Sobic001G185700 Sobic008G031800--Sobic001G185700 Sobic008G031800--Sobic010G123750 Sobic008G031800--Sobic004G236901 Sobic001G328850 Sobic001G328850 Sobic008G031800--Sobic001G328850 Sobic008G031800--Sobic005G071000 Sobic008G031800--Sobic009G220400 Sobic008G031800--Sobic001G056000 Sobic009G062150 Sobic009G062150 Sobic008G031800--Sobic009G062150 Sobic006G204850 Sobic006G204850 Sobic008G031800--Sobic006G204850
Octagon: transcription factors


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