Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G133201.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VX50
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G050900 OsFBX248 - F-box domain containing protein, expressed -
2 Sobic.005G058600 csAtPR5, putative, expressed -
3 Sobic.009G110333 - -
4 Sobic.009G182100 cysteine proteinase inhibitor precursor protein, putative, expressed -
5 Sobic.005G000900 OsFBX103 - F-box domain containing protein, expressed -
6 Sobic.002G266500 - -
7 Sobic.009G047100 GEX1, putative, expressed -
8 Sobic.007G031200 - -
9 Sobic.006G017700 expressed protein -
10 Sobic.009G110600 OsFBX422 - F-box domain containing protein, expressed -
11 Sobic.002G182701 - -
12 Sobic.005G112500 - -
13 Sobic.005G140900 OsFBX230 - F-box domain containing protein, expressed -
14 Sobic.002G384900 expressed protein -
15 Sobic.006G017900 DEFL55 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
16 Sobic.001G211700 MBTB33 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
17 Sobic.002G156400 "domain confirmed by Pfam database, expression supported by NCBI EST database, expressed in leaf, flower, stem and root, expression induced by IAA, BR and ABA treatments"(PubMedID : 20528920)@MDR-like ABC transporter, putative, expressed K05658: ABCB1, ATP-binding cassette, subfamily B (MDR/TAP), member 1
18 Sobic.008G036100 expressed protein -
19 Sobic.008G024200 L11 domain containing ribosomal protein, putative, expressed K02867: RP-L11, MRPL11, large subunit ribosomal protein L11
20 Sobic.005G077001 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G133201 Sobic003G133201 Sobic004G050900 Sobic004G050900 Sobic003G133201--Sobic004G050900 Sobic005G058600 Sobic005G058600 Sobic003G133201--Sobic005G058600 Sobic009G110333 Sobic009G110333 Sobic003G133201--Sobic009G110333 Sobic009G182100 Sobic009G182100 Sobic003G133201--Sobic009G182100 Sobic005G000900 Sobic005G000900 Sobic003G133201--Sobic005G000900 Sobic002G266500 Sobic002G266500 Sobic003G133201--Sobic002G266500 Sobic009G047100 Sobic009G047100 Sobic003G133201--Sobic009G047100 Sobic007G031200 Sobic007G031200 Sobic003G133201--Sobic007G031200 Sobic006G017700 Sobic006G017700 Sobic003G133201--Sobic006G017700 Sobic004G050900--Sobic005G000900 Sobic004G050900--Sobic009G047100 Sobic005G140900 Sobic005G140900 Sobic004G050900--Sobic005G140900 Sobic002G156400 Sobic002G156400 Sobic004G050900--Sobic002G156400 Sobic004G050900--Sobic009G182100 Sobic004G050900--Sobic006G017700 Sobic008G138400 Sobic008G138400 Sobic004G050900--Sobic008G138400 Sobic002G097300 Sobic002G097300 Sobic004G050900--Sobic002G097300 Sobic008G024200 Sobic008G024200 Sobic004G050900--Sobic008G024200 Sobic005G058600--Sobic003G133201 Sobic005G058600--Sobic007G031200 Sobic005G058600--Sobic004G050900 Sobic008G169101 Sobic008G169101 Sobic005G058600--Sobic008G169101 Sobic003G191200 Sobic003G191200 Sobic005G058600--Sobic003G191200 Sobic005G058600--Sobic009G110333 Sobic002G402900 Sobic002G402900 Sobic005G058600--Sobic002G402900 Sobic005G077001 Sobic005G077001 Sobic005G058600--Sobic005G077001 Sobic005G058600--Sobic005G000900 Sobic005G112500 Sobic005G112500 Sobic009G110333--Sobic005G112500 Sobic004G258000 Sobic004G258000 Sobic009G110333--Sobic004G258000 Sobic009G110333--Sobic002G266500 Sobic006G276801 Sobic006G276801 Sobic009G110333--Sobic006G276801 Sobic002G011300 Sobic002G011300 Sobic009G110333--Sobic002G011300 Sobic009G110333--Sobic003G133201 Sobic009G110333--Sobic004G050900 Sobic009G110700 Sobic009G110700 Sobic009G110333--Sobic009G110700 Sobic009G110333--Sobic008G169101 Sobic002G182701 Sobic002G182701 Sobic009G182100--Sobic002G182701 Sobic009G182100--Sobic006G017700 Sobic009G182100--Sobic005G000900 Sobic006G017900 Sobic006G017900 Sobic009G182100--Sobic006G017900 Sobic009G182100--Sobic002G156400 Sobic001G211700 Sobic001G211700 Sobic009G182100--Sobic001G211700 Sobic009G182100--Sobic005G140900 Sobic002G384900 Sobic002G384900 Sobic009G182100--Sobic002G384900 Sobic009G182100--Sobic008G138400 Sobic005G000900--Sobic006G017700 Sobic005G000900--Sobic002G182701 Sobic005G000900--Sobic006G017900 Sobic005G000900--Sobic002G156400 Sobic005G000900--Sobic002G384900 Sobic005G000900--Sobic001G211700 Sobic005G000900--Sobic009G182100 Sobic005G000900--Sobic005G140900 Sobic004G100300 Sobic004G100300 Sobic005G000900--Sobic004G100300 Sobic002G266500--Sobic009G110333 Sobic002G266500--Sobic002G011300 Sobic002G266500--Sobic005G112500 Sobic002G266500--Sobic004G258000 Sobic002G266500--Sobic006G276801 Sobic002G266500--Sobic004G050900 Sobic002G266500--Sobic003G133201 Sobic002G266500--Sobic009G110700 Sobic002G266500--Sobic008G169101 Sobic009G047100--Sobic008G024200 Sobic002G006200 Sobic002G006200 Sobic009G047100--Sobic002G006200 Sobic009G234900 Sobic009G234900 Sobic009G047100--Sobic009G234900 Sobic005G189100 Sobic005G189100 Sobic009G047100--Sobic005G189100 Sobic001G089300 Sobic001G089300 Sobic009G047100--Sobic001G089300 Sobic010G121700 Sobic010G121700 Sobic009G047100--Sobic010G121700 Sobic009G047100--Sobic008G138400 Sobic009G047100--Sobic002G097300 Sobic001G143700 Sobic001G143700 Sobic009G047100--Sobic001G143700 Sobic007G031200--Sobic003G191200 Sobic007G031200--Sobic004G100300 Sobic007G031200--Sobic002G182701 Sobic007G031200--Sobic005G000900 Sobic007G082100 Sobic007G082100 Sobic007G031200--Sobic007G082100 Sobic007G031200--Sobic009G182100 Sobic007G031200--Sobic006G017900 Sobic007G031200--Sobic001G211700 Sobic007G031200--Sobic006G017700 Sobic006G017700--Sobic002G182701 Sobic006G017700--Sobic006G017900 Sobic006G017700--Sobic001G211700 Sobic006G017700--Sobic002G384900 Sobic006G017700--Sobic005G000900 Sobic006G017700--Sobic005G140900 Sobic006G017700--Sobic002G156400 Sobic006G017700--Sobic009G182100 Sobic006G017700--Sobic008G138400
Octagon: transcription factors


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