Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G200100.1
Synonym Sb04g024650, PIRL1
Functional annotation leucine-rich repeat family protein, putative, expressed
UniProt C5XWH1
Pfam PF13855
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF516
NCBI CDD KOG0617; Ras suppressor protein (contains leucine-rich repeats)
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G05850 : plant intracellular ras group-related LRR 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g38040.1 : leucine-rich repeat family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a021332
Brachypodium KQK00142
Barley HORVU6Hr1G053210.1 , HORVU6Hr1G053210.3 , HORVU6Hr1G053210.2 , HORVU6Hr1G053210.4
Wheat TraesCS2D02G335800 , TraesCS2A02G327100 , TraesCS2B02G354900 , TraesCS6D02G191800
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.004G288000 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G200100 Sobic004G200100 Sobic003G394000 Sobic003G394000 Sobic004G200100--Sobic003G394000 Sobic009G170900 Sobic009G170900 Sobic004G200100--Sobic009G170900 Sobic007G136000 Sobic007G136000 Sobic004G200100--Sobic007G136000 Sobic004G234000 Sobic004G234000 Sobic004G200100--Sobic004G234000 Sobic002G381800 Sobic002G381800 Sobic004G200100--Sobic002G381800 Sobic005G160801 Sobic005G160801 Sobic004G200100--Sobic005G160801 Sobic010G082300 Sobic010G082300 Sobic004G200100--Sobic010G082300 Sobic004G060400 Sobic004G060400 Sobic004G200100--Sobic004G060400 Sobic004G348000 Sobic004G348000 Sobic004G200100--Sobic004G348000 Sobic003G394000--Sobic004G200100 Sobic003G406060 Sobic003G406060 Sobic003G394000--Sobic003G406060 Sobic005G200100 Sobic005G200100 Sobic003G394000--Sobic005G200100 Sobic001G251000 Sobic001G251000 Sobic003G394000--Sobic001G251000 Sobic010G074000 Sobic010G074000 Sobic003G394000--Sobic010G074000 Sobic003G394000--Sobic004G060400 Sobic002G027901 Sobic002G027901 Sobic003G394000--Sobic002G027901 Sobic003G394000--Sobic004G348000 Sobic003G254200 Sobic003G254200 Sobic003G394000--Sobic003G254200 Sobic009G170900--Sobic005G160801 Sobic009G170900--Sobic007G136000 Sobic004G252850 Sobic004G252850 Sobic009G170900--Sobic004G252850 Sobic009G170900--Sobic004G200100 Sobic009G170900--Sobic001G251000 Sobic009G170900--Sobic003G406060 Sobic009G170900--Sobic010G082300 Sobic009G170900--Sobic005G200100 Sobic009G170900--Sobic002G381800 Sobic007G136000--Sobic009G170900 Sobic007G136000--Sobic005G160801 Sobic007G136000--Sobic004G200100 Sobic005G067200 Sobic005G067200 Sobic007G136000--Sobic005G067200 Sobic003G078000 Sobic003G078000 Sobic007G136000--Sobic003G078000 Sobic006G189600 Sobic006G189600 Sobic007G136000--Sobic006G189600 Sobic007G136000--Sobic003G406060 Sobic005G198600 Sobic005G198600 Sobic007G136000--Sobic005G198600 Sobic007G136000--Sobic003G394000 Sobic004G234000--Sobic004G200100 Sobic003G074300 Sobic003G074300 Sobic004G234000--Sobic003G074300 Sobic004G327900 Sobic004G327900 Sobic004G234000--Sobic004G327900 Sobic001G156200 Sobic001G156200 Sobic004G234000--Sobic001G156200 Sobic004G234000--Sobic002G381800 Sobic001G123400 Sobic001G123400 Sobic004G234000--Sobic001G123400 Sobic004G288000 Sobic004G288000 Sobic004G234000--Sobic004G288000 Sobic004G234000--Sobic003G394000 Sobic007G009900 Sobic007G009900 Sobic004G234000--Sobic007G009900 Sobic002G381800--Sobic010G082300 Sobic003G302600 Sobic003G302600 Sobic002G381800--Sobic003G302600 Sobic009G176200 Sobic009G176200 Sobic002G381800--Sobic009G176200 Sobic001G005400 Sobic001G005400 Sobic002G381800--Sobic001G005400 Sobic003G061600 Sobic003G061600 Sobic002G381800--Sobic003G061600 Sobic002G381800--Sobic004G252850 Sobic002G381800--Sobic004G348000 Sobic003G211000 Sobic003G211000 Sobic002G381800--Sobic003G211000 Sobic002G381800--Sobic009G170900 Sobic005G160801--Sobic009G170900 Sobic005G160801--Sobic007G136000 Sobic005G160801--Sobic004G200100 Sobic005G160801--Sobic002G381800 Sobic005G160801--Sobic004G252850 Sobic005G160801--Sobic010G082300 Sobic005G160801--Sobic001G005400 Sobic005G160801--Sobic005G067200 Sobic005G160801--Sobic003G394000 Sobic010G082300--Sobic002G381800 Sobic010G082300--Sobic004G348000 Sobic010G082300--Sobic004G252850 Sobic010G082300--Sobic009G176200 Sobic003G307500 Sobic003G307500 Sobic010G082300--Sobic003G307500 Sobic009G125100 Sobic009G125100 Sobic010G082300--Sobic009G125100 Sobic010G082300--Sobic001G251000 Sobic004G031900 Sobic004G031900 Sobic010G082300--Sobic004G031900 Sobic003G054800 Sobic003G054800 Sobic010G082300--Sobic003G054800 Sobic004G060400--Sobic004G348000 Sobic004G060400--Sobic010G074000 Sobic004G060400--Sobic004G031900 Sobic004G060400--Sobic009G176200 Sobic009G249400 Sobic009G249400 Sobic004G060400--Sobic009G249400 Sobic004G060400--Sobic003G254200 Sobic007G161100 Sobic007G161100 Sobic004G060400--Sobic007G161100 Sobic004G060400--Sobic004G288000 Sobic001G196400 Sobic001G196400 Sobic004G060400--Sobic001G196400 Sobic004G059200 Sobic004G059200 Sobic004G348000--Sobic004G059200 Sobic004G348000--Sobic001G251000 Sobic004G348000--Sobic009G125100 Sobic004G348000--Sobic004G060400 Sobic004G348000--Sobic007G161100 Sobic004G348000--Sobic009G176200 Sobic004G348000--Sobic005G200100 Sobic005G039000 Sobic005G039000 Sobic004G348000--Sobic005G039000 Sobic004G348000--Sobic001G196400
Octagon: transcription factors


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