Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G276801.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt C5YAG1
Pfam -
Panther DB PTHR32133 PTHR32133:SF134
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g20492.1 : OsFBX285 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a044900
Brachypodium PNT60756 , KQJ83581 , PNT65676 , PNT60755
Barley HORVU6Hr1G014370.8 , HORVU6Hr1G014370.7 , HORVU6Hr1G014370.6 , HORVU6Hr1G014370.5 , HORVU6Hr1G014370.4 , HORVU6Hr1G014370.3 , HORVU6Hr1G014370.2 , HORVU6Hr1G014370.1
Wheat TraesCS4D02G097000 , TraesCS4D02G097000 , TraesCS2D02G486000 , TraesCS5D02G363300 , TraesCS6D02G077200 , TraesCS6B02G128400 , TraesCS6B02G128400 , TraesCS6B02G128400 , TraesCS6D02G061200 , TraesCS6A02G083500 , TraesCS2B02G512800
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G258000 expressed protein -
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3 Sobic.003G250160 - -
4 Sobic.009G110333 - -
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12 Sobic.001G197050 - -
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14 Sobic.003G320000 expressed protein -
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19 Sobic.001G325850 - -
20 Sobic.008G169101 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G276801 Sobic006G276801 Sobic004G258000 Sobic004G258000 Sobic006G276801--Sobic004G258000 Sobic007G081701 Sobic007G081701 Sobic006G276801--Sobic007G081701 Sobic003G250160 Sobic003G250160 Sobic006G276801--Sobic003G250160 Sobic009G110333 Sobic009G110333 Sobic006G276801--Sobic009G110333 Sobic005G112500 Sobic005G112500 Sobic006G276801--Sobic005G112500 Sobic002G011300 Sobic002G011300 Sobic006G276801--Sobic002G011300 Sobic009G177750 Sobic009G177750 Sobic006G276801--Sobic009G177750 Sobic001G467400 Sobic001G467400 Sobic006G276801--Sobic001G467400 Sobic002G223650 Sobic002G223650 Sobic006G276801--Sobic002G223650 Sobic004G258000--Sobic006G276801 Sobic004G258000--Sobic009G110333 Sobic004G258000--Sobic005G112500 Sobic004G258000--Sobic007G081701 Sobic004G258000--Sobic002G011300 Sobic004G258000--Sobic003G250160 Sobic002G266500 Sobic002G266500 Sobic004G258000--Sobic002G266500 Sobic004G258000--Sobic002G223650 Sobic004G258000--Sobic009G177750 Sobic007G081701--Sobic003G250160 Sobic007G081701--Sobic009G177750 Sobic007G081701--Sobic006G276801 Sobic001G197050 Sobic001G197050 Sobic007G081701--Sobic001G197050 Sobic007G081701--Sobic005G112500 Sobic007G081701--Sobic001G467400 Sobic007G081701--Sobic004G258000 Sobic004G255900 Sobic004G255900 Sobic007G081701--Sobic004G255900 Sobic007G081701--Sobic002G011300 Sobic003G250160--Sobic007G081701 Sobic003G250160--Sobic009G177750 Sobic003G250160--Sobic001G197050 Sobic003G250160--Sobic006G276801 Sobic003G250160--Sobic001G467400 Sobic003G250160--Sobic004G255900 Sobic003G250160--Sobic005G112500 Sobic003G250160--Sobic002G223650 Sobic003G250160--Sobic004G258000 Sobic009G110333--Sobic005G112500 Sobic009G110333--Sobic004G258000 Sobic009G110333--Sobic002G266500 Sobic009G110333--Sobic006G276801 Sobic009G110333--Sobic002G011300 Sobic003G133201 Sobic003G133201 Sobic009G110333--Sobic003G133201 Sobic004G050900 Sobic004G050900 Sobic009G110333--Sobic004G050900 Sobic009G110700 Sobic009G110700 Sobic009G110333--Sobic009G110700 Sobic008G169101 Sobic008G169101 Sobic009G110333--Sobic008G169101 Sobic005G112500--Sobic009G110333 Sobic005G112500--Sobic009G110700 Sobic005G112500--Sobic006G276801 Sobic005G112500--Sobic004G258000 Sobic005G112500--Sobic002G266500 Sobic005G112500--Sobic007G081701 Sobic003G320000 Sobic003G320000 Sobic005G112500--Sobic003G320000 Sobic005G112500--Sobic002G011300 Sobic005G191300 Sobic005G191300 Sobic005G112500--Sobic005G191300 Sobic002G011300--Sobic002G266500 Sobic002G011300--Sobic006G276801 Sobic002G011300--Sobic005G112500 Sobic002G011300--Sobic004G258000 Sobic002G011300--Sobic009G110333 Sobic002G011300--Sobic007G081701 Sobic002G011300--Sobic003G250160 Sobic002G011300--Sobic001G197050 Sobic002G011300--Sobic009G177750 Sobic009G177750--Sobic003G250160 Sobic009G177750--Sobic007G081701 Sobic009G177750--Sobic001G197050 Sobic009G177750--Sobic006G276801 Sobic009G177750--Sobic001G467400 Sobic009G177750--Sobic004G255900 Sobic009G177750--Sobic005G112500 Sobic009G177750--Sobic003G320000 Sobic002G000200 Sobic002G000200 Sobic009G177750--Sobic002G000200 Sobic001G467400--Sobic003G250160 Sobic004G075250 Sobic004G075250 Sobic001G467400--Sobic004G075250 Sobic001G467400--Sobic007G081701 Sobic001G467400--Sobic006G276801 Sobic001G467400--Sobic009G177750 Sobic001G467400--Sobic002G223650 Sobic001G467400--Sobic004G258000 Sobic003G274100 Sobic003G274100 Sobic001G467400--Sobic003G274100 Sobic001G467400--Sobic001G197050 Sobic002G223650--Sobic003G274100 Sobic002G223650--Sobic006G276801 Sobic002G223650--Sobic003G250160 Sobic002G223650--Sobic007G081701 Sobic002G223650--Sobic001G467400 Sobic002G223650--Sobic009G177750 Sobic002G223650--Sobic004G258000 Sobic007G042800 Sobic007G042800 Sobic002G223650--Sobic007G042800 Sobic002G223650--Sobic004G075250
Octagon: transcription factors


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