Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G074200.1
Synonym F-box, Sb08g006670
Functional annotation "Belonging to the Sdw3 locus, Sbi_sdw3" (PubMedID : 20464438)
expressed protein
UniProt C5YTN8
Pfam PF00646
Panther DB PTHR32212 PTHR32212:SF102
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G59160 : F-box/RNI-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g30750.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G021050 - -
2 Sobic.007G139850 - -
3 Sobic.004G150901 - -
4 Sobic.008G084000 - -
5 Sobic.010G138600 expressed protein -
6 Sobic.009G253600 Rf1, mitochondrial precursor, putative, expressed -
7 Sobic.K044420 - -
8 Sobic.005G152550 - -
9 Sobic.008G181701 - -
10 Sobic.007G007400 OsFBL38 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
11 Sobic.008G091785 - -
12 Sobic.005G107200 FEN1A - Putative flap endonuclease protein, expressed -
13 Sobic.009G220400 glyoxal oxidase-related, putative, expressed -
14 Sobic.001G246800 MBTB44 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
15 Sobic.001G135650 - -
16 Sobic.007G191000 DAG protein, chloroplast precursor, putative, expressed -
17 Sobic.003G078000 - -
18 Sobic.007G069900 expressed protein -
19 Sobic.001G258500 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
20 Sobic.005G071000 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G074200 Sobic008G074200 Sobic009G021050 Sobic009G021050 Sobic008G074200--Sobic009G021050 Sobic007G139850 Sobic007G139850 Sobic008G074200--Sobic007G139850 Sobic004G150901 Sobic004G150901 Sobic008G074200--Sobic004G150901 Sobic008G084000 Sobic008G084000 Sobic008G074200--Sobic008G084000 Sobic010G138600 Sobic010G138600 Sobic008G074200--Sobic010G138600 Sobic009G253600 Sobic009G253600 Sobic008G074200--Sobic009G253600 SobicK044420 SobicK044420 Sobic008G074200--SobicK044420 Sobic005G152550 Sobic005G152550 Sobic008G074200--Sobic005G152550 Sobic008G181701 Sobic008G181701 Sobic008G074200--Sobic008G181701 Sobic009G021050--Sobic007G139850 Sobic009G021050--Sobic004G150901 Sobic009G021050--Sobic008G084000 Sobic009G021050--Sobic010G138600 Sobic009G021050--Sobic009G253600 Sobic009G021050--SobicK044420 Sobic009G021050--Sobic008G074200 Sobic009G021050--Sobic005G152550 Sobic009G021050--Sobic008G181701 Sobic007G139850--Sobic009G021050 Sobic007G139850--Sobic004G150901 Sobic007G139850--Sobic008G084000 Sobic007G139850--Sobic010G138600 Sobic007G139850--Sobic009G253600 Sobic007G139850--Sobic008G074200 Sobic007G139850--SobicK044420 Sobic007G139850--Sobic005G152550 Sobic007G139850--Sobic008G181701 Sobic004G150901--Sobic010G138600 Sobic004G150901--Sobic009G253600 Sobic004G150901--Sobic008G084000 Sobic004G150901--Sobic007G139850 Sobic004G150901--Sobic009G021050 Sobic008G091785 Sobic008G091785 Sobic004G150901--Sobic008G091785 Sobic007G007400 Sobic007G007400 Sobic004G150901--Sobic007G007400 Sobic001G135650 Sobic001G135650 Sobic004G150901--Sobic001G135650 Sobic002G106700 Sobic002G106700 Sobic004G150901--Sobic002G106700 Sobic008G084000--Sobic004G150901 Sobic008G084000--Sobic010G138600 Sobic008G084000--Sobic009G253600 Sobic008G084000--Sobic007G139850 Sobic008G084000--Sobic009G021050 Sobic001G246800 Sobic001G246800 Sobic008G084000--Sobic001G246800 Sobic008G084000--Sobic008G091785 Sobic008G084000--Sobic007G007400 Sobic008G084000--Sobic001G135650 Sobic010G138600--Sobic009G253600 Sobic010G138600--Sobic004G150901 Sobic010G138600--Sobic008G091785 Sobic010G138600--Sobic008G084000 Sobic010G138600--Sobic007G007400 Sobic010G138600--Sobic002G106700 Sobic010G138600--Sobic001G135650 Sobic010G138600--Sobic007G139850 Sobic010G138600--Sobic009G021050 Sobic009G253600--Sobic010G138600 Sobic009G253600--Sobic004G150901 Sobic009G253600--Sobic008G091785 Sobic009G253600--Sobic008G084000 Sobic009G253600--Sobic007G007400 Sobic009G253600--Sobic002G106700 Sobic009G253600--Sobic001G135650 Sobic009G253600--Sobic007G139850 Sobic009G253600--Sobic009G021050 Sobic009G220400 Sobic009G220400 SobicK044420--Sobic009G220400 Sobic005G071000 Sobic005G071000 SobicK044420--Sobic005G071000 Sobic001G056000 Sobic001G056000 SobicK044420--Sobic001G056000 Sobic004G236901 Sobic004G236901 SobicK044420--Sobic004G236901 Sobic007G069900 Sobic007G069900 SobicK044420--Sobic007G069900 Sobic010G123750 Sobic010G123750 SobicK044420--Sobic010G123750 SobicK044420--Sobic009G021050 SobicK044420--Sobic007G139850 Sobic001G258500 Sobic001G258500 SobicK044420--Sobic001G258500 Sobic005G152550--Sobic007G139850 Sobic005G152550--Sobic009G021050 Sobic005G152550--Sobic004G150901 Sobic005G152550--Sobic008G084000 Sobic005G152550--Sobic010G138600 Sobic005G152550--Sobic009G253600 Sobic005G152550--Sobic008G181701 Sobic003G403000 Sobic003G403000 Sobic005G152550--Sobic003G403000 Sobic005G152550--Sobic008G074200 Sobic008G181701--SobicK044420 Sobic008G181701--Sobic001G258500 Sobic008G181701--Sobic009G021050 Sobic008G181701--Sobic007G139850 Sobic008G181701--Sobic005G152550 Sobic008G181701--Sobic008G074200 Sobic008G181701--Sobic009G220400 Sobic010G122900 Sobic010G122900 Sobic008G181701--Sobic010G122900 Sobic001G021100 Sobic001G021100 Sobic008G181701--Sobic001G021100
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.