Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G164000.1
Synonym Sb08g021030
Functional annotation OsFBX358 - F-box domain containing protein, expressed
UniProt C5YRU0
Pfam PF12937
Panther DB PTHR32133 PTHR32133:SF130
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g36910.1 : OsFBX254 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G191200 - K12858: DDX23, ATP-dependent RNA helicase DDX23/PRP28
2 Sobic.002G106700 OsWAK75 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
3 Sobic.003G406060 - -
4 Sobic.008G091785 - -
5 Sobic.006G230000 - -
6 Sobic.007G007400 OsFBL38 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
7 Sobic.001G144150 - -
8 Sobic.001G135650 - -
9 Sobic.K028900 - -
10 Sobic.010G014850 - -
11 Sobic.005G198600 OsFBX422 - F-box domain containing protein, expressed -
12 Sobic.003G078000 - -
13 Sobic.003G075300 OsFBX64 - F-box domain containing protein, expressed -
14 Sobic.006G189600 - -
15 Sobic.010G158050 - -
16 Sobic.005G070000 OsWAK92 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
17 Sobic.010G012700 katanin p60 ATPase-containing subunit, putative, expressed -
18 Sobic.002G027901 - K10523: speckle-type POZ protein
19 Sobic.003G394000 - -
20 Sobic.001G140950 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G164000 Sobic008G164000 Sobic005G191200 Sobic005G191200 Sobic008G164000--Sobic005G191200 Sobic002G106700 Sobic002G106700 Sobic008G164000--Sobic002G106700 Sobic003G406060 Sobic003G406060 Sobic008G164000--Sobic003G406060 Sobic008G091785 Sobic008G091785 Sobic008G164000--Sobic008G091785 Sobic006G230000 Sobic006G230000 Sobic008G164000--Sobic006G230000 Sobic007G007400 Sobic007G007400 Sobic008G164000--Sobic007G007400 Sobic001G144150 Sobic001G144150 Sobic008G164000--Sobic001G144150 Sobic001G135650 Sobic001G135650 Sobic008G164000--Sobic001G135650 SobicK028900 SobicK028900 Sobic008G164000--SobicK028900 Sobic010G014850 Sobic010G014850 Sobic005G191200--Sobic010G014850 Sobic005G191200--Sobic003G406060 Sobic003G075300 Sobic003G075300 Sobic005G191200--Sobic003G075300 Sobic005G191200--SobicK028900 Sobic005G191200--Sobic001G144150 Sobic010G158050 Sobic010G158050 Sobic005G191200--Sobic010G158050 Sobic005G191200--Sobic008G164000 Sobic005G200100 Sobic005G200100 Sobic005G191200--Sobic005G200100 Sobic010G012700 Sobic010G012700 Sobic005G191200--Sobic010G012700 Sobic002G106700--Sobic008G091785 Sobic002G106700--Sobic007G007400 Sobic002G106700--Sobic001G135650 Sobic002G106700--Sobic006G230000 Sobic002G106700--Sobic008G164000 Sobic003G078000 Sobic003G078000 Sobic002G106700--Sobic003G078000 Sobic009G253600 Sobic009G253600 Sobic002G106700--Sobic009G253600 Sobic010G138600 Sobic010G138600 Sobic002G106700--Sobic010G138600 Sobic002G106700--Sobic003G406060 Sobic003G406060--Sobic005G191200 Sobic003G406060--Sobic005G200100 Sobic006G189600 Sobic006G189600 Sobic003G406060--Sobic006G189600 Sobic001G251000 Sobic001G251000 Sobic003G406060--Sobic001G251000 Sobic003G406060--Sobic010G014850 Sobic003G406060--SobicK028900 Sobic003G406060--Sobic002G106700 Sobic003G406060--Sobic003G078000 Sobic003G406060--Sobic008G164000 Sobic008G091785--Sobic007G007400 Sobic008G091785--Sobic002G106700 Sobic008G091785--Sobic001G135650 Sobic008G091785--Sobic009G253600 Sobic008G091785--Sobic010G138600 Sobic008G091785--Sobic003G078000 Sobic004G150901 Sobic004G150901 Sobic008G091785--Sobic004G150901 Sobic008G091785--Sobic006G230000 Sobic008G091785--Sobic008G164000 Sobic006G230000--Sobic002G106700 Sobic006G230000--Sobic008G091785 Sobic006G230000--Sobic007G007400 Sobic006G230000--Sobic008G164000 Sobic006G230000--Sobic005G191200 Sobic006G230000--Sobic003G406060 Sobic006G230000--Sobic001G135650 Sobic006G230000--SobicK028900 Sobic006G230000--Sobic003G078000 Sobic007G007400--Sobic008G091785 Sobic007G007400--Sobic002G106700 Sobic007G007400--Sobic001G135650 Sobic007G007400--Sobic009G253600 Sobic007G007400--Sobic010G138600 Sobic007G007400--Sobic003G078000 Sobic007G007400--Sobic004G150901 Sobic007G007400--Sobic006G230000 Sobic007G007400--Sobic008G164000 Sobic001G144150--Sobic005G191200 Sobic001G144150--Sobic010G014850 Sobic001G144150--Sobic003G075300 Sobic001G144150--SobicK028900 Sobic001G144150--Sobic010G158050 Sobic001G144150--Sobic003G406060 Sobic001G144150--Sobic010G012700 Sobic005G201501 Sobic005G201501 Sobic001G144150--Sobic005G201501 Sobic001G144150--Sobic008G164000 Sobic001G135650--Sobic008G091785 Sobic001G135650--Sobic002G106700 Sobic001G135650--Sobic007G007400 Sobic001G135650--Sobic009G253600 Sobic001G135650--Sobic010G138600 Sobic001G135650--Sobic004G150901 Sobic001G135650--Sobic003G078000 Sobic001G135650--Sobic008G164000 Sobic001G135650--Sobic006G230000 SobicK028900--Sobic010G014850 SobicK028900--Sobic010G158050 SobicK028900--Sobic005G191200 Sobic004G057000 Sobic004G057000 SobicK028900--Sobic004G057000 Sobic005G199800 Sobic005G199800 SobicK028900--Sobic005G199800 Sobic010G157900 Sobic010G157900 SobicK028900--Sobic010G157900 SobicK028900--Sobic003G075300 SobicK028900--Sobic001G144150 SobicK028900--Sobic003G406060
Octagon: transcription factors


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