Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G169101.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R765
Pfam -
Panther DB PTHR31264 PTHR31264:SF8
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g17530.1 : OsFBX321 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G191300 MBTB64 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
2 Sobic.002G402900 expressed protein -
3 Sobic.007G042800 expressed protein -
4 Sobic.001G525600 fringe-related protein, putative, expressed -
5 Sobic.007G197000 "Candidate orthologue to the wheat Pm40 gene, probable glucan endo-1,3-betaglucosidase A6"(PubMedID : 27755575)@glucan endo-1,3-beta-glucosidase precursor, putative, expressed -
6 Sobic.001G092500 protein kinase domain containing protein, expressed -
7 Sobic.009G110700 OsFBL58 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
8 Sobic.003G420500 Ca ATPase 3(PubMedID : 22196357)@calcium-transporting ATPase, plasma membrane-type, putative, expressed K01537: P-type Ca2+ transporter type 2C
9 Sobic.005G037700 OsFBX378 - F-box domain containing protein, expressed -
10 Sobic.004G192600 LTPL85 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
11 Sobic.003G004000 - -
12 Sobic.008G024200 L11 domain containing ribosomal protein, putative, expressed K02867: RP-L11, MRPL11, large subunit ribosomal protein L11
13 Sobic.008G043200 - -
14 Sobic.010G016200 expressed protein -
15 Sobic.001G089400 ammonium transporter protein, putative, expressed K03320: amt, AMT, ammonium transporter, Amt family
16 Sobic.001G529800 phospholipase D, putative, expressed K01115: phospholipase D1/2
17 Sobic.009G047100 GEX1, putative, expressed -
18 Sobic.005G145400 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.004G099200 kinesin motor domain containing protein, expressed K10406: kinesin family member C2/C3
20 Sobic.007G204200 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant


Gene co-expression network
sample Sobic008G169101 Sobic008G169101 Sobic005G191300 Sobic005G191300 Sobic008G169101--Sobic005G191300 Sobic002G402900 Sobic002G402900 Sobic008G169101--Sobic002G402900 Sobic007G042800 Sobic007G042800 Sobic008G169101--Sobic007G042800 Sobic001G525600 Sobic001G525600 Sobic008G169101--Sobic001G525600 Sobic007G197000 Sobic007G197000 Sobic008G169101--Sobic007G197000 Sobic001G092500 Sobic001G092500 Sobic008G169101--Sobic001G092500 Sobic009G110700 Sobic009G110700 Sobic008G169101--Sobic009G110700 Sobic003G420500 Sobic003G420500 Sobic008G169101--Sobic003G420500 Sobic005G037700 Sobic005G037700 Sobic008G169101--Sobic005G037700 Sobic005G191300--Sobic001G092500 Sobic005G191300--Sobic007G042800 Sobic008G043300 Sobic008G043300 Sobic005G191300--Sobic008G043300 Sobic005G204600 Sobic005G204600 Sobic005G191300--Sobic005G204600 Sobic010G040400 Sobic010G040400 Sobic005G191300--Sobic010G040400 Sobic010G016200 Sobic010G016200 Sobic005G191300--Sobic010G016200 Sobic010G276100 Sobic010G276100 Sobic005G191300--Sobic010G276100 Sobic005G191300--Sobic009G110700 Sobic008G043200 Sobic008G043200 Sobic005G191300--Sobic008G043200 Sobic002G402900--Sobic008G169101 Sobic001G529800 Sobic001G529800 Sobic002G402900--Sobic001G529800 Sobic001G435300 Sobic001G435300 Sobic002G402900--Sobic001G435300 Sobic002G402900--Sobic005G191300 