Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G058600.1
Synonym Sb05g004750
Functional annotation csAtPR5, putative, expressed
UniProt C5Y623
Pfam -
Panther DB PTHR33065 PTHR33065:SF22
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g66230.2 : csAtPR5, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a057464 , Zm00025a057439
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G133201 - -
2 Sobic.007G031200 - -
3 Sobic.004G050900 OsFBX248 - F-box domain containing protein, expressed -
4 Sobic.008G169101 - -
5 Sobic.003G191200 expressed protein -
6 Sobic.009G110333 - -
7 Sobic.002G402900 expressed protein -
8 Sobic.005G077001 - -
9 Sobic.005G000900 OsFBX103 - F-box domain containing protein, expressed -
10 Sobic.009G182100 cysteine proteinase inhibitor precursor protein, putative, expressed -
11 Sobic.004G100300 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.001G435300 C2 domain containing protein, expressed -
13 Sobic.009G047100 GEX1, putative, expressed -
14 Sobic.002G266500 - -
15 Sobic.002G182701 - -
16 Sobic.007G082100 MBTB21 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
17 Sobic.003G070400 expressed protein -
18 Sobic.008G024200 L11 domain containing ribosomal protein, putative, expressed K02867: RP-L11, MRPL11, large subunit ribosomal protein L11
19 Sobic.010G121700 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.009G110600 OsFBX422 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G058600 Sobic005G058600 Sobic003G133201 Sobic003G133201 Sobic005G058600--Sobic003G133201 Sobic007G031200 Sobic007G031200 Sobic005G058600--Sobic007G031200 Sobic004G050900 Sobic004G050900 Sobic005G058600--Sobic004G050900 Sobic008G169101 Sobic008G169101 Sobic005G058600--Sobic008G169101 Sobic003G191200 Sobic003G191200 Sobic005G058600--Sobic003G191200 Sobic009G110333 Sobic009G110333 Sobic005G058600--Sobic009G110333 Sobic002G402900 Sobic002G402900 Sobic005G058600--Sobic002G402900 Sobic005G077001 Sobic005G077001 Sobic005G058600--Sobic005G077001 Sobic005G000900 Sobic005G000900 Sobic005G058600--Sobic005G000900 Sobic003G133201--Sobic004G050900 Sobic003G133201--Sobic005G058600 Sobic003G133201--Sobic009G110333 Sobic009G182100 Sobic009G182100 Sobic003G133201--Sobic009G182100 Sobic003G133201--Sobic005G000900 Sobic002G266500 Sobic002G266500 Sobic003G133201--Sobic002G266500 Sobic009G047100 Sobic009G047100 Sobic003G133201--Sobic009G047100 Sobic003G133201--Sobic007G031200 Sobic006G017700 Sobic006G017700 Sobic003G133201--Sobic006G017700 Sobic007G031200--Sobic003G191200 Sobic004G100300 Sobic004G100300 Sobic007G031200--Sobic004G100300 Sobic002G182701 Sobic002G182701 Sobic007G031200--Sobic002G182701 Sobic007G031200--Sobic005G000900 Sobic007G082100 Sobic007G082100 Sobic007G031200--Sobic007G082100 Sobic007G031200--Sobic009G182100 Sobic006G017900 Sobic006G017900 Sobic007G031200--Sobic006G017900 Sobic001G211700 Sobic001G211700 Sobic007G031200--Sobic001G211700 Sobic007G031200--Sobic006G017700 Sobic004G050900--Sobic005G000900 Sobic004G050900--Sobic009G047100 Sobic005G140900 Sobic005G140900 Sobic004G050900--Sobic005G140900 Sobic002G156400 Sobic002G156400 Sobic004G050900--Sobic002G156400 Sobic004G050900--Sobic009G182100 Sobic004G050900--Sobic006G017700 Sobic008G138400 Sobic008G138400 Sobic004G050900--Sobic008G138400 Sobic002G097300 Sobic002G097300 Sobic004G050900--Sobic002G097300 Sobic008G024200 Sobic008G024200 Sobic004G050900--Sobic008G024200 Sobic005G191300 Sobic005G191300 Sobic008G169101--Sobic005G191300 Sobic008G169101--Sobic002G402900 Sobic007G042800 Sobic007G042800 Sobic008G169101--Sobic007G042800 Sobic001G525600 Sobic001G525600 Sobic008G169101--Sobic001G525600 Sobic007G197000 Sobic007G197000 Sobic008G169101--Sobic007G197000 Sobic001G092500 Sobic001G092500 Sobic008G169101--Sobic001G092500 Sobic009G110700 Sobic009G110700 Sobic008G169101--Sobic009G110700 Sobic003G420500 Sobic003G420500 Sobic008G169101--Sobic003G420500 Sobic005G037700 Sobic005G037700 Sobic008G169101--Sobic005G037700 Sobic003G191200--Sobic007G082100 Sobic003G191200--Sobic007G031200 Sobic004G046700 Sobic004G046700 Sobic003G191200--Sobic004G046700 Sobic010G123800 Sobic010G123800 Sobic003G191200--Sobic010G123800 Sobic007G081800 Sobic007G081800 Sobic003G191200--Sobic007G081800 Sobic005G058300 Sobic005G058300 Sobic003G191200--Sobic005G058300 Sobic003G191200--Sobic006G017900 Sobic003G191200--Sobic004G100300 Sobic003G191200--Sobic001G211700 Sobic005G112500 Sobic005G112500 Sobic009G110333--Sobic005G112500 Sobic004G258000 Sobic004G258000 Sobic009G110333--Sobic004G258000 Sobic009G110333--Sobic002G266500 Sobic006G276801 Sobic006G276801 Sobic009G110333--Sobic006G276801 Sobic002G011300 Sobic002G011300 Sobic009G110333--Sobic002G011300 Sobic009G110333--Sobic003G133201 Sobic009G110333--Sobic004G050900 Sobic009G110333--Sobic009G110700 Sobic009G110333--Sobic008G169101 Sobic002G402900--Sobic008G169101 Sobic001G529800 Sobic001G529800 Sobic002G402900--Sobic001G529800 Sobic001G435300 Sobic001G435300 Sobic002G402900--Sobic001G435300 Sobic002G402900--Sobic005G191300 Sobic002G402900--Sobic007G042800 Sobic002G402900--Sobic001G525600 Sobic002G402900--Sobic005G058600 Sobic002G223650 Sobic002G223650 Sobic002G402900--Sobic002G223650 Sobic002G402900--Sobic007G197000 Sobic005G077001--Sobic009G110333 Sobic005G201501 Sobic005G201501 Sobic005G077001--Sobic005G201501 Sobic005G077001--Sobic005G058600 Sobic005G077001--Sobic004G258000 Sobic005G077001--Sobic003G133201 Sobic005G077001--Sobic002G266500 Sobic005G077001--Sobic006G276801 Sobic001G325850 Sobic001G325850 Sobic005G077001--Sobic001G325850 Sobic005G077001--Sobic005G112500 Sobic005G000900--Sobic006G017700 Sobic005G000900--Sobic002G182701 Sobic005G000900--Sobic006G017900 Sobic005G000900--Sobic002G156400 Sobic002G384900 Sobic002G384900 Sobic005G000900--Sobic002G384900 Sobic005G000900--Sobic001G211700 Sobic005G000900--Sobic009G182100 Sobic005G000900--Sobic005G140900 Sobic005G000900--Sobic004G100300
Octagon: transcription factors


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