Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G199800.1
Synonym Sb05g025650
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PTN2
Pfam PF00069
Panther DB PTHR27001 PTHR27001:SF193
NCBI CDD KOG1187; Serine/threonine protein kinase
KEGG Orthology K04730; interleukin-1 receptor-associated kinase 1
Gene Ontology GO:0006468; protein phosphorylation GO:0005524ATP binding GO:0004672protein kinase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G35960 : Protein kinase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g42440.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a029227
Brachypodium -
Barley HORVU4Hr1G031590.1 , HORVU4Hr1G031590.2 , HORVU4Hr1G031590.3 , HORVU4Hr1G031590.4 , HORVU4Hr1G031590.5 , HORVU4Hr1G031590.6 , HORVU4Hr1G031590.7 , HORVU4Hr1G031590.8 , HORVU4Hr1G031590.9 , HORVU4Hr1G031590.10
Wheat TraesCS4D02G149200 , TraesCS7B02G262500 , TraesCS7D02G357700
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic005G199800 Sobic005G199800 Sobic004G057000 Sobic004G057000 Sobic005G199800--Sobic004G057000 Sobic010G158050 Sobic010G158050 Sobic005G199800--Sobic010G158050 Sobic009G072600 Sobic009G072600 Sobic005G199800--Sobic009G072600 Sobic010G157900 Sobic010G157900 Sobic005G199800--Sobic010G157900 Sobic002G061732 Sobic002G061732 Sobic005G199800--Sobic002G061732 Sobic002G323200 Sobic002G323200 Sobic005G199800--Sobic002G323200 Sobic005G192000 Sobic005G192000 Sobic005G199800--Sobic005G192000 Sobic010G014850 Sobic010G014850 Sobic005G199800--Sobic010G014850 Sobic002G210150 Sobic002G210150 Sobic005G199800--Sobic002G210150 Sobic004G057000--Sobic010G158050 Sobic004G057000--Sobic010G157900 Sobic004G057000--Sobic005G199800 Sobic004G057000--Sobic010G014850 Sobic004G075250 Sobic004G075250 Sobic004G057000--Sobic004G075250 Sobic004G057000--Sobic002G210150 Sobic002G223650 Sobic002G223650 Sobic004G057000--Sobic002G223650 Sobic004G057000--Sobic005G192000 Sobic001G467400 Sobic001G467400 Sobic004G057000--Sobic001G467400 Sobic010G158050--Sobic004G057000 Sobic010G158050--Sobic010G014850 Sobic010G158050--Sobic010G157900 Sobic010G158050--Sobic005G199800 Sobic010G158050--Sobic004G075250 Sobic010G158050--Sobic002G223650 Sobic010G158050--Sobic001G467400 Sobic003G075300 Sobic003G075300 Sobic010G158050--Sobic003G075300 SobicK028900 SobicK028900 Sobic010G158050--SobicK028900 Sobic009G072600--Sobic002G323200 Sobic009G072600--Sobic002G061732 Sobic009G072600--Sobic005G192000 Sobic003G434100 Sobic003G434100 Sobic009G072600--Sobic003G434100 Sobic002G029000 Sobic002G029000 Sobic009G072600--Sobic002G029000 Sobic009G072600--Sobic005G199800 Sobic007G166500 Sobic007G166500 Sobic009G072600--Sobic007G166500 Sobic009G072600--Sobic002G210150 Sobic005G209300 Sobic005G209300 Sobic009G072600--Sobic005G209300 Sobic010G157900--Sobic004G057000 Sobic010G157900--Sobic010G158050 Sobic004G168150 Sobic004G168150 Sobic010G157900--Sobic004G168150 Sobic010G157900--Sobic004G075250 Sobic010G157900--Sobic002G223650 Sobic010G157900--Sobic005G199800 Sobic010G157900--Sobic002G210150 Sobic010G157900--Sobic005G192000 Sobic003G274100 Sobic003G274100 Sobic010G157900--Sobic003G274100 Sobic002G061732--Sobic009G072600 Sobic002G061732--Sobic002G323200 Sobic002G061732--Sobic005G192000 Sobic002G061732--Sobic003G434100 Sobic002G061732--Sobic002G210150 Sobic002G061732--Sobic005G199800 Sobic002G061732--Sobic002G029000 Sobic005G181500 Sobic005G181500 Sobic002G061732--Sobic005G181500 Sobic002G061732--Sobic005G209300 Sobic002G323200--Sobic009G072600 Sobic002G323200--Sobic005G192000 Sobic002G323200--Sobic002G029000 Sobic002G323200--Sobic005G209300 Sobic002G323200--Sobic003G434100 Sobic002G323200--Sobic002G210150 Sobic002G323200--Sobic002G061732 Sobic002G323200--Sobic007G166500 Sobic002G323200--Sobic005G181500 Sobic005G192000--Sobic002G210150 Sobic005G192000--Sobic002G323200 Sobic010G034200 Sobic010G034200 Sobic005G192000--Sobic010G034200 Sobic002G429000 Sobic002G429000 Sobic005G192000--Sobic002G429000 Sobic009G166000 Sobic009G166000 Sobic005G192000--Sobic009G166000 Sobic009G227500 Sobic009G227500 Sobic005G192000--Sobic009G227500 Sobic004G331500 Sobic004G331500 Sobic005G192000--Sobic004G331500 Sobic001G400400 Sobic001G400400 Sobic005G192000--Sobic001G400400 Sobic005G192000--Sobic005G209300 Sobic010G014850--Sobic010G158050 Sobic010G014850--Sobic004G057000 Sobic010G014850--SobicK028900 Sobic010G014850--Sobic010G157900 Sobic005G191200 Sobic005G191200 Sobic010G014850--Sobic005G191200 Sobic010G014850--Sobic005G199800 Sobic010G014850--Sobic004G075250 Sobic010G014850--Sobic003G075300 Sobic005G041450 Sobic005G041450 Sobic010G014850--Sobic005G041450 Sobic002G210150--Sobic005G192000 Sobic002G210150--Sobic010G034200 Sobic006G219700 Sobic006G219700 Sobic002G210150--Sobic006G219700 Sobic002G210150--Sobic001G400400 Sobic002G210150--Sobic009G227500 Sobic002G395100 Sobic002G395100 Sobic002G210150--Sobic002G395100 Sobic009G259600 Sobic009G259600 Sobic002G210150--Sobic009G259600 Sobic002G210150--Sobic002G429000 Sobic002G210150--Sobic009G166000
Octagon: transcription factors


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