Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G394000.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q7Q0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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TAIR -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G200100 leucine-rich repeat family protein, putative, expressed -
2 Sobic.003G406060 - -
3 Sobic.005G200100 - -
4 Sobic.001G251000 - -
5 Sobic.010G074000 expressed protein -
6 Sobic.004G060400 ANTH/ENTH domain containing protein, putative, expressed -
7 Sobic.002G027901 - K10523: speckle-type POZ protein
8 Sobic.004G348000 white-brown complex homolog protein, putative, expressed -
9 Sobic.003G254200 ATROPGEF7/ROPGEF7, putative, expressed -
10 Sobic.004G048900 myosin heavy chain, putative, expressed -
11 Sobic.005G191200 - K12858: DDX23, ATP-dependent RNA helicase DDX23/PRP28
12 Sobic.009G170900 ATCHX15, putative, expressed -
13 Sobic.003G302532 - -
14 Sobic.009G246600 - -
15 Sobic.005G161400 - -
16 Sobic.008G164000 OsFBX358 - F-box domain containing protein, expressed -
17 Sobic.009G176200 expressed protein -
18 Sobic.004G031900 phosphatidylinositol transfer, putative, expressed -
19 Sobic.010G014850 - -
20 Sobic.006G232700 BTBN12 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with non-phototropic hypocotyl 3 NPH3 and coiled-coil domains, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G394000 Sobic003G394000 Sobic004G200100 Sobic004G200100 Sobic003G394000--Sobic004G200100 Sobic003G406060 Sobic003G406060 Sobic003G394000--Sobic003G406060 Sobic005G200100 Sobic005G200100 Sobic003G394000--Sobic005G200100 Sobic001G251000 Sobic001G251000 Sobic003G394000--Sobic001G251000 Sobic010G074000 Sobic010G074000 Sobic003G394000--Sobic010G074000 Sobic004G060400 Sobic004G060400 Sobic003G394000--Sobic004G060400 Sobic002G027901 Sobic002G027901 Sobic003G394000--Sobic002G027901 Sobic004G348000 Sobic004G348000 Sobic003G394000--Sobic004G348000 Sobic003G254200 Sobic003G254200 Sobic003G394000--Sobic003G254200 Sobic004G200100--Sobic003G394000 Sobic009G170900 Sobic009G170900 Sobic004G200100--Sobic009G170900 Sobic007G136000 Sobic007G136000 Sobic004G200100--Sobic007G136000 Sobic004G234000 Sobic004G234000 Sobic004G200100--Sobic004G234000 Sobic002G381800 Sobic002G381800 Sobic004G200100--Sobic002G381800 Sobic005G160801 Sobic005G160801 Sobic004G200100--Sobic005G160801 Sobic010G082300 Sobic010G082300 Sobic004G200100--Sobic010G082300 Sobic004G200100--Sobic004G060400 Sobic004G200100--Sobic004G348000 Sobic005G191200 Sobic005G191200 Sobic003G406060--Sobic005G191200 Sobic003G406060--Sobic005G200100 Sobic006G189600 Sobic006G189600 Sobic003G406060--Sobic006G189600 Sobic003G406060--Sobic001G251000 Sobic010G014850 Sobic010G014850 Sobic003G406060--Sobic010G014850 SobicK028900 SobicK028900 Sobic003G406060--SobicK028900 Sobic002G106700 Sobic002G106700 Sobic003G406060--Sobic002G106700 Sobic003G078000 Sobic003G078000 Sobic003G406060--Sobic003G078000 Sobic008G164000 Sobic008G164000 Sobic003G406060--Sobic008G164000 Sobic005G200100--Sobic001G251000 Sobic005G200100--Sobic003G406060 Sobic003G302532 Sobic003G302532 Sobic005G200100--Sobic003G302532 Sobic005G200100--Sobic004G348000 Sobic001G252151 Sobic001G252151 Sobic005G200100--Sobic001G252151 Sobic005G200100--Sobic010G014850 Sobic005G200100--Sobic005G191200 Sobic010G158050 Sobic010G158050 Sobic005G200100--Sobic010G158050 Sobic004G059200 Sobic004G059200 Sobic005G200100--Sobic004G059200 Sobic001G251000--Sobic005G200100 Sobic001G251000--Sobic004G348000 Sobic001G251000--Sobic003G302532 Sobic001G251000--Sobic001G252151 Sobic001G251000--Sobic004G059200 Sobic009G125100 Sobic009G125100 Sobic001G251000--Sobic009G125100 Sobic004G252850 Sobic004G252850 Sobic001G251000--Sobic004G252850 Sobic010G026200 Sobic010G026200 Sobic001G251000--Sobic010G026200 Sobic001G251000--Sobic003G406060 Sobic010G074000--Sobic003G254200 Sobic009G249400 Sobic009G249400 Sobic010G074000--Sobic009G249400 Sobic007G185801 Sobic007G185801 Sobic010G074000--Sobic007G185801 Sobic003G208900 Sobic003G208900 Sobic010G074000--Sobic003G208900 Sobic006G232700 Sobic006G232700 Sobic010G074000--Sobic006G232700 Sobic010G187800 Sobic010G187800 Sobic010G074000--Sobic010G187800 Sobic005G147900 Sobic005G147900 Sobic010G074000--Sobic005G147900 Sobic008G052800 Sobic008G052800 Sobic010G074000--Sobic008G052800 Sobic010G030500 Sobic010G030500 Sobic010G074000--Sobic010G030500 Sobic004G060400--Sobic004G348000 Sobic004G060400--Sobic010G074000 Sobic004G031900 Sobic004G031900 Sobic004G060400--Sobic004G031900 Sobic009G176200 Sobic009G176200 Sobic004G060400--Sobic009G176200 Sobic004G060400--Sobic009G249400 Sobic004G060400--Sobic003G254200 Sobic007G161100 Sobic007G161100 Sobic004G060400--Sobic007G161100 Sobic004G288000 Sobic004G288000 Sobic004G060400--Sobic004G288000 Sobic001G196400 Sobic001G196400 Sobic004G060400--Sobic001G196400 Sobic002G027901--Sobic010G074000 Sobic005G161400 Sobic005G161400 Sobic002G027901--Sobic005G161400 Sobic002G027901--Sobic006G232700 Sobic002G027901--Sobic003G254200 Sobic009G246600 Sobic009G246600 Sobic002G027901--Sobic009G246600 Sobic003G211000 Sobic003G211000 Sobic002G027901--Sobic003G211000 Sobic002G027901--Sobic010G030500 Sobic005G199800 Sobic005G199800 Sobic002G027901--Sobic005G199800 Sobic002G027901--Sobic003G394000 Sobic004G348000--Sobic004G059200 Sobic004G348000--Sobic001G251000 Sobic004G348000--Sobic009G125100 Sobic004G348000--Sobic004G060400 Sobic004G348000--Sobic007G161100 Sobic004G348000--Sobic009G176200 Sobic004G348000--Sobic005G200100 Sobic005G039000 Sobic005G039000 Sobic004G348000--Sobic005G039000 Sobic004G348000--Sobic001G196400 Sobic003G254200--Sobic010G074000 Sobic003G254200--Sobic009G249400 Sobic004G048900 Sobic004G048900 Sobic003G254200--Sobic004G048900 Sobic003G254200--Sobic007G185801 Sobic003G254200--Sobic008G052800 Sobic003G254200--Sobic003G208900 Sobic003G254200--Sobic006G232700 Sobic003G254200--Sobic010G187800 Sobic003G254200--Sobic010G030500
Octagon: transcription factors


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