Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G435300.1
Synonym NTMC2T4, Sb01g040960, NTMC2TYPE4
Functional annotation C2 domain containing protein, expressed
UniProt C5WQW8
Pfam PF17047 PF00168
Panther DB PTHR10774 PTHR10774:SF83
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G61050 : Calcium-dependent lipid-binding (CaLB domain) family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g14700.1 : C2 domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a001604
Brachypodium -
Barley HORVU4Hr1G062820.4 , HORVU4Hr1G062820.5 , HORVU4Hr1G062820.6 , HORVU4Hr1G062820.7 , HORVU4Hr1G062820.1 , HORVU4Hr1G062820.2 , HORVU4Hr1G062820.3 , HORVU4Hr1G062820.8 , HORVU4Hr1G062820.9 , HORVU4Hr1G062820.14 , HORVU4Hr1G062820.15 , HORVU4Hr1G062820.12 , HORVU4Hr1G062820.13 , HORVU4Hr1G062820.10 , HORVU4Hr1G062820.11
Wheat TraesCS4D02G223100 , TraesCS4D02G223100 , TraesCS4A02G081200 , TraesCS4B02G222600
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G169101 - -
2 Sobic.002G402900 expressed protein -
3 Sobic.005G058600 csAtPR5, putative, expressed -
4 Sobic.004G042800 protein kinase domain containing protein, expressed -
5 Sobic.001G392650 - -
6 Sobic.009G110700 OsFBL58 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
7 Sobic.002G049700 potassium channel AKT1, putative, expressed -
8 Sobic.001G366700 villin protein, putative, expressed -
9 Sobic.005G191300 MBTB64 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
10 Sobic.009G110333 - -
11 Sobic.002G330200 mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17, putative, expressed K17795: mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM17
12 Sobic.007G042800 expressed protein -
13 Sobic.001G525600 fringe-related protein, putative, expressed -
14 Sobic.001G529800 phospholipase D, putative, expressed K01115: phospholipase D1/2
15 Sobic.003G208900 Sad1 / UNC-like C-terminal domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.001G092500 protein kinase domain containing protein, expressed -
17 Sobic.007G197000 "Candidate orthologue to the wheat Pm40 gene, probable glucan endo-1,3-betaglucosidase A6"(PubMedID : 27755575)@glucan endo-1,3-beta-glucosidase precursor, putative, expressed -
18 Sobic.005G112500 - -
19 Sobic.007G139300 exostosin family domain containing protein, expressed -
20 Sobic.002G021500 OsFBX209 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G435300 Sobic001G435300 Sobic008G169101 Sobic008G169101 Sobic001G435300--Sobic008G169101 Sobic002G402900 Sobic002G402900 Sobic001G435300--Sobic002G402900 Sobic005G058600 Sobic005G058600 Sobic001G435300--Sobic005G058600 Sobic004G042800 Sobic004G042800 Sobic001G435300--Sobic004G042800 Sobic001G392650 Sobic001G392650 Sobic001G435300--Sobic001G392650 Sobic009G110700 Sobic009G110700 Sobic001G435300--Sobic009G110700 Sobic002G049700 Sobic002G049700 Sobic001G435300--Sobic002G049700 Sobic001G366700 Sobic001G366700 Sobic001G435300--Sobic001G366700 Sobic005G191300 Sobic005G191300 Sobic001G435300--Sobic005G191300 Sobic008G169101--Sobic005G191300 Sobic008G169101--Sobic002G402900 Sobic007G042800 Sobic007G042800 Sobic008G169101--Sobic007G042800 Sobic001G525600 Sobic001G525600 Sobic008G169101--Sobic001G525600 Sobic007G197000 Sobic007G197000 Sobic008G169101--Sobic007G197000 Sobic001G092500 Sobic001G092500 Sobic008G169101--Sobic001G092500 Sobic008G169101--Sobic009G110700 Sobic003G420500 Sobic003G420500 Sobic008G169101--Sobic003G420500 Sobic005G037700 Sobic005G037700 Sobic008G169101--Sobic005G037700 Sobic002G402900--Sobic008G169101 Sobic001G529800 Sobic001G529800 Sobic002G402900--Sobic001G529800 Sobic002G402900--Sobic001G435300 Sobic002G402900--Sobic005G191300 Sobic002G402900--Sobic007G042800 