Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G042800.1
Synonym Sb07g003530
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YGW9
Pfam PF04654
Panther DB PTHR31168 PTHR31168:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G24600 : Protein of unknown function, DUF599
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g19060.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a030110 , Zm00025a055188
Brachypodium KQJ95396 , KQJ95402
Barley HORVU7Hr1G071830.1 , HORVU7Hr1G071820.1 , HORVU2Hr1G099000.1
Wheat TraesCS7D02G298300 , TraesCS7B02G203200
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G191300 MBTB64 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
2 Sobic.001G092500 protein kinase domain containing protein, expressed -
3 Sobic.008G043300 - -
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9 Sobic.001G109900 expressed protein -
10 Sobic.008G053750 - -
11 Sobic.002G197900 - -
12 Sobic.008G134600 - -
13 Sobic.008G169101 - -
14 Sobic.001G525600 fringe-related protein, putative, expressed -
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19 Sobic.006G236400 glutaredoxin, putative, expressed -
20 Sobic.007G057600 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G042800 Sobic007G042800 Sobic005G191300 Sobic005G191300 Sobic007G042800--Sobic005G191300 Sobic001G092500 Sobic001G092500 Sobic007G042800--Sobic001G092500 Sobic008G043300 Sobic008G043300 Sobic007G042800--Sobic008G043300 Sobic005G204600 Sobic005G204600 Sobic007G042800--Sobic005G204600 Sobic004G134000 Sobic004G134000 Sobic007G042800--Sobic004G134000 Sobic009G075400 Sobic009G075400 Sobic007G042800--Sobic009G075400 Sobic010G040400 Sobic010G040400 Sobic007G042800--Sobic010G040400 Sobic010G276100 Sobic010G276100 Sobic007G042800--Sobic010G276100 Sobic001G109900 Sobic001G109900 Sobic007G042800--Sobic001G109900 Sobic005G191300--Sobic001G092500 Sobic005G191300--Sobic007G042800 Sobic005G191300--Sobic008G043300 Sobic005G191300--Sobic005G204600 Sobic005G191300--Sobic010G040400 Sobic010G016200 Sobic010G016200 Sobic005G191300--Sobic010G016200 Sobic005G191300--Sobic010G276100 Sobic009G110700 Sobic009G110700 Sobic005G191300--Sobic009G110700 Sobic008G043200 Sobic008G043200 Sobic005G191300--Sobic008G043200 Sobic001G092500--Sobic010G040400 Sobic001G092500--Sobic010G276100 Sobic001G092500--Sobic005G191300 Sobic009G175400 Sobic009G175400 Sobic001G092500--Sobic009G175400 Sobic001G092500--Sobic008G043200 Sobic001G092500--Sobic010G016200 Sobic001G092500--Sobic008G043300 Sobic001G332000 Sobic001G332000 Sobic001G092500--Sobic001G332000 Sobic005G145400 Sobic005G145400 Sobic001G092500--Sobic005G145400 Sobic008G043300--Sobic009G075400 Sobic008G053750 Sobic008G053750 Sobic008G043300--Sobic008G053750 Sobic003G335200 Sobic003G335200 Sobic008G043300--Sobic003G335200 Sobic008G043300--Sobic004G134000 Sobic001G288400 Sobic001G288400 Sobic008G043300--Sobic001G288400 Sobic001G093100 Sobic001G093100 Sobic008G043300--Sobic001G093100 Sobic004G002800 Sobic004G002800 Sobic008G043300--Sobic004G002800 Sobic009G082900 Sobic009G082900 Sobic008G043300--Sobic009G082900 Sobic001G024900 Sobic001G024900 Sobic008G043300--Sobic001G024900 Sobic005G204600--Sobic008G043300 Sobic005G204600--Sobic001G092500 Sobic001G287400 Sobic001G287400 Sobic005G204600--Sobic001G287400 Sobic007G145500 Sobic007G145500 Sobic005G204600--Sobic007G145500 Sobic005G204600--Sobic008G053750 Sobic005G040700 Sobic005G040700 Sobic005G204600--Sobic005G040700 Sobic007G131000 Sobic007G131000 Sobic005G204600--Sobic007G131000 Sobic001G171300 Sobic001G171300 Sobic005G204600--Sobic001G171300 Sobic001G130500 Sobic001G130500 Sobic005G204600--Sobic001G130500 Sobic004G134000--Sobic009G075400 Sobic004G134000--Sobic003G335200 Sobic004G134000--Sobic004G002800 Sobic007G175800 Sobic007G175800 Sobic004G134000--Sobic007G175800 Sobic004G134000--Sobic008G043300 Sobic004G134000--Sobic009G082900 Sobic001G252900 Sobic001G252900 Sobic004G134000--Sobic001G252900 Sobic005G025600 Sobic005G025600 Sobic004G134000--Sobic005G025600 Sobic007G057600 Sobic007G057600 Sobic004G134000--Sobic007G057600 Sobic009G075400--Sobic003G335200 Sobic009G075400--Sobic004G002800 Sobic009G075400--Sobic008G043300 Sobic009G075400--Sobic008G053750 Sobic006G159000 Sobic006G159000 Sobic009G075400--Sobic006G159000 Sobic009G075400--Sobic005G025600 Sobic009G075400--Sobic001G288400 Sobic009G075400--Sobic009G082900 Sobic005G023700 Sobic005G023700 Sobic009G075400--Sobic005G023700 Sobic010G040400--Sobic009G175400 Sobic010G040400--Sobic010G276100 Sobic010G144700 Sobic010G144700 Sobic010G040400--Sobic010G144700 Sobic010G040400--Sobic001G332000 Sobic010G040400--Sobic005G040700 Sobic010G040400--Sobic001G092500 Sobic010G040400--Sobic009G082900 Sobic010G051000 Sobic010G051000 Sobic010G040400--Sobic010G051000 Sobic010G040400--Sobic001G288400 Sobic010G276100--Sobic009G175400 Sobic010G276100--Sobic010G040400 Sobic010G276100--Sobic010G144700 Sobic010G276100--Sobic009G082900 Sobic010G276100--Sobic001G092500 Sobic006G259100 Sobic006G259100 Sobic010G276100--Sobic006G259100 Sobic010G276100--Sobic005G145400 Sobic010G276100--Sobic004G002800 Sobic010G276100--Sobic001G252900 Sobic001G109900--Sobic008G043300 Sobic001G109900--Sobic009G075400 Sobic001G109900--Sobic010G276100 Sobic001G109900--Sobic007G057600 Sobic001G109900--Sobic004G134000 Sobic002G197900 Sobic002G197900 Sobic001G109900--Sobic002G197900 Sobic001G109900--Sobic009G082900 Sobic001G109900--Sobic003G335200 Sobic001G109900--Sobic010G144700
Octagon: transcription factors


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