Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G270900.2,Sobic.003G270900.1
Synonym Sb03g032320
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1W0VZ57 , C5XHL5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g05225.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G181701 - -
2 Sobic.005G200100 - -
3 Sobic.001G251000 - -
4 Sobic.009G176200 expressed protein -
5 Sobic.004G348000 white-brown complex homolog protein, putative, expressed -
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8 Sobic.010G217700 clathrin assembly protein, putative, expressed -
9 Sobic.003G302532 - -
10 Sobic.004G031900 phosphatidylinositol transfer, putative, expressed -
11 Sobic.001G252151 - -
12 Sobic.003G394000 - -
13 Sobic.005G199800 expressed protein K04730: interleukin-1 receptor-associated kinase 1
14 Sobic.004G059200 inactive receptor kinase At2g26730 precursor, putative, expressed -
15 Sobic.002G429000 pyruvate decarboxylase isozyme 2, putative, expressed K01568: PDC, pyruvate decarboxylase
16 Sobic.003G406060 - -
17 Sobic.009G249400 protein kinase family protein, putative, expressed -
18 Sobic.009G072600 expressed protein -
19 Sobic.003G066300 expressed protein -
20 Sobic.010G158050 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G270900 Sobic003G270900 Sobic010G181701 Sobic010G181701 Sobic003G270900--Sobic010G181701 Sobic005G200100 Sobic005G200100 Sobic003G270900--Sobic005G200100 Sobic001G251000 Sobic001G251000 Sobic003G270900--Sobic001G251000 Sobic009G176200 Sobic009G176200 Sobic003G270900--Sobic009G176200 Sobic004G348000 Sobic004G348000 Sobic003G270900--Sobic004G348000 Sobic004G048900 Sobic004G048900 Sobic003G270900--Sobic004G048900 Sobic010G082300 Sobic010G082300 Sobic003G270900--Sobic010G082300 Sobic010G217700 Sobic010G217700 Sobic003G270900--Sobic010G217700 Sobic003G302532 Sobic003G302532 Sobic003G270900--Sobic003G302532 Sobic010G181701--Sobic001G251000 Sobic010G181701--Sobic005G200100 Sobic010G181701--Sobic004G348000 Sobic010G181701--Sobic010G082300 Sobic009G125100 Sobic009G125100 Sobic010G181701--Sobic009G125100 Sobic010G181701--Sobic009G176200 Sobic004G059200 Sobic004G059200 Sobic010G181701--Sobic004G059200 Sobic010G181701--Sobic003G270900 Sobic010G026200 Sobic010G026200 Sobic010G181701--Sobic010G026200 Sobic005G200100--Sobic001G251000 Sobic003G406060 Sobic003G406060 Sobic005G200100--Sobic003G406060 Sobic005G200100--Sobic003G302532 Sobic005G200100--Sobic004G348000 Sobic001G252151 Sobic001G252151 Sobic005G200100--Sobic001G252151 Sobic010G014850 Sobic010G014850 Sobic005G200100--Sobic010G014850 Sobic005G191200 Sobic005G191200 Sobic005G200100--Sobic005G191200 Sobic010G158050 Sobic010G158050 Sobic005G200100--Sobic010G158050 Sobic005G200100--Sobic004G059200 Sobic001G251000--Sobic005G200100 Sobic001G251000--Sobic004G348000 Sobic001G251000--Sobic003G302532 Sobic001G251000--Sobic001G252151 Sobic001G251000--Sobic004G059200 Sobic001G251000--Sobic009G125100 Sobic004G252850 Sobic004G252850 Sobic001G251000--Sobic004G252850 Sobic001G251000--Sobic010G026200 Sobic001G251000--Sobic003G406060 Sobic003G211000 Sobic003G211000 Sobic009G176200--Sobic003G211000 Sobic010G187800 Sobic010G187800 Sobic009G176200--Sobic010G187800 Sobic004G031900 Sobic004G031900 Sobic009G176200--Sobic004G031900 Sobic001G380000 Sobic001G380000 Sobic009G176200--Sobic001G380000 Sobic009G249400 Sobic009G249400 Sobic009G176200--Sobic009G249400 Sobic003G061600 Sobic003G061600 Sobic009G176200--Sobic003G061600 Sobic003G233800 Sobic003G233800 Sobic009G176200--Sobic003G233800 Sobic005G039000 Sobic005G039000 Sobic009G176200--Sobic005G039000 Sobic004G185000 Sobic004G185000 Sobic009G176200--Sobic004G185000 Sobic004G348000--Sobic004G059200 Sobic004G348000--Sobic001G251000 Sobic004G348000--Sobic009G125100 Sobic004G060400 Sobic004G060400 Sobic004G348000--Sobic004G060400 Sobic007G161100 Sobic007G161100 Sobic004G348000--Sobic007G161100 Sobic004G348000--Sobic009G176200 Sobic004G348000--Sobic005G200100 Sobic004G348000--Sobic005G039000 Sobic001G196400 Sobic001G196400 Sobic004G348000--Sobic001G196400 Sobic004G048900--Sobic009G249400 Sobic003G254200 Sobic003G254200 Sobic004G048900--Sobic003G254200 Sobic010G074000 Sobic010G074000 Sobic004G048900--Sobic010G074000 Sobic004G048900--Sobic004G031900 Sobic004G048900--Sobic009G176200 Sobic009G072600 Sobic009G072600 Sobic004G048900--Sobic009G072600 Sobic003G208900 Sobic003G208900 Sobic004G048900--Sobic003G208900 Sobic010G157900 Sobic010G157900 Sobic004G048900--Sobic010G157900 Sobic005G192000 Sobic005G192000 Sobic004G048900--Sobic005G192000 Sobic002G381800 Sobic002G381800 Sobic010G082300--Sobic002G381800 Sobic010G082300--Sobic004G348000 Sobic010G082300--Sobic004G252850 Sobic010G082300--Sobic009G176200 Sobic003G307500 Sobic003G307500 Sobic010G082300--Sobic003G307500 Sobic010G082300--Sobic009G125100 Sobic010G082300--Sobic001G251000 Sobic010G082300--Sobic004G031900 Sobic003G054800 Sobic003G054800 Sobic010G082300--Sobic003G054800 Sobic010G217700--Sobic007G161100 Sobic010G217700--Sobic001G196400 Sobic010G217700--Sobic004G059200 Sobic010G217700--Sobic003G208900 Sobic004G327000 Sobic004G327000 Sobic010G217700--Sobic004G327000 Sobic010G217700--Sobic004G348000 Sobic006G232700 Sobic006G232700 Sobic010G217700--Sobic006G232700 Sobic003G317000 Sobic003G317000 Sobic010G217700--Sobic003G317000 Sobic010G217700--Sobic005G039000 Sobic003G302532--Sobic001G251000 Sobic003G302532--Sobic005G200100 Sobic003G302532--Sobic004G348000 Sobic003G302532--Sobic009G125100 Sobic003G302532--Sobic004G059200 Sobic003G302532--Sobic001G252151 Sobic003G302532--Sobic004G252850 Sobic003G302532--Sobic010G217700 Sobic001G272100 Sobic001G272100 Sobic003G302532--Sobic001G272100
Octagon: transcription factors


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