Sobic002G402900--Sobic001G525600 Sobic002G402900--Sobic005G058600 Sobic002G223650 Sobic002G223650 Sobic002G402900--Sobic002G223650 Sobic002G402900--Sobic007G197000 Sobic003G133201 Sobic003G133201 Sobic005G058600--Sobic003G133201 Sobic007G031200 Sobic007G031200 Sobic005G058600--Sobic007G031200 Sobic004G050900 Sobic004G050900 Sobic005G058600--Sobic004G050900 Sobic005G058600--Sobic008G169101 Sobic003G191200 Sobic003G191200 Sobic005G058600--Sobic003G191200 Sobic009G110333 Sobic009G110333 Sobic005G058600--Sobic009G110333 Sobic005G058600--Sobic002G402900 Sobic005G077001 Sobic005G077001 Sobic005G058600--Sobic005G077001 Sobic005G000900 Sobic005G000900 Sobic005G058600--Sobic005G000900 Sobic003G208900 Sobic003G208900 Sobic004G042800--Sobic003G208900 Sobic003G305500 Sobic003G305500 Sobic004G042800--Sobic003G305500 Sobic004G042800--Sobic001G435300 Sobic001G188100 Sobic001G188100 Sobic004G042800--Sobic001G188100 Sobic004G042800--Sobic002G049700 Sobic003G343000 Sobic003G343000 Sobic004G042800--Sobic003G343000 Sobic004G160000 Sobic004G160000 Sobic004G042800--Sobic004G160000 Sobic004G042800--Sobic001G392650 Sobic007G139300 Sobic007G139300 Sobic004G042800--Sobic007G139300 Sobic001G392650--Sobic002G049700 Sobic008G134600 Sobic008G134600 Sobic001G392650--Sobic008G134600 Sobic002G330200 Sobic002G330200 Sobic001G392650--Sobic002G330200 Sobic009G158300 Sobic009G158300 Sobic001G392650--Sobic009G158300 Sobic001G392650--Sobic003G343000 Sobic008G124301 Sobic008G124301 Sobic001G392650--Sobic008G124301 Sobic001G109900 Sobic001G109900 Sobic001G392650--Sobic001G109900 Sobic009G060000 Sobic009G060000 Sobic001G392650--Sobic009G060000 Sobic001G392650--Sobic007G139300 Sobic003G245300 Sobic003G245300 Sobic009G110700--Sobic003G245300 Sobic007G122600 Sobic007G122600 Sobic009G110700--Sobic007G122600 Sobic008G024200 Sobic008G024200 Sobic009G110700--Sobic008G024200 Sobic009G047100 Sobic009G047100 Sobic009G110700--Sobic009G047100 Sobic005G006100 Sobic005G006100 Sobic009G110700--Sobic005G006100 Sobic001G167300 Sobic001G167300 Sobic009G110700--Sobic001G167300 Sobic010G216100 Sobic010G216100 Sobic009G110700--Sobic010G216100 Sobic010G207800 Sobic010G207800 Sobic009G110700--Sobic010G207800 Sobic001G192300 Sobic001G192300 Sobic009G110700--Sobic001G192300 Sobic002G049700--Sobic001G392650 Sobic002G049700--Sobic008G134600 Sobic002G049700--Sobic009G060000 Sobic002G049700--Sobic009G158300 Sobic002G049700--Sobic001G092500 Sobic002G049700--Sobic001G188100 Sobic004G134000 Sobic004G134000 Sobic002G049700--Sobic004G134000 Sobic008G043300 Sobic008G043300 Sobic002G049700--Sobic008G043300 Sobic010G276100 Sobic010G276100 Sobic002G049700--Sobic010G276100 Sobic001G366700--Sobic007G139300 Sobic003G243300 Sobic003G243300 Sobic001G366700--Sobic003G243300 Sobic002G279900 Sobic002G279900 Sobic001G366700--Sobic002G279900 Sobic003G313200 Sobic003G313200 Sobic001G366700--Sobic003G313200 Sobic004G099200 Sobic004G099200 Sobic001G366700--Sobic004G099200 Sobic001G366700--Sobic001G529800 Sobic009G158400 Sobic009G158400 Sobic001G366700--Sobic009G158400 Sobic001G037066 Sobic001G037066 Sobic001G366700--Sobic001G037066 Sobic006G062100 Sobic006G062100 Sobic001G366700--Sobic006G062100 Sobic005G191300--Sobic001G092500 Sobic005G191300--Sobic007G042800 Sobic005G191300--Sobic008G043300 Sobic005G204600 Sobic005G204600 Sobic005G191300--Sobic005G204600 Sobic010G040400 Sobic010G040400 Sobic005G191300--Sobic010G040400 Sobic010G016200 Sobic010G016200 Sobic005G191300--Sobic010G016200 Sobic005G191300--Sobic010G276100 Sobic005G191300--Sobic009G110700 Sobic008G043200 Sobic008G043200 Sobic005G191300--Sobic008G043200
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.