Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G266500.2
Synonym Sb02g030093
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W5Y1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g05860.1 : retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G110333 - -
2 Sobic.002G011300 - -
3 Sobic.005G112500 - -
4 Sobic.004G258000 expressed protein -
5 Sobic.006G276801 - -
6 Sobic.004G050900 OsFBX248 - F-box domain containing protein, expressed -
7 Sobic.003G133201 - -
8 Sobic.009G110700 OsFBL58 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
9 Sobic.008G169101 - -
10 Sobic.007G081701 - K10523: speckle-type POZ protein
11 Sobic.009G047100 GEX1, putative, expressed -
12 Sobic.008G024200 L11 domain containing ribosomal protein, putative, expressed K02867: RP-L11, MRPL11, large subunit ribosomal protein L11
13 Sobic.005G191300 MBTB64 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
14 Sobic.003G320000 expressed protein -
15 Sobic.003G245300 3-5 exonuclease domain-containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.005G077001 - -
17 Sobic.005G058600 csAtPR5, putative, expressed -
18 Sobic.001G192300 expressed protein -
19 Sobic.003G250160 - -
20 Sobic.007G122600 "domain confirmed by Pfam database, expression supported by NCBI EST database, expression induced by BR treatment"(PubMedID : 20499123)@DUF260 domain containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G266500 Sobic002G266500 Sobic009G110333 Sobic009G110333 Sobic002G266500--Sobic009G110333 Sobic002G011300 Sobic002G011300 Sobic002G266500--Sobic002G011300 Sobic005G112500 Sobic005G112500 Sobic002G266500--Sobic005G112500 Sobic004G258000 Sobic004G258000 Sobic002G266500--Sobic004G258000 Sobic006G276801 Sobic006G276801 Sobic002G266500--Sobic006G276801 Sobic004G050900 Sobic004G050900 Sobic002G266500--Sobic004G050900 Sobic003G133201 Sobic003G133201 Sobic002G266500--Sobic003G133201 Sobic009G110700 Sobic009G110700 Sobic002G266500--Sobic009G110700 Sobic008G169101 Sobic008G169101 Sobic002G266500--Sobic008G169101 Sobic009G110333--Sobic005G112500 Sobic009G110333--Sobic004G258000 Sobic009G110333--Sobic002G266500 Sobic009G110333--Sobic006G276801 Sobic009G110333--Sobic002G011300 Sobic009G110333--Sobic003G133201 Sobic009G110333--Sobic004G050900 Sobic009G110333--Sobic009G110700 Sobic009G110333--Sobic008G169101 Sobic002G011300--Sobic002G266500 Sobic002G011300--Sobic006G276801 Sobic002G011300--Sobic005G112500 Sobic002G011300--Sobic004G258000 Sobic002G011300--Sobic009G110333 Sobic007G081701 Sobic007G081701 Sobic002G011300--Sobic007G081701 Sobic003G250160 Sobic003G250160 Sobic002G011300--Sobic003G250160 Sobic001G197050 Sobic001G197050 Sobic002G011300--Sobic001G197050 Sobic009G177750 Sobic009G177750 Sobic002G011300--Sobic009G177750 Sobic005G112500--Sobic009G110333 Sobic005G112500--Sobic009G110700 Sobic005G112500--Sobic006G276801 Sobic005G112500--Sobic004G258000 Sobic005G112500--Sobic002G266500 Sobic005G112500--Sobic007G081701 Sobic003G320000 Sobic003G320000 Sobic005G112500--Sobic003G320000 Sobic005G112500--Sobic002G011300 Sobic005G191300 Sobic005G191300 Sobic005G112500--Sobic005G191300 Sobic004G258000--Sobic006G276801 Sobic004G258000--Sobic009G110333 Sobic004G258000--Sobic005G112500 Sobic004G258000--Sobic007G081701 Sobic004G258000--Sobic002G011300 Sobic004G258000--Sobic003G250160 Sobic004G258000--Sobic002G266500 Sobic002G223650 Sobic002G223650 Sobic004G258000--Sobic002G223650 Sobic004G258000--Sobic009G177750 Sobic006G276801--Sobic004G258000 Sobic006G276801--Sobic007G081701 Sobic006G276801--Sobic003G250160 Sobic006G276801--Sobic009G110333 Sobic006G276801--Sobic005G112500 Sobic006G276801--Sobic002G011300 Sobic006G276801--Sobic009G177750 Sobic001G467400 Sobic001G467400 Sobic006G276801--Sobic001G467400 Sobic006G276801--Sobic002G223650 Sobic005G000900 Sobic005G000900 Sobic004G050900--Sobic005G000900 Sobic009G047100 Sobic009G047100 Sobic004G050900--Sobic009G047100 Sobic005G140900 Sobic005G140900 Sobic004G050900--Sobic005G140900 Sobic002G156400 Sobic002G156400 Sobic004G050900--Sobic002G156400 Sobic009G182100 Sobic009G182100 Sobic004G050900--Sobic009G182100 Sobic006G017700 Sobic006G017700 Sobic004G050900--Sobic006G017700 Sobic008G138400 Sobic008G138400 Sobic004G050900--Sobic008G138400 Sobic002G097300 Sobic002G097300 Sobic004G050900--Sobic002G097300 Sobic008G024200 Sobic008G024200 Sobic004G050900--Sobic008G024200 Sobic003G133201--Sobic004G050900 Sobic005G058600 Sobic005G058600 Sobic003G133201--Sobic005G058600 Sobic003G133201--Sobic009G110333 Sobic003G133201--Sobic009G182100 Sobic003G133201--Sobic005G000900 Sobic003G133201--Sobic002G266500 Sobic003G133201--Sobic009G047100 Sobic007G031200 Sobic007G031200 Sobic003G133201--Sobic007G031200 Sobic003G133201--Sobic006G017700 Sobic003G245300 Sobic003G245300 Sobic009G110700--Sobic003G245300 Sobic007G122600 Sobic007G122600 Sobic009G110700--Sobic007G122600 Sobic009G110700--Sobic008G024200 Sobic009G110700--Sobic009G047100 Sobic005G006100 Sobic005G006100 Sobic009G110700--Sobic005G006100 Sobic001G167300 Sobic001G167300 Sobic009G110700--Sobic001G167300 Sobic010G216100 Sobic010G216100 Sobic009G110700--Sobic010G216100 Sobic010G207800 Sobic010G207800 Sobic009G110700--Sobic010G207800 Sobic001G192300 Sobic001G192300 Sobic009G110700--Sobic001G192300 Sobic008G169101--Sobic005G191300 Sobic002G402900 Sobic002G402900 Sobic008G169101--Sobic002G402900 Sobic007G042800 Sobic007G042800 Sobic008G169101--Sobic007G042800 Sobic001G525600 Sobic001G525600 Sobic008G169101--Sobic001G525600 Sobic007G197000 Sobic007G197000 Sobic008G169101--Sobic007G197000 Sobic001G092500 Sobic001G092500 Sobic008G169101--Sobic001G092500 Sobic008G169101--Sobic009G110700 Sobic003G420500 Sobic003G420500 Sobic008G169101--Sobic003G420500 Sobic005G037700 Sobic005G037700 Sobic008G169101--Sobic005G037700
Octagon: transcription factors


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