Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G168150.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RMV5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G157900 - -
2 Sobic.003G208900 Sad1 / UNC-like C-terminal domain containing protein, putative, expressed -
3 Sobic.001G155100 cyclic nucleotide-gated ion channel, putative, expressed K05391: cyclic nucleotide gated channel, plant
4 Sobic.007G195000 cystathionin beta synthase protein, putative, expressed -
5 Sobic.003G343300 - -
6 Sobic.002G223650 - -
7 Sobic.003G274100 THION44 - Plant thionin family protein precursor, putative, expressed -
8 Sobic.005G039000 bifunctional monodehydroascorbate reductase and carbonic anhydrasenectarin-3 precursor, putative, expressed K01674: carbonic anhydrase
9 Sobic.003G305500 expressed protein -
10 Sobic.005G220680 - -
11 Sobic.004G042800 protein kinase domain containing protein, expressed -
12 Sobic.002G210150 - -
13 Sobic.006G062100 potassium transporter, putative, expressed K03549: KUP system potassium uptake protein
14 Sobic.004G075250 - -
15 Sobic.002G429000 pyruvate decarboxylase isozyme 2, putative, expressed K01568: PDC, pyruvate decarboxylase
16 Sobic.001G473700 OsSCP11 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed K16297: serine carboxypeptidase-like clade II
17 Sobic.001G467400 expressed protein -
18 Sobic.006G059100 POEI20 - Pollen Ole e I allergen and extensin family protein precursor, expressed -
19 Sobic.006G276801 - -
20 Sobic.006G071096 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G168150 Sobic004G168150 Sobic010G157900 Sobic010G157900 Sobic004G168150--Sobic010G157900 Sobic003G208900 Sobic003G208900 Sobic004G168150--Sobic003G208900 Sobic001G155100 Sobic001G155100 Sobic004G168150--Sobic001G155100 Sobic007G195000 Sobic007G195000 Sobic004G168150--Sobic007G195000 Sobic003G343300 Sobic003G343300 Sobic004G168150--Sobic003G343300 Sobic002G223650 Sobic002G223650 Sobic004G168150--Sobic002G223650 Sobic003G274100 Sobic003G274100 Sobic004G168150--Sobic003G274100 Sobic005G039000 Sobic005G039000 Sobic004G168150--Sobic005G039000 Sobic003G305500 Sobic003G305500 Sobic004G168150--Sobic003G305500 Sobic004G057000 Sobic004G057000 Sobic010G157900--Sobic004G057000 Sobic010G158050 Sobic010G158050 Sobic010G157900--Sobic010G158050 Sobic010G157900--Sobic004G168150 Sobic004G075250 Sobic004G075250 Sobic010G157900--Sobic004G075250 Sobic010G157900--Sobic002G223650 Sobic005G199800 Sobic005G199800 Sobic010G157900--Sobic005G199800 Sobic002G210150 Sobic002G210150 Sobic010G157900--Sobic002G210150 Sobic005G192000 Sobic005G192000 Sobic010G157900--Sobic005G192000 Sobic010G157900--Sobic003G274100 Sobic003G208900--Sobic003G305500 Sobic003G208900--Sobic005G039000 Sobic003G208900--Sobic003G343300 Sobic003G343000 Sobic003G343000 Sobic003G208900--Sobic003G343000 Sobic003G208900--Sobic007G195000 Sobic007G185801 Sobic007G185801 Sobic003G208900--Sobic007G185801 Sobic004G042800 Sobic004G042800 Sobic003G208900--Sobic004G042800 Sobic007G139300 Sobic007G139300 Sobic003G208900--Sobic007G139300 