Sobic002G402900--Sobic007G042800 Sobic002G402900--Sobic001G525600 Sobic005G058600 Sobic005G058600 Sobic002G402900--Sobic005G058600 Sobic002G223650 Sobic002G223650 Sobic002G402900--Sobic002G223650 Sobic002G402900--Sobic007G197000 Sobic007G042800--Sobic005G191300 Sobic007G042800--Sobic001G092500 Sobic007G042800--Sobic008G043300 Sobic007G042800--Sobic005G204600 Sobic004G134000 Sobic004G134000 Sobic007G042800--Sobic004G134000 Sobic009G075400 Sobic009G075400 Sobic007G042800--Sobic009G075400 Sobic007G042800--Sobic010G040400 Sobic007G042800--Sobic010G276100 Sobic001G109900 Sobic001G109900 Sobic007G042800--Sobic001G109900 Sobic004G099200 Sobic004G099200 Sobic001G525600--Sobic004G099200 Sobic001G135950 Sobic001G135950 Sobic001G525600--Sobic001G135950 Sobic005G145400 Sobic005G145400 Sobic001G525600--Sobic005G145400 Sobic003G313200 Sobic003G313200 Sobic001G525600--Sobic003G313200 Sobic001G525600--Sobic003G420500 Sobic004G071900 Sobic004G071900 Sobic001G525600--Sobic004G071900 Sobic002G279900 Sobic002G279900 Sobic001G525600--Sobic002G279900 Sobic002G125100 Sobic002G125100 Sobic001G525600--Sobic002G125100 Sobic006G215500 Sobic006G215500 Sobic001G525600--Sobic006G215500 Sobic007G197000--Sobic005G037700 Sobic007G197000--Sobic003G420500 Sobic004G192600 Sobic004G192600 Sobic007G197000--Sobic004G192600 Sobic001G089400 Sobic001G089400 Sobic007G197000--Sobic001G089400 Sobic003G004000 Sobic003G004000 Sobic007G197000--Sobic003G004000 Sobic007G197000--Sobic008G043200 Sobic007G204200 Sobic007G204200 Sobic007G197000--Sobic007G204200 Sobic007G197000--Sobic005G145400 Sobic007G197000--Sobic001G525600 Sobic001G092500--Sobic010G040400 Sobic001G092500--Sobic010G276100 Sobic001G092500--Sobic005G191300 Sobic009G175400 Sobic009G175400 Sobic001G092500--Sobic009G175400 Sobic001G092500--Sobic008G043200 Sobic001G092500--Sobic010G016200 Sobic001G092500--Sobic008G043300 Sobic001G332000 Sobic001G332000 Sobic001G092500--Sobic001G332000 Sobic001G092500--Sobic005G145400 Sobic003G245300 Sobic003G245300 Sobic009G110700--Sobic003G245300 Sobic007G122600 Sobic007G122600 Sobic009G110700--Sobic007G122600 Sobic008G024200 Sobic008G024200 Sobic009G110700--Sobic008G024200 Sobic009G047100 Sobic009G047100 Sobic009G110700--Sobic009G047100 Sobic005G006100 Sobic005G006100 Sobic009G110700--Sobic005G006100 Sobic001G167300 Sobic001G167300 Sobic009G110700--Sobic001G167300 Sobic010G216100 Sobic010G216100 Sobic009G110700--Sobic010G216100 Sobic010G207800 Sobic010G207800 Sobic009G110700--Sobic010G207800 Sobic001G192300 Sobic001G192300 Sobic009G110700--Sobic001G192300 Sobic003G420500--Sobic005G145400 Sobic003G420500--Sobic005G037700 Sobic003G420500--Sobic008G043200 Sobic003G420500--Sobic001G525600 Sobic003G420500--Sobic001G089400 Sobic003G420500--Sobic004G192600 Sobic003G420500--Sobic004G099200 Sobic003G420500--Sobic010G016200 Sobic003G420500--Sobic007G197000 Sobic005G037700--Sobic003G420500 Sobic005G037700--Sobic001G089400 Sobic005G037700--Sobic004G192600 Sobic005G037700--Sobic005G145400 Sobic005G037700--Sobic007G204200 Sobic005G037700--Sobic007G197000 Sobic005G037700--Sobic003G004000 Sobic005G037700--Sobic008G043200 Sobic005G037700--Sobic001G525600
Octagon: transcription factors


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