Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G077001.2,Sobic.005G077001.1,Sobic.005G077001.3
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RHK8 , A0A1Z5RH59 , A0A1Z5RHT3
Pfam PF00076 PF03478 PF03478 PF00076
Panther DB PTHR24012 PTHR24012:SF381 PTHR24012
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0003676; nucleic acid binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G24770 : 31-kDa RNA binding protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g39190.1,LOC_Os09g39190.2 : OsFBO22 - F-box and other domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G110333 - -
2 Sobic.005G201501 - -
3 Sobic.005G058600 csAtPR5, putative, expressed -
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11 Sobic.002G011300 - -
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14 Sobic.001G435300 C2 domain containing protein, expressed -
15 Sobic.003G191300 - -
16 Sobic.010G129450 - -
17 Sobic.003G075300 OsFBX64 - F-box domain containing protein, expressed -
18 Sobic.009G110700 OsFBL58 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
19 Sobic.005G000900 OsFBX103 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.007G031200 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G077001 Sobic005G077001 Sobic009G110333 Sobic009G110333 Sobic005G077001--Sobic009G110333 Sobic005G201501 Sobic005G201501 Sobic005G077001--Sobic005G201501 Sobic005G058600 Sobic005G058600 Sobic005G077001--Sobic005G058600 Sobic004G258000 Sobic004G258000 Sobic005G077001--Sobic004G258000 Sobic003G133201 Sobic003G133201 Sobic005G077001--Sobic003G133201 Sobic002G266500 Sobic002G266500 Sobic005G077001--Sobic002G266500 Sobic006G276801 Sobic006G276801 Sobic005G077001--Sobic006G276801 Sobic001G325850 Sobic001G325850 Sobic005G077001--Sobic001G325850 Sobic005G112500 Sobic005G112500 Sobic005G077001--Sobic005G112500 Sobic009G110333--Sobic005G112500 Sobic009G110333--Sobic004G258000 Sobic009G110333--Sobic002G266500 Sobic009G110333--Sobic006G276801 Sobic002G011300 Sobic002G011300 Sobic009G110333--Sobic002G011300 Sobic009G110333--Sobic003G133201 Sobic004G050900 Sobic004G050900 Sobic009G110333--Sobic004G050900 Sobic009G110700 Sobic009G110700 Sobic009G110333--Sobic009G110700 Sobic008G169101 Sobic008G169101 Sobic009G110333--Sobic008G169101 Sobic005G201501--Sobic005G077001 Sobic003G075300 Sobic003G075300 Sobic005G201501--Sobic003G075300 Sobic003G191300 Sobic003G191300 Sobic005G201501--Sobic003G191300 Sobic005G201501--Sobic005G058600 Sobic010G012700 Sobic010G012700 Sobic005G201501--Sobic010G012700 Sobic005G201501--Sobic004G258000 Sobic005G201501--Sobic009G110333 Sobic002G014300 Sobic002G014300 Sobic005G201501--Sobic002G014300 Sobic005G201501--Sobic003G133201 Sobic005G058600--Sobic003G133201 Sobic007G031200 Sobic007G031200 Sobic005G058600--Sobic007G031200 Sobic005G058600--Sobic004G050900 Sobic005G058600--Sobic008G169101 Sobic003G191200 Sobic003G191200 Sobic005G058600--Sobic003G191200 Sobic005G058600--Sobic009G110333 Sobic002G402900 Sobic002G402900 Sobic005G058600--Sobic002G402900 Sobic005G058600--Sobic005G077001 Sobic005G000900 Sobic005G000900 Sobic005G058600--Sobic005G000900 Sobic004G258000--Sobic006G276801 Sobic004G258000--Sobic009G110333 Sobic004G258000--Sobic005G112500 Sobic007G081701 Sobic007G081701 Sobic004G258000--Sobic007G081701 Sobic004G258000--Sobic002G011300 Sobic003G250160 Sobic003G250160 Sobic004G258000--Sobic003G250160 Sobic004G258000--Sobic002G266500 Sobic002G223650 Sobic002G223650 Sobic004G258000--Sobic002G223650 Sobic009G177750 Sobic009G177750 Sobic004G258000--Sobic009G177750 Sobic003G133201--Sobic004G050900 Sobic003G133201--Sobic005G058600 Sobic003G133201--Sobic009G110333 Sobic009G182100 Sobic009G182100 Sobic003G133201--Sobic009G182100 Sobic003G133201--Sobic005G000900 Sobic003G133201--Sobic002G266500 Sobic009G047100 Sobic009G047100 Sobic003G133201--Sobic009G047100 Sobic003G133201--Sobic007G031200 Sobic006G017700 Sobic006G017700 Sobic003G133201--Sobic006G017700 Sobic002G266500--Sobic009G110333 Sobic002G266500--Sobic002G011300 Sobic002G266500--Sobic005G112500 Sobic002G266500--Sobic004G258000 Sobic002G266500--Sobic006G276801 Sobic002G266500--Sobic004G050900 Sobic002G266500--Sobic003G133201 Sobic002G266500--Sobic009G110700 Sobic002G266500--Sobic008G169101 Sobic006G276801--Sobic004G258000 Sobic006G276801--Sobic007G081701 Sobic006G276801--Sobic003G250160 Sobic006G276801--Sobic009G110333 Sobic006G276801--Sobic005G112500 Sobic006G276801--Sobic002G011300 Sobic006G276801--Sobic009G177750 Sobic001G467400 Sobic001G467400 Sobic006G276801--Sobic001G467400 Sobic006G276801--Sobic002G223650 Sobic001G325850--Sobic004G258000 Sobic001G325850--Sobic009G110333 Sobic001G325850--Sobic006G276801 Sobic001G325850--Sobic005G112500 Sobic001G325850--Sobic005G077001 Sobic001G325850--Sobic002G266500 Sobic001G325850--Sobic002G011300 Sobic001G325850--Sobic007G081701 Sobic001G325850--Sobic003G133201 Sobic005G112500--Sobic009G110333 Sobic005G112500--Sobic009G110700 Sobic005G112500--Sobic006G276801 Sobic005G112500--Sobic004G258000 Sobic005G112500--Sobic002G266500 Sobic005G112500--Sobic007G081701 Sobic003G320000 Sobic003G320000 Sobic005G112500--Sobic003G320000 Sobic005G112500--Sobic002G011300 Sobic005G191300 Sobic005G191300 Sobic005G112500--Sobic005G191300
Octagon: transcription factors


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