Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G134000.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YPE5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G075400 RALFL17 - Rapid ALkalinization Factor RALF family protein precursor, expressed -
2 Sobic.003G335200 monocopper oxidase, putative, expressed -
3 Sobic.004G002800 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
4 Sobic.007G175800 transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 family, putative, expressed -
5 Sobic.008G043300 - -
6 Sobic.009G082900 POEI21 - Pollen Ole e I allergen and extensin family protein precursor, expressed -
7 Sobic.001G252900 -(PubMedID : 26976818)@soluble inorganic pyrophosphatase, putative, expressed K01507: inorganic pyrophosphatase
8 Sobic.005G025600 plant invertase/pectin methylesterase inhibitor domain containing protein, expressed -
9 Sobic.007G057600 - -
10 Sobic.003G073540 - -
11 Sobic.005G023700 pollen allergen Cyn d 23, putative, expressed -
12 Sobic.006G159000 OsPLIM2b - LIM domain protein, putative actin-binding protein and transcription factor, expressed -
13 Sobic.001G288400 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
14 Sobic.001G093100 anthocyanin 3-O-beta-glucosyltransferase, putative, expressed -
15 Sobic.003G317600 NADH-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial precursor, putative, expressed K17871: NADH:ubiquinone reductase (non-electrogenic)
16 Sobic.010G144700 plant protein of unknown function domain containing protein, expressed -
17 Sobic.001G097000 WD-40 repeat family protein, putative, expressed -
18 Sobic.002G066300 expressed protein -
19 Sobic.006G263500 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.008G053750 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G134000 Sobic004G134000 Sobic009G075400 Sobic009G075400 Sobic004G134000--Sobic009G075400 Sobic003G335200 Sobic003G335200 Sobic004G134000--Sobic003G335200 Sobic004G002800 Sobic004G002800 Sobic004G134000--Sobic004G002800 Sobic007G175800 Sobic007G175800 Sobic004G134000--Sobic007G175800 Sobic008G043300 Sobic008G043300 Sobic004G134000--Sobic008G043300 Sobic009G082900 Sobic009G082900 Sobic004G134000--Sobic009G082900 Sobic001G252900 Sobic001G252900 Sobic004G134000--Sobic001G252900 Sobic005G025600 Sobic005G025600 Sobic004G134000--Sobic005G025600 Sobic007G057600 Sobic007G057600 Sobic004G134000--Sobic007G057600 Sobic009G075400--Sobic003G335200 Sobic009G075400--Sobic004G002800 Sobic009G075400--Sobic008G043300 Sobic008G053750 Sobic008G053750 Sobic009G075400--Sobic008G053750 Sobic006G159000 Sobic006G159000 Sobic009G075400--Sobic006G159000 Sobic009G075400--Sobic005G025600 Sobic001G288400 Sobic001G288400 Sobic009G075400--Sobic001G288400 Sobic009G075400--Sobic009G082900 Sobic005G023700 Sobic005G023700 Sobic009G075400--Sobic005G023700 Sobic003G335200--Sobic009G075400 Sobic003G335200--Sobic004G002800 Sobic003G335200--Sobic005G023700 Sobic003G335200--Sobic005G025600 Sobic006G263500 Sobic006G263500 Sobic003G335200--Sobic006G263500 Sobic003G335200--Sobic006G159000 Sobic002G066300 Sobic002G066300 Sobic003G335200--Sobic002G066300 Sobic010G006900 Sobic010G006900 Sobic003G335200--Sobic010G006900 Sobic003G335200--Sobic001G252900 Sobic004G002800--Sobic005G025600 Sobic004G002800--Sobic001G252900 Sobic004G002800--Sobic009G082900 Sobic004G002800--Sobic003G335200 Sobic004G002800--Sobic006G263500 Sobic004G002800--Sobic006G159000 Sobic004G002800--Sobic005G023700 Sobic004G002800--Sobic010G006900 Sobic003G073540 Sobic003G073540 Sobic004G002800--Sobic003G073540 Sobic007G175800--Sobic003G335200 Sobic001G348600 Sobic001G348600 Sobic007G175800--Sobic001G348600 Sobic007G222500 Sobic007G222500 Sobic007G175800--Sobic007G222500 Sobic007G175800--Sobic007G057600 Sobic001G228000 Sobic001G228000 Sobic007G175800--Sobic001G228000 Sobic003G317600 Sobic003G317600 Sobic007G175800--Sobic003G317600 Sobic007G175800--Sobic004G002800 Sobic007G175800--Sobic001G252900 Sobic002G197900 Sobic002G197900 Sobic007G175800--Sobic002G197900 Sobic008G043300--Sobic009G075400 Sobic008G043300--Sobic008G053750 Sobic008G043300--Sobic003G335200 Sobic008G043300--Sobic004G134000 Sobic008G043300--Sobic001G288400 Sobic001G093100 Sobic001G093100 Sobic008G043300--Sobic001G093100 Sobic008G043300--Sobic004G002800 Sobic008G043300--Sobic009G082900 Sobic001G024900 Sobic001G024900 Sobic008G043300--Sobic001G024900 Sobic009G082900--Sobic004G002800 Sobic010G144700 Sobic010G144700 Sobic009G082900--Sobic010G144700 Sobic009G082900--Sobic001G252900 Sobic009G082900--Sobic001G288400 Sobic009G082900--Sobic005G025600 Sobic009G082900--Sobic003G073540 Sobic009G082900--Sobic001G093100 Sobic009G082900--Sobic006G159000 Sobic009G082900--Sobic009G075400 Sobic001G252900--Sobic004G002800 Sobic001G252900--Sobic009G082900 Sobic001G252900--Sobic005G025600 Sobic001G252900--Sobic003G073540 Sobic001G252900--Sobic007G222500 Sobic001G252900--Sobic006G263500 Sobic001G252900--Sobic003G335200 Sobic001G252900--Sobic010G006900 Sobic001G528700 Sobic001G528700 Sobic001G252900--Sobic001G528700 Sobic005G025600--Sobic006G263500 Sobic005G025600--Sobic004G002800 Sobic005G025600--Sobic010G006900 Sobic005G025600--Sobic006G159000 Sobic005G025600--Sobic005G023700 Sobic005G025600--Sobic001G252900 Sobic005G025600--Sobic003G335200 Sobic008G028000 Sobic008G028000 Sobic005G025600--Sobic008G028000 Sobic008G027900 Sobic008G027900 Sobic005G025600--Sobic008G027900 Sobic007G057600--Sobic001G528700 Sobic007G057600--Sobic001G228000 Sobic007G057600--Sobic007G222500 Sobic004G024000 Sobic004G024000 Sobic007G057600--Sobic004G024000 Sobic007G057600--Sobic002G197900 Sobic007G057600--Sobic007G175800 Sobic004G166100 Sobic004G166100 Sobic007G057600--Sobic004G166100 Sobic007G057600--Sobic001G252900 Sobic001G002200 Sobic001G002200 Sobic007G057600--Sobic001G002200
Octagon: transcription factors


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