Sobic006G062100 Sobic006G062100 Sobic003G208900--Sobic006G062100 Sobic005G220680 Sobic005G220680 Sobic001G155100--Sobic005G220680 Sobic001G155100--Sobic007G195000 Sobic001G155100--Sobic003G343300 Sobic001G155100--Sobic004G168150 Sobic001G155100--Sobic006G062100 Sobic001G188100 Sobic001G188100 Sobic001G155100--Sobic001G188100 Sobic003G243300 Sobic003G243300 Sobic001G155100--Sobic003G243300 Sobic001G155100--Sobic003G208900 Sobic004G160000 Sobic004G160000 Sobic001G155100--Sobic004G160000 Sobic007G195000--Sobic003G343300 Sobic007G195000--Sobic006G062100 Sobic003G160600 Sobic003G160600 Sobic007G195000--Sobic003G160600 Sobic007G195000--Sobic005G039000 Sobic007G195000--Sobic003G343000 Sobic007G195000--Sobic003G305500 Sobic004G327000 Sobic004G327000 Sobic007G195000--Sobic004G327000 Sobic007G195000--Sobic007G139300 Sobic008G134600 Sobic008G134600 Sobic007G195000--Sobic008G134600 Sobic003G343300--Sobic007G195000 Sobic003G343300--Sobic006G062100 Sobic003G343300--Sobic003G343000 Sobic003G343300--Sobic008G134600 Sobic003G343300--Sobic007G139300 Sobic003G343300--Sobic003G305500 Sobic008G124301 Sobic008G124301 Sobic003G343300--Sobic008G124301 Sobic001G392650 Sobic001G392650 Sobic003G343300--Sobic001G392650 Sobic003G343300--Sobic003G160600 Sobic002G223650--Sobic003G274100 Sobic006G276801 Sobic006G276801 Sobic002G223650--Sobic006G276801 Sobic003G250160 Sobic003G250160 Sobic002G223650--Sobic003G250160 Sobic007G081701 Sobic007G081701 Sobic002G223650--Sobic007G081701 Sobic001G467400 Sobic001G467400 Sobic002G223650--Sobic001G467400 Sobic009G177750 Sobic009G177750 Sobic002G223650--Sobic009G177750 Sobic004G258000 Sobic004G258000 Sobic002G223650--Sobic004G258000 Sobic007G042800 Sobic007G042800 Sobic002G223650--Sobic007G042800 Sobic002G223650--Sobic004G075250 Sobic003G274100--Sobic002G223650 Sobic001G473700 Sobic001G473700 Sobic003G274100--Sobic001G473700 Sobic002G066100 Sobic002G066100 Sobic003G274100--Sobic002G066100 Sobic010G187700 Sobic010G187700 Sobic003G274100--Sobic010G187700 Sobic003G274100--Sobic008G124301 Sobic006G071096 Sobic006G071096 Sobic003G274100--Sobic006G071096 Sobic009G177300 Sobic009G177300 Sobic003G274100--Sobic009G177300 Sobic004G294200 Sobic004G294200 Sobic003G274100--Sobic004G294200 Sobic003G274100--Sobic008G134600 Sobic005G039000--Sobic003G343300 Sobic005G039000--Sobic003G208900 Sobic005G039000--Sobic007G195000 Sobic005G039000--Sobic003G343000 Sobic005G039000--Sobic007G139300 Sobic005G039000--Sobic007G185801 Sobic005G039000--Sobic006G062100 Sobic006G018701 Sobic006G018701 Sobic005G039000--Sobic006G018701 Sobic005G039000--Sobic004G327000 Sobic003G305500--Sobic003G343000 Sobic003G305500--Sobic003G208900 Sobic003G305500--Sobic003G343300 Sobic006G059100 Sobic006G059100 Sobic003G305500--Sobic006G059100 Sobic003G305500--Sobic008G134600 Sobic009G062600 Sobic009G062600 Sobic003G305500--Sobic009G062600 Sobic003G305500--Sobic008G124301 Sobic003G445600 Sobic003G445600 Sobic003G305500--Sobic003G445600 Sobic003G305500--Sobic006G062100
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.