Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G246800.1
Synonym BPM1, Sb01g021830, ATBPM1
Functional annotation MBTB44 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed
UniProt A0A1B6QKS6
Pfam PF00917 PF00651
Panther DB PTHR26379 PTHR26379:SF162
NCBI CDD -
KEGG Orthology K10523; speckle-type POZ protein
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G19000 : BTB-POZ and MATH domain 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g29310.1 : MBTB51 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium PNT69374 , KQK01196
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G084000 - -
2 Sobic.005G070000 OsWAK92 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
3 Sobic.007G139850 - -
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5 Sobic.004G150901 - -
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7 Sobic.009G253600 Rf1, mitochondrial precursor, putative, expressed -
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9 Sobic.001G135650 - -
10 Sobic.005G207200 OsFBX101 - F-box domain containing protein, expressed -
11 Sobic.005G198600 OsFBX422 - F-box domain containing protein, expressed -
12 Sobic.008G074200 "Belonging to the Sdw3 locus, Sbi_sdw3"(PubMedID : 20464438)@expressed protein -
13 Sobic.008G091785 - -
14 Sobic.007G007400 OsFBL38 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
15 Sobic.K044420 - -
16 Sobic.002G402100 LTPL60 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, putative, expressed -
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18 Sobic.002G106700 OsWAK75 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
19 Sobic.008G164000 OsFBX358 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.003G078000 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G246800 Sobic001G246800 Sobic008G084000 Sobic008G084000 Sobic001G246800--Sobic008G084000 Sobic005G070000 Sobic005G070000 Sobic001G246800--Sobic005G070000 Sobic007G139850 Sobic007G139850 Sobic001G246800--Sobic007G139850 Sobic009G021050 Sobic009G021050 Sobic001G246800--Sobic009G021050 Sobic004G150901 Sobic004G150901 Sobic001G246800--Sobic004G150901 Sobic010G138600 Sobic010G138600 Sobic001G246800--Sobic010G138600 Sobic009G253600 Sobic009G253600 Sobic001G246800--Sobic009G253600 Sobic005G152550 Sobic005G152550 Sobic001G246800--Sobic005G152550 Sobic001G135650 Sobic001G135650 Sobic001G246800--Sobic001G135650 Sobic008G084000--Sobic004G150901 Sobic008G084000--Sobic010G138600 Sobic008G084000--Sobic009G253600 Sobic008G084000--Sobic007G139850 Sobic008G084000--Sobic009G021050 Sobic008G084000--Sobic001G246800 Sobic008G091785 Sobic008G091785 Sobic008G084000--Sobic008G091785 Sobic007G007400 Sobic007G007400 Sobic008G084000--Sobic007G007400 Sobic008G084000--Sobic001G135650 Sobic005G207200 Sobic005G207200 Sobic005G070000--Sobic005G207200 Sobic008G164000 Sobic008G164000 Sobic005G070000--Sobic008G164000 Sobic001G332100 Sobic001G332100 Sobic005G070000--Sobic001G332100 Sobic005G198600 Sobic005G198600 Sobic005G070000--Sobic005G198600 Sobic005G191200 Sobic005G191200 Sobic005G070000--Sobic005G191200 Sobic010G012700 Sobic010G012700 Sobic005G070000--Sobic010G012700 Sobic002G096700 Sobic002G096700 Sobic005G070000--Sobic002G096700 Sobic005G070000--Sobic001G135650 Sobic005G070000--Sobic001G246800 Sobic007G139850--Sobic009G021050 Sobic007G139850--Sobic004G150901 Sobic007G139850--Sobic008G084000 Sobic007G139850--Sobic010G138600 Sobic007G139850--Sobic009G253600 Sobic008G074200 Sobic008G074200 Sobic007G139850--Sobic008G074200 SobicK044420 SobicK044420 Sobic007G139850--SobicK044420 Sobic007G139850--Sobic005G152550 Sobic008G181701 Sobic008G181701 Sobic007G139850--Sobic008G181701 Sobic009G021050--Sobic007G139850 Sobic009G021050--Sobic004G150901 Sobic009G021050--Sobic008G084000 Sobic009G021050--Sobic010G138600 Sobic009G021050--Sobic009G253600 Sobic009G021050--SobicK044420 Sobic009G021050--Sobic008G074200 Sobic009G021050--Sobic005G152550 Sobic009G021050--Sobic008G181701 Sobic004G150901--Sobic010G138600 Sobic004G150901--Sobic009G253600 Sobic004G150901--Sobic008G084000 Sobic004G150901--Sobic007G139850 Sobic004G150901--Sobic009G021050 Sobic004G150901--Sobic008G091785 Sobic004G150901--Sobic007G007400 Sobic004G150901--Sobic001G135650 Sobic002G106700 Sobic002G106700 Sobic004G150901--Sobic002G106700 Sobic010G138600--Sobic009G253600 Sobic010G138600--Sobic004G150901 Sobic010G138600--Sobic008G091785 Sobic010G138600--Sobic008G084000 Sobic010G138600--Sobic007G007400 Sobic010G138600--Sobic002G106700 Sobic010G138600--Sobic001G135650 Sobic010G138600--Sobic007G139850 Sobic010G138600--Sobic009G021050 Sobic009G253600--Sobic010G138600 Sobic009G253600--Sobic004G150901 Sobic009G253600--Sobic008G091785 Sobic009G253600--Sobic008G084000 Sobic009G253600--Sobic007G007400 Sobic009G253600--Sobic002G106700 Sobic009G253600--Sobic001G135650 Sobic009G253600--Sobic007G139850 Sobic009G253600--Sobic009G021050 Sobic005G152550--Sobic007G139850 Sobic005G152550--Sobic009G021050 Sobic005G152550--Sobic004G150901 Sobic005G152550--Sobic008G084000 Sobic005G152550--Sobic010G138600 Sobic005G152550--Sobic009G253600 Sobic005G152550--Sobic008G181701 Sobic003G403000 Sobic003G403000 Sobic005G152550--Sobic003G403000 Sobic005G152550--Sobic008G074200 Sobic001G135650--Sobic008G091785 Sobic001G135650--Sobic002G106700 Sobic001G135650--Sobic007G007400 Sobic001G135650--Sobic009G253600 Sobic001G135650--Sobic010G138600 Sobic001G135650--Sobic004G150901 Sobic003G078000 Sobic003G078000 Sobic001G135650--Sobic003G078000 Sobic001G135650--Sobic008G164000 Sobic006G230000 Sobic006G230000 Sobic001G135650--Sobic006G230000
Octagon: transcription factors


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