Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G201501.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RKE3
Pfam -
Panther DB PTHR32133 PTHR32133:SF146
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g09710.1 : OsFBX220 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G077001 - -
2 Sobic.003G075300 OsFBX64 - F-box domain containing protein, expressed -
3 Sobic.003G191300 - -
4 Sobic.005G058600 csAtPR5, putative, expressed -
5 Sobic.010G012700 katanin p60 ATPase-containing subunit, putative, expressed -
6 Sobic.004G258000 expressed protein -
7 Sobic.009G110333 - -
8 Sobic.002G014300 OsFBX213 - F-box domain containing protein, expressed -
9 Sobic.003G133201 - -
10 Sobic.001G325850 - -
11 Sobic.002G266500 - -
12 Sobic.006G276801 - -
13 Sobic.010G129450 - -
14 Sobic.002G402900 expressed protein -
15 Sobic.005G112500 - -
16 Sobic.002G011300 - -
17 Sobic.004G050900 OsFBX248 - F-box domain containing protein, expressed -
18 Sobic.001G435300 C2 domain containing protein, expressed -
19 Sobic.005G041450 - -
20 Sobic.008G169101 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G201501 Sobic005G201501 Sobic005G077001 Sobic005G077001 Sobic005G201501--Sobic005G077001 Sobic003G075300 Sobic003G075300 Sobic005G201501--Sobic003G075300 Sobic003G191300 Sobic003G191300 Sobic005G201501--Sobic003G191300 Sobic005G058600 Sobic005G058600 Sobic005G201501--Sobic005G058600 Sobic010G012700 Sobic010G012700 Sobic005G201501--Sobic010G012700 Sobic004G258000 Sobic004G258000 Sobic005G201501--Sobic004G258000 Sobic009G110333 Sobic009G110333 Sobic005G201501--Sobic009G110333 Sobic002G014300 Sobic002G014300 Sobic005G201501--Sobic002G014300 Sobic003G133201 Sobic003G133201 Sobic005G201501--Sobic003G133201 Sobic005G077001--Sobic009G110333 Sobic005G077001--Sobic005G201501 Sobic005G077001--Sobic005G058600 Sobic005G077001--Sobic004G258000 Sobic005G077001--Sobic003G133201 Sobic002G266500 Sobic002G266500 Sobic005G077001--Sobic002G266500 Sobic006G276801 Sobic006G276801 Sobic005G077001--Sobic006G276801 Sobic001G325850 Sobic001G325850 Sobic005G077001--Sobic001G325850 Sobic005G112500 Sobic005G112500 Sobic005G077001--Sobic005G112500 Sobic003G075300--Sobic005G201501 Sobic003G075300--Sobic010G012700 Sobic003G075300--Sobic005G077001 Sobic003G075300--Sobic003G191300 Sobic003G075300--Sobic002G014300 Sobic005G191200 Sobic005G191200 Sobic003G075300--Sobic005G191200 Sobic010G014850 Sobic010G014850 Sobic003G075300--Sobic010G014850 Sobic010G158050 Sobic010G158050 Sobic003G075300--Sobic010G158050 Sobic003G075300--Sobic004G258000 Sobic003G191300--Sobic005G201501 Sobic002G402900 Sobic002G402900 Sobic003G191300--Sobic002G402900 Sobic003G191300--Sobic005G077001 Sobic003G191300--Sobic005G058600 Sobic003G191300--Sobic003G075300 Sobic008G121600 Sobic008G121600 Sobic003G191300--Sobic008G121600 Sobic001G435300 Sobic001G435300 Sobic003G191300--Sobic001G435300 Sobic008G169101 Sobic008G169101 Sobic003G191300--Sobic008G169101 Sobic003G191300--Sobic004G258000 Sobic005G058600--Sobic003G133201 Sobic007G031200 Sobic007G031200 Sobic005G058600--Sobic007G031200 Sobic004G050900 Sobic004G050900 Sobic005G058600--Sobic004G050900 Sobic005G058600--Sobic008G169101 Sobic003G191200 Sobic003G191200 Sobic005G058600--Sobic003G191200 Sobic005G058600--Sobic009G110333 Sobic005G058600--Sobic002G402900 Sobic005G058600--Sobic005G077001 Sobic005G000900 Sobic005G000900 Sobic005G058600--Sobic005G000900 Sobic010G012700--Sobic002G014300 Sobic010G012700--Sobic003G075300 Sobic010G012700--Sobic005G201501 Sobic001G332100 Sobic001G332100 Sobic010G012700--Sobic001G332100 Sobic002G000800 Sobic002G000800 Sobic010G012700--Sobic002G000800 Sobic010G012700--Sobic003G191300 Sobic010G012700--Sobic005G077001 Sobic003G428500 Sobic003G428500 Sobic010G012700--Sobic003G428500 Sobic010G129450 Sobic010G129450 Sobic010G012700--Sobic010G129450 Sobic004G258000--Sobic006G276801 Sobic004G258000--Sobic009G110333 Sobic004G258000--Sobic005G112500 Sobic007G081701 Sobic007G081701 Sobic004G258000--Sobic007G081701 Sobic002G011300 Sobic002G011300 Sobic004G258000--Sobic002G011300 Sobic003G250160 Sobic003G250160 Sobic004G258000--Sobic003G250160 Sobic004G258000--Sobic002G266500 Sobic002G223650 Sobic002G223650 Sobic004G258000--Sobic002G223650 Sobic009G177750 Sobic009G177750 Sobic004G258000--Sobic009G177750 Sobic009G110333--Sobic005G112500 Sobic009G110333--Sobic004G258000 Sobic009G110333--Sobic002G266500 Sobic009G110333--Sobic006G276801 Sobic009G110333--Sobic002G011300 Sobic009G110333--Sobic003G133201 Sobic009G110333--Sobic004G050900 Sobic009G110700 Sobic009G110700 Sobic009G110333--Sobic009G110700 Sobic009G110333--Sobic008G169101 Sobic002G014300--Sobic010G012700 Sobic002G014300--Sobic005G201501 Sobic002G014300--Sobic003G428500 Sobic002G014300--Sobic003G075300 Sobic002G014300--Sobic001G332100 Sobic002G014300--Sobic002G000800 Sobic002G014300--Sobic005G077001 Sobic001G021200 Sobic001G021200 Sobic002G014300--Sobic001G021200 Sobic002G014300--Sobic010G129450 Sobic003G133201--Sobic004G050900 Sobic003G133201--Sobic005G058600 Sobic003G133201--Sobic009G110333 Sobic009G182100 Sobic009G182100 Sobic003G133201--Sobic009G182100 Sobic003G133201--Sobic005G000900 Sobic003G133201--Sobic002G266500 Sobic009G047100 Sobic009G047100 Sobic003G133201--Sobic009G047100 Sobic003G133201--Sobic007G031200 Sobic006G017700 Sobic006G017700 Sobic003G133201--Sobic006G017